32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4127 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4127  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  402  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.878957 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4130  cytochrome c class I  50.35 
 
 		 350 aa  148  4e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3254  hypothetical protein  38.98 
 
 		 267 aa  95.9  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163146  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3996  hypothetical protein  37.12 
 
 		 256 aa  94.7  9e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000934888  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3997  hypothetical protein  32.82 
 
 		 265 aa  91.7  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000400018  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1082  hypothetical protein  36.44 
 
 		 266 aa  90.5  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15012e-18 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1084  hypothetical protein  36.43 
 
 		 277 aa  78.6  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.18348e-17 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2745  hypothetical protein  35.04 
 
 		 276 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000727433  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1575  cytochrome c family protein  42.25 
 
 		 479 aa  59.3  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2210  cytochrome c family protein  41.54 
 
 		 711 aa  57.8  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3135  hypothetical protein  33.8 
 
 		 717 aa  55.5  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2301  cytochrome c family protein  37.1 
 
 		 709 aa  54.7  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4131  hypothetical protein  37.18 
 
 		 160 aa  53.5  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4126  hypothetical protein  35.23 
 
 		 130 aa  52  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686077 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3655  hypothetical protein  40 
 
 		 254 aa  50.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1996  cytochrome c family protein  40 
 
 		 343 aa  50.4  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00379729  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2822  hypothetical protein  38.1 
 
 		 340 aa  50.1  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000171082  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0679  cytochrome c family protein  39.06 
 
 		 330 aa  49.3  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2930  cytochrome c family protein  38.36 
 
 		 329 aa  48.9  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000304572  decreased coverage  8.81711e-19 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0692  cytochrome c family protein  39.39 
 
 		 330 aa  47.8  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000351861 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0592  cytochrome c family protein  35.29 
 
 		 329 aa  47.8  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000257113  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1703  cytochrome c family protein  33.78 
 
 		 337 aa  46.6  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1900  hypothetical protein  35.94 
 
 		 340 aa  45.8  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.857082 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1385  hypothetical protein  38.16 
 
 		 181 aa  45.1  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.522055  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3348  hypothetical protein  40.3 
 
 		 126 aa  45.4  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000670369  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1102  cytochrome c family protein  40.91 
 
 		 252 aa  45.4  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000169196  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1315  hypothetical protein  34.43 
 
 		 335 aa  45.1  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000524828  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2323  hypothetical protein  32 
 
 		 340 aa  45.1  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000105852  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0729  hypothetical protein  36.76 
 
 		 102 aa  44.3  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000019285 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1150  hypothetical protein  34.92 
 
 		 100 aa  43.5  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00196806  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2048  cytochrome c family protein  36.67 
 
 		 340 aa  43.5  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.36956e-16  hitchhiker  0.000000028762 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0469  hypothetical protein  32.81 
 
 		 102 aa  42.4  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>