32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3254 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3254  hypothetical protein  100 
 
 		 267 aa  559  1e-158  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163146  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3997  hypothetical protein  62.26 
 
 		 265 aa  360  1e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000400018  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1082  hypothetical protein  52.29 
 
 		 266 aa  323  1e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15012e-18 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3996  hypothetical protein  38.3 
 
 		 256 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000934888  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2745  hypothetical protein  39.66 
 
 		 276 aa  170  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000727433  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1084  hypothetical protein  35.62 
 
 		 277 aa  161  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.18348e-17 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4127  hypothetical protein  38.98 
 
 		 199 aa  95.9  6e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.878957 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4130  cytochrome c class I  38.14 
 
 		 350 aa  83.2  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4131  hypothetical protein  39.74 
 
 		 160 aa  75.5  0.0000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4126  hypothetical protein  42.42 
 
 		 130 aa  70.5  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686077 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1575  cytochrome c family protein  27.5 
 
 		 479 aa  70.1  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1996  cytochrome c family protein  25 
 
 		 343 aa  62.8  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00379729  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2210  cytochrome c family protein  26.92 
 
 		 711 aa  61.2  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2822  hypothetical protein  27.57 
 
 		 340 aa  60.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000171082  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2048  cytochrome c family protein  27.57 
 
 		 340 aa  60.1  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.36956e-16  hitchhiker  0.000000028762 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2301  cytochrome c family protein  26.34 
 
 		 709 aa  60.1  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2930  cytochrome c family protein  41.18 
 
 		 329 aa  59.7  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000304572  decreased coverage  8.81711e-19 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1703  cytochrome c family protein  23.89 
 
 		 337 aa  58.9  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3135  hypothetical protein  24.16 
 
 		 717 aa  56.6  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0592  cytochrome c family protein  34.29 
 
 		 329 aa  55.5  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000257113  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1315  hypothetical protein  27.38 
 
 		 335 aa  52  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000524828  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0692  cytochrome c family protein  26.03 
 
 		 330 aa  51.6  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000351861 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1433  hypothetical protein  34.95 
 
 		 106 aa  50.8  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000304955  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0679  cytochrome c family protein  25.51 
 
 		 330 aa  50.4  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2323  hypothetical protein  32.14 
 
 		 340 aa  50.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000105852  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3655  hypothetical protein  26.72 
 
 		 254 aa  49.7  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1102  cytochrome c family protein  34.62 
 
 		 252 aa  49.7  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000169196  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1900  hypothetical protein  24.47 
 
 		 340 aa  49.7  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.857082 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0729  hypothetical protein  33.33 
 
 		 102 aa  47.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000019285 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0716  hypothetical protein  32.22 
 
 		 102 aa  44.3  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.824406  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1385  hypothetical protein  27.84 
 
 		 181 aa  43.1  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.522055  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2767  hypothetical protein  33.33 
 
 		 125 aa  43.1  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000252598  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>