38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1084 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1084  hypothetical protein  100 
 
 		 277 aa  583  1e-166  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.18348e-17 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2745  hypothetical protein  61.45 
 
 		 276 aa  331  7.000000000000001e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000727433  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3996  hypothetical protein  42.46 
 
 		 256 aa  207  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000934888  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3997  hypothetical protein  34.22 
 
 		 265 aa  167  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000400018  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3254  hypothetical protein  35.62 
 
 		 267 aa  161  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163146  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1082  hypothetical protein  33.21 
 
 		 266 aa  146  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15012e-18 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4131  hypothetical protein  44.09 
 
 		 160 aa  89.7  5e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4126  hypothetical protein  49.41 
 
 		 130 aa  87.4  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686077 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4127  hypothetical protein  36.43 
 
 		 199 aa  77.8  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.878957 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4130  cytochrome c class I  34.13 
 
 		 350 aa  76.6  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1996  cytochrome c family protein  28.63 
 
 		 343 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00379729  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1900  hypothetical protein  28.85 
 
 		 340 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.857082 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2210  cytochrome c family protein  28.05 
 
 		 711 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2323  hypothetical protein  28.45 
 
 		 340 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000105852  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3135  hypothetical protein  27.5 
 
 		 717 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2930  cytochrome c family protein  29.34 
 
 		 329 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000304572  decreased coverage  8.81711e-19 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2301  cytochrome c family protein  29.05 
 
 		 709 aa  67  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2822  hypothetical protein  25.39 
 
 		 340 aa  65.5  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000171082  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2048  cytochrome c family protein  27.8 
 
 		 340 aa  64.7  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.36956e-16  hitchhiker  0.000000028762 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1575  cytochrome c family protein  25.59 
 
 		 479 aa  61.6  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0592  cytochrome c family protein  27.39 
 
 		 329 aa  60.8  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000257113  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0679  cytochrome c family protein  26.05 
 
 		 330 aa  60.1  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0692  cytochrome c family protein  25.32 
 
 		 330 aa  58.2  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000351861 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1315  hypothetical protein  27 
 
 		 335 aa  56.2  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000524828  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1102  cytochrome c family protein  38.55 
 
 		 252 aa  53.9  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000169196  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3655  hypothetical protein  26.86 
 
 		 254 aa  53.1  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1433  hypothetical protein  35.37 
 
 		 106 aa  51.6  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000304955  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1385  hypothetical protein  24.77 
 
 		 181 aa  51.6  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.522055  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1703  cytochrome c family protein  24.65 
 
 		 337 aa  52  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1803  hypothetical protein  37.21 
 
 		 113 aa  49.7  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.20863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2004  hypothetical protein  41.33 
 
 		 112 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1959  hypothetical protein  40 
 
 		 112 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.563313  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0729  hypothetical protein  34.25 
 
 		 102 aa  47.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000019285 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1874  hypothetical protein  40 
 
 		 112 aa  45.4  0.0009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0716  hypothetical protein  32.88 
 
 		 102 aa  45.4  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.824406  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1150  hypothetical protein  42.65 
 
 		 100 aa  45.4  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00196806  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0469  hypothetical protein  36.78 
 
 		 102 aa  45.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2767  hypothetical protein  37.33 
 
 		 125 aa  44.3  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000252598  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>