47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1102 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1102  cytochrome c family protein  100 
 
 		 252 aa  526  1e-148  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000169196  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0592  cytochrome c family protein  47.11 
 
 		 329 aa  230  2e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000257113  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2930  cytochrome c family protein  47.93 
 
 		 329 aa  223  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000304572  decreased coverage  8.81711e-19 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1575  cytochrome c family protein  41.73 
 
 		 479 aa  214  9.999999999999999e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3655  hypothetical protein  44.49 
 
 		 254 aa  212  4.9999999999999996e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3135  hypothetical protein  45.81 
 
 		 717 aa  206  4e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0679  cytochrome c family protein  43.58 
 
 		 330 aa  203  3e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0692  cytochrome c family protein  43.58 
 
 		 330 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000351861 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1703  cytochrome c family protein  44.31 
 
 		 337 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1900  hypothetical protein  47.03 
 
 		 340 aa  188  7e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.857082 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2323  hypothetical protein  45.76 
 
 		 340 aa  186  4e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000105852  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2048  cytochrome c family protein  43.83 
 
 		 340 aa  185  6e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.36956e-16  hitchhiker  0.000000028762 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2822  hypothetical protein  43.64 
 
 		 340 aa  185  6e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000171082  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2210  cytochrome c family protein  41.18 
 
 		 711 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1996  cytochrome c family protein  42.55 
 
 		 343 aa  178  5.999999999999999e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00379729  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2301  cytochrome c family protein  42.8 
 
 		 709 aa  177  1e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1315  hypothetical protein  43.36 
 
 		 335 aa  166  5e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000524828  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1385  hypothetical protein  37.5 
 
 		 181 aa  100  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.522055  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1150  hypothetical protein  47.69 
 
 		 100 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00196806  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0469  hypothetical protein  41.75 
 
 		 102 aa  64.7  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2745  hypothetical protein  28.36 
 
 		 276 aa  57  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000727433  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1874  hypothetical protein  46.48 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1959  hypothetical protein  42.25 
 
 		 112 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.563313  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1084  hypothetical protein  38.55 
 
 		 277 aa  53.9  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.18348e-17 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1803  hypothetical protein  41.67 
 
 		 113 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.20863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2004  hypothetical protein  43.66 
 
 		 112 aa  52.8  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0716  hypothetical protein  36.92 
 
 		 102 aa  53.1  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.824406  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0729  hypothetical protein  36.92 
 
 		 102 aa  52  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000019285 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2767  hypothetical protein  36.23 
 
 		 125 aa  51.6  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000252598  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3996  hypothetical protein  36.25 
 
 		 256 aa  51.6  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000934888  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1433  hypothetical protein  38.81 
 
 		 106 aa  50.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000304955  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3997  hypothetical protein  37.88 
 
 		 265 aa  49.3  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000400018  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3254  hypothetical protein  34.62 
 
 		 267 aa  49.7  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163146  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3348  hypothetical protein  41.77 
 
 		 126 aa  48.5  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000670369  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4130  cytochrome c class I  35.14 
 
 		 350 aa  48.5  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1082  hypothetical protein  33.33 
 
 		 266 aa  48.1  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15012e-18 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4131  hypothetical protein  35.38 
 
 		 160 aa  46.2  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4127  hypothetical protein  40.91 
 
 		 199 aa  45.8  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.878957 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3068  cytochrome c family protein  27.43 
 
 		 650 aa  45.4  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2427  multihaem cytochrome  25 
 
 		 280 aa  44.3  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000206964  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3261  cytochrome C family protein  25.87 
 
 		 656 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4126  hypothetical protein  37.5 
 
 		 130 aa  44.3  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686077 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2063  hypothetical protein  27.31 
 
 		 615 aa  43.5  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.97808  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0182  formate-dependent nitrite reductase  25.15 
 
 		 153 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1440  hypothetical protein  26.92 
 
 		 413 aa  43.1  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00370181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3166  cytochrome C family protein  26.46 
 
 		 650 aa  42.4  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2603  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like protein  27.34 
 
 		 729 aa  42  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.18944  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>