64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0126 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0126  hypothetical protein  100 
 
 
309 aa  622  1e-177  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0115  hypothetical protein  98.06 
 
 
309 aa  610  1e-173  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0108  hypothetical protein  95.15 
 
 
309 aa  564  1e-160  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0112  hypothetical protein  68.56 
 
 
302 aa  396  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0873537  normal  0.846145 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6281  hypothetical protein  31.41 
 
 
610 aa  62.4  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1124  cytochrome C family protein  24.93 
 
 
658 aa  58.5  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932844  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1995  cytochrome C family protein  26.37 
 
 
658 aa  56.2  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.279857  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2077  hypothetical protein  28.49 
 
 
260 aa  55.8  0.0000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3068  cytochrome c family protein  26.74 
 
 
650 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0231  cytochrome C family protein  24.13 
 
 
316 aa  55.1  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2692  cytochrome C family protein  23.35 
 
 
319 aa  53.9  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3166  cytochrome C family protein  26.04 
 
 
650 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1207  decaheme cytochrome c MtrA  25.19 
 
 
326 aa  53.5  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0298799  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1237  cytochrome c family protein  26.26 
 
 
247 aa  53.1  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0286  hypothetical protein  25 
 
 
240 aa  53.1  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.046766  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3261  cytochrome C family protein  26.37 
 
 
656 aa  52.8  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0352  cytochrome c family protein  24.72 
 
 
317 aa  52.4  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.101331 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3130  cytochrome C family protein  22.88 
 
 
317 aa  52.4  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.849943  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2925  cytochrome c family protein  23.95 
 
 
315 aa  50.8  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0597  hypothetical protein  24.05 
 
 
288 aa  50.4  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000303858 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1402  cytochrome c family protein  23.75 
 
 
316 aa  50.1  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1836  cytochrome C family protein  23.66 
 
 
658 aa  50.1  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2495  cytochrome c family protein  26.53 
 
 
646 aa  49.7  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2677  cytochrome C family protein  23.4 
 
 
329 aa  49.7  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.376662  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2189  cytochrome c family protein  27.52 
 
 
600 aa  48.1  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2960  cytochrome  25.79 
 
 
577 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.992406  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3686  cytochrome C family protein  24.81 
 
 
314 aa  47.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2519  cytochrome C family protein  23.55 
 
 
322 aa  47.4  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.589751  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3093  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  28.48 
 
 
151 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0227  cytochrome c family protein  23.42 
 
 
316 aa  47.4  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0598  PKD  24.83 
 
 
806 aa  47  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00146483  normal  0.752324 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2820  cytochrome C family protein  26.26 
 
 
312 aa  47  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1744  cytochrome c family protein  25.7 
 
 
337 aa  46.2  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.740978 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2291  cytochrome C family protein  24.75 
 
 
335 aa  46.6  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0584  hypothetical protein  22.97 
 
 
285 aa  46.2  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0108517  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1541  cytochrome c family protein  23.41 
 
 
656 aa  46.2  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0115719 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1144  cytochrome C family protein  25.13 
 
 
334 aa  46.2  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2988  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  27.85 
 
 
151 aa  45.8  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0934  cytochrome C family protein  26.78 
 
 
337 aa  45.8  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1477  cytochrome C family protein  23.31 
 
 
334 aa  45.8  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000779097  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0558  cytochrome c family protein  27.53 
 
 
1036 aa  45.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2210  cytochrome c family protein  22.01 
 
 
711 aa  44.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1530  cytochrome c family protein  21.71 
 
 
321 aa  44.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.892773  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1996  cytochrome C family protein  22.03 
 
 
427 aa  44.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0405741  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1100  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  26.77 
 
 
205 aa  44.3  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0747  multiheme cytochrome  23.93 
 
 
487 aa  43.9  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.568299  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1125  cytochrome C family protein  29.56 
 
 
426 aa  43.9  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.4798  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2759  cytochrome C family protein  24.82 
 
 
449 aa  43.9  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0471  hypothetical protein  23.74 
 
 
790 aa  43.5  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0674457  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3165  cytochrome C family protein  25.19 
 
 
436 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4082  hypothetical protein  26.45 
 
 
307 aa  43.5  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0556738  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3118  cytochrome C family protein  26.09 
 
 
334 aa  43.5  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2506  cytochrome C family protein  21.71 
 
 
321 aa  43.5  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.365224  hitchhiker  0.00105775 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2574  cytochrome C family protein  21.71 
 
 
321 aa  43.5  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.448859  hitchhiker  0.00699839 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3260  cytochrome C family protein  25.19 
 
 
436 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2672  cytochrome C family protein  21.71 
 
 
321 aa  43.1  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.655979  normal  0.0486911 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2903  respiratory nitrite reductase specific menaquinol--cytochrome-c reductase (NrfH) precursor  29.17 
 
 
151 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1837  cytochrome C family protein  27.69 
 
 
429 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0817  cytochrome C family protein  24.09 
 
 
540 aa  43.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3067  cytochrome c family protein  24.81 
 
 
436 aa  42.7  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0451  hypothetical protein  30 
 
 
621 aa  42.7  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.235672 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0030  hypothetical protein  21.77 
 
 
405 aa  42.7  0.009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1782  decaheme cytochrome c MtrD  21.71 
 
 
306 aa  42.7  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2427  multihaem cytochrome  30.56 
 
 
280 aa  42.4  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000206964  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>