34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1082 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1082  hypothetical protein  100 
 
 		 266 aa  556  1e-158  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15012e-18 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3997  hypothetical protein  58.49 
 
 		 265 aa  355  5.999999999999999e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000400018  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3254  hypothetical protein  52.29 
 
 		 267 aa  323  1e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163146  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3996  hypothetical protein  38.24 
 
 		 256 aa  169  4e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000934888  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2745  hypothetical protein  37.23 
 
 		 276 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000727433  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1084  hypothetical protein  33.21 
 
 		 277 aa  146  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.18348e-17 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4130  cytochrome c class I  39.5 
 
 		 350 aa  92  8e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4127  hypothetical protein  36.44 
 
 		 199 aa  90.1  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.878957 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4131  hypothetical protein  45 
 
 		 160 aa  81.3  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4126  hypothetical protein  49.28 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686077 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1575  cytochrome c family protein  28.01 
 
 		 479 aa  75.5  0.0000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1996  cytochrome c family protein  28.63 
 
 		 343 aa  72  0.000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00379729  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2210  cytochrome c family protein  27.59 
 
 		 711 aa  69.3  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1315  hypothetical protein  29.34 
 
 		 335 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000524828  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3135  hypothetical protein  28.51 
 
 		 717 aa  63.9  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2822  hypothetical protein  29.75 
 
 		 340 aa  64.3  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000171082  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0679  cytochrome c family protein  27.8 
 
 		 330 aa  63.5  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0692  cytochrome c family protein  28.22 
 
 		 330 aa  63.9  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000351861 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2301  cytochrome c family protein  27.47 
 
 		 709 aa  63.2  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2048  cytochrome c family protein  27.24 
 
 		 340 aa  61.6  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.36956e-16  hitchhiker  0.000000028762 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1703  cytochrome c family protein  27.03 
 
 		 337 aa  60.5  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2930  cytochrome c family protein  28.14 
 
 		 329 aa  59.3  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000304572  decreased coverage  8.81711e-19 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1900  hypothetical protein  27.87 
 
 		 340 aa  55.8  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.857082 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1433  hypothetical protein  39.13 
 
 		 106 aa  55.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000304955  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3655  hypothetical protein  27.31 
 
 		 254 aa  54.7  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2323  hypothetical protein  25.82 
 
 		 340 aa  52.4  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000105852  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1385  hypothetical protein  26.29 
 
 		 181 aa  50.8  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.522055  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0592  cytochrome c family protein  37.8 
 
 		 329 aa  50.1  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000257113  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1102  cytochrome c family protein  33.33 
 
 		 252 aa  48.1  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000169196  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0729  hypothetical protein  48.08 
 
 		 102 aa  46.6  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000019285 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2250  cytochrome c class III  22.22 
 
 		 538 aa  46.6  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000197158  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0469  hypothetical protein  37.5 
 
 		 102 aa  43.9  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1803  hypothetical protein  26.74 
 
 		 113 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.20863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0716  hypothetical protein  44.23 
 
 		 102 aa  42.4  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.824406  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>