82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2210 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2210  cytochrome c family protein  100 
 
 
711 aa  1452    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3135  hypothetical protein  56.5 
 
 
717 aa  845    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2301  cytochrome c family protein  72.14 
 
 
709 aa  1065    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1575  cytochrome c family protein  41.22 
 
 
479 aa  333  7.000000000000001e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2822  hypothetical protein  40.76 
 
 
340 aa  256  9e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000171082  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0679  cytochrome c family protein  44.55 
 
 
330 aa  251  5e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2930  cytochrome c family protein  48.4 
 
 
329 aa  250  5e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000304572  decreased coverage  8.81711e-19 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1900  hypothetical protein  42.18 
 
 
340 aa  250  6e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.857082 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0592  cytochrome c family protein  46.62 
 
 
329 aa  248  3e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000257113  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2323  hypothetical protein  40.88 
 
 
340 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000105852  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0692  cytochrome c family protein  43.31 
 
 
330 aa  243  7e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000351861 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1996  cytochrome c family protein  40.62 
 
 
343 aa  231  5e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00379729  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1703  cytochrome c family protein  41.67 
 
 
337 aa  231  5e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2048  cytochrome c family protein  45.48 
 
 
340 aa  228  2e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.36956e-16  hitchhiker  0.000000028762 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1315  hypothetical protein  37.39 
 
 
335 aa  224  3e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000524828  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3655  hypothetical protein  43.08 
 
 
254 aa  196  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1102  cytochrome c family protein  41.18 
 
 
252 aa  183  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000169196  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1385  hypothetical protein  39.88 
 
 
181 aa  105  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.522055  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3996  hypothetical protein  29.82 
 
 
256 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000934888  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1542  cytochrome C family protein  25.14 
 
 
655 aa  79.7  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0724057 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1150  hypothetical protein  49.33 
 
 
100 aa  75.9  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00196806  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0469  hypothetical protein  50 
 
 
102 aa  73.2  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3049  cytochrome C family protein  23.08 
 
 
2081 aa  69.7  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1082  hypothetical protein  27.59 
 
 
266 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15012e-18 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1084  hypothetical protein  28.05 
 
 
277 aa  68.6  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.18348e-17 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3174  cytochrome C family protein  21.54 
 
 
1329 aa  62.8  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.246364  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2745  hypothetical protein  29.36 
 
 
276 aa  61.2  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000727433  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3077  multihaem cytochrome  23.08 
 
 
1330 aa  60.8  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3254  hypothetical protein  26.92 
 
 
267 aa  61.2  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163146  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3997  hypothetical protein  24.67 
 
 
265 aa  61.2  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000400018  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2720  hypothetical protein  27.79 
 
 
580 aa  60.1  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.44099 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4130  cytochrome c class I  38.16 
 
 
350 aa  60.5  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3348  hypothetical protein  42.68 
 
 
126 aa  58.5  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000670369  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4127  hypothetical protein  41.54 
 
 
199 aa  58.2  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.878957 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1959  hypothetical protein  44.59 
 
 
112 aa  57.4  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.563313  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1874  hypothetical protein  44.59 
 
 
112 aa  57  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2189  cytochrome c family protein  23.06 
 
 
600 aa  56.6  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2004  hypothetical protein  44.59 
 
 
112 aa  57  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1823  cytochrome C family protein  23.84 
 
 
1525 aa  57.4  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1803  hypothetical protein  46.58 
 
 
113 aa  57  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.20863  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0471  hypothetical protein  24.02 
 
 
790 aa  56.2  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0674457  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2767  hypothetical protein  41.43 
 
 
125 aa  55.5  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000252598  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3166  cytochrome C family protein  23.7 
 
 
650 aa  55.5  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0729  hypothetical protein  29.9 
 
 
102 aa  54.3  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000019285 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2666  hypothetical protein  23.34 
 
 
620 aa  53.9  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1433  hypothetical protein  42.65 
 
 
106 aa  53.5  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000304955  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0716  hypothetical protein  36.76 
 
 
102 aa  53.9  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.824406  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2645  hypothetical protein  22.79 
 
 
867 aa  52.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.519217  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1440  hypothetical protein  21.94 
 
 
413 aa  52.4  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00370181  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2851  hypothetical protein  23.51 
 
 
618 aa  52.4  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.581823  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3387  hypothetical protein  30.81 
 
 
219 aa  51.6  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3268  cytochrome C family protein  22 
 
 
1329 aa  51.2  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0845  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like protein  24.7 
 
 
757 aa  50.8  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.763615  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3068  cytochrome c family protein  23.55 
 
 
650 aa  50.8  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3392  hypothetical protein  25.41 
 
 
344 aa  50.4  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3475  hypothetical protein  25.41 
 
 
344 aa  50.4  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1146  hypothetical protein  23.32 
 
 
426 aa  50.4  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00972968  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2412  cytochrome c family protein  28.97 
 
 
215 aa  50.4  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163467  normal  0.409257 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3564  cytochrome C family protein  24.56 
 
 
955 aa  49.3  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4139  hypothetical protein  31.03 
 
 
220 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3539  hypothetical protein  27.37 
 
 
344 aa  49.3  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.974857  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0500  cytochrome C family protein  26.75 
 
 
1496 aa  49.3  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00446809  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2757  hypothetical protein  23.27 
 
 
621 aa  48.9  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1541  cytochrome c family protein  21.57 
 
 
656 aa  48.5  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0115719 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2887  cytochrome c family protein  23.8 
 
 
884 aa  48.1  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0141387  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3578  cytochrome c family protein  28.85 
 
 
458 aa  47.8  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.628183  normal  0.0456283 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5161  hypothetical protein  21.3 
 
 
794 aa  47.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3261  cytochrome C family protein  23.42 
 
 
656 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1462  hypothetical protein  29.66 
 
 
226 aa  47.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0873129  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1996  cytochrome C family protein  24.06 
 
 
427 aa  45.8  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0405741  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3457  hypothetical protein  23.12 
 
 
347 aa  46.2  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00434571 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6894  chaperone protein HtpG  26.32 
 
 
229 aa  45.4  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0215  chaperone protein HtpG  23.66 
 
 
219 aa  45.1  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.391907  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2495  cytochrome c family protein  22.93 
 
 
646 aa  45.1  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0451  hypothetical protein  23.08 
 
 
621 aa  45.1  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.235672 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0115  hypothetical protein  22.59 
 
 
309 aa  44.7  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0126  hypothetical protein  22.01 
 
 
309 aa  44.7  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1525  hypothetical protein  26.67 
 
 
220 aa  44.3  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.415046  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3470  cytochrome C family protein  23.41 
 
 
958 aa  44.3  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3982  cytochrome c family protein  25.24 
 
 
253 aa  43.9  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0600  PKD  23.27 
 
 
712 aa  43.9  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000134554  normal  0.252595 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3546  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  42.62 
 
 
326 aa  43.9  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00250454  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>