33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0580 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0580  cytochrome c family protein  100 
 
 		 252 aa  523  1e-148  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0523  cytochrome c family protein  47.49 
 
 		 259 aa  252  5.000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.149133 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1237  cytochrome c family protein  47.56 
 
 		 247 aa  209  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1961  cytochrome c family protein  41.25 
 
 		 266 aa  196  3e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2831  hypothetical protein  26.12 
 
 		 184 aa  63.5  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000373636  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2038  cytochrome c class III  23.53 
 
 		 326 aa  46.6  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3135  hypothetical protein  23.08 
 
 		 717 aa  45.8  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6280  hypothetical protein  27.37 
 
 		 368 aa  45.8  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3544  cytochrome C family protein  24.46 
 
 		 1106 aa  45.4  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1782  decaheme cytochrome c MtrD  25.6 
 
 		 306 aa  45.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2690  hypothetical protein  23.37 
 
 		 211 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0297464 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1616  cytochrome C family protein  25.12 
 
 		 321 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.093642  normal  0.713619 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0241  hypothetical protein  27.54 
 
 		 157 aa  45.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1836  cytochrome C family protein  27.36 
 
 		 658 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1837  cytochrome C family protein  26.46 
 
 		 429 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1593  cytochrome C family protein  25.12 
 
 		 321 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000481816  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2149  cytochrome c family protein  28.28 
 
 		 304 aa  44.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0950345  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2506  cytochrome C family protein  25.12 
 
 		 321 aa  43.5  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.365224  hitchhiker  0.00105775 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1266  cytochrome c class III  36.14 
 
 		 224 aa  43.9  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.113202  normal  0.0397908 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2930  cytochrome c family protein  26.33 
 
 		 329 aa  43.5  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000304572  decreased coverage  8.81711e-19 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3710  acidic cytochrome c3  30.26 
 
 		 128 aa  43.5  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2574  cytochrome C family protein  25.12 
 
 		 321 aa  43.5  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.448859  hitchhiker  0.00699839 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2672  cytochrome C family protein  25.12 
 
 		 321 aa  43.5  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.655979  normal  0.0486911 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0592  cytochrome c family protein  26.2 
 
 		 329 aa  43.1  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000257113  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0221  cytochrome c family protein  25.32 
 
 		 211 aa  42.7  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0679  cytochrome c family protein  22.63 
 
 		 330 aa  42.7  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0653  high-molecular-weight cytochrome c  37.88 
 
 		 555 aa  42.4  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0567  cytochrome c class III  34.33 
 
 		 129 aa  42.7  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2250  cytochrome c class III  38.71 
 
 		 538 aa  42.7  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000197158  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2268  hypothetical protein  24.31 
 
 		 210 aa  42.4  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1582  cytochrome C family protein  24.64 
 
 		 321 aa  42  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000911408  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0692  cytochrome c family protein  22.18 
 
 		 330 aa  42  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000351861 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3565  hypothetical protein  25.41 
 
 		 1110 aa  42  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>