53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0215 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0215  chaperone protein HtpG  100 
 
 		 219 aa  457  9.999999999999999e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.391907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0159  chaperone protein HtpG  98.17 
 
 		 219 aa  449  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0899507  hitchhiker  0.00859507 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0017  chaperone protein HtpG  94.06 
 
 		 219 aa  436  1e-121  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.247503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6222  chaperone protein HtpG  79.45 
 
 		 219 aa  373  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.385965  decreased coverage  0.00955528 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6894  chaperone protein HtpG  71.69 
 
 		 229 aa  340  8e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5825  chaperone protein HtpG  72.48 
 
 		 218 aa  338  5e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.024458  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4188  chaperone protein HtpG  68.49 
 
 		 218 aa  322  2e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1596  chaperone protein HtpG  56.16 
 
 		 216 aa  272  2.0000000000000002e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1044  chaperone protein HtpG  52.91 
 
 		 219 aa  256  1e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.887318  normal  0.440789 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3004  chaperone protein HtpG  50.21 
 
 		 238 aa  250  9.000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000955215 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0836  putative chaperone protein HtpG  55.2 
 
 		 217 aa  235  4e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.199398  normal  0.167985 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1237  chaperone protein HtpG  53.15 
 
 		 214 aa  234  9e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.250059  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3387  hypothetical protein  47.95 
 
 		 219 aa  232  4.0000000000000004e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1525  hypothetical protein  50 
 
 		 220 aa  227  1e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.415046  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5956  chaperone protein HtpG  51.8 
 
 		 220 aa  226  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.387294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0840  hypothetical protein  48.4 
 
 		 216 aa  224  6e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.373903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0795  hypothetical protein  49.32 
 
 		 216 aa  223  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0843  hypothetical protein  49.32 
 
 		 216 aa  222  3e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.319857  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0847  hypothetical protein  49.32 
 
 		 216 aa  222  3e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.554273  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1462  hypothetical protein  49.78 
 
 		 226 aa  216  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0873129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4139  hypothetical protein  47.51 
 
 		 220 aa  215  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4427  chaperone protein HtpG  51.22 
 
 		 216 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.859457  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2412  cytochrome c family protein  48.15 
 
 		 215 aa  200  9.999999999999999e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163467  normal  0.409257 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3982  cytochrome c family protein  43.78 
 
 		 253 aa  190  1e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0221  cytochrome c family protein  41.74 
 
 		 211 aa  175  4e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3935  cytochrome c family protein  42.51 
 
 		 217 aa  171  6.999999999999999e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.442182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2714  hypothetical protein  42.15 
 
 		 214 aa  165  5.9999999999999996e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.272646  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3477  cytochrome c class I  43.61 
 
 		 425 aa  137  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.333881  normal  0.501976 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5664  cytochrome c class I  43.18 
 
 		 443 aa  136  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.239336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1215  putative cytochrome c  41.61 
 
 		 234 aa  130  1.0000000000000001e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.422839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1426  membrane protein containing cytochrome c domain protein  37.14 
 
 		 233 aa  124  1e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0103  hypothetical protein  43.44 
 
 		 183 aa  123  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00108183 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2213  cytochrome c, mono- and diheme variant  39.05 
 
 		 435 aa  122  4e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1634  cytochrome c, class I  31.96 
 
 		 444 aa  122  5e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0122  hypothetical protein  42.62 
 
 		 183 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2550  cytochrome c family protein  37.86 
 
 		 181 aa  117  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01315  Cytochrome c3  38 
 
 		 427 aa  114  7.999999999999999e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1809  hypothetical protein  38.82 
 
 		 171 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0786634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0288  cytochrome c class I  33.81 
 
 		 416 aa  112  6e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.142751  normal  0.0801636 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0529  cytochrome c class I  32.98 
 
 		 400 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2778  hypothetical protein  35.22 
 
 		 171 aa  108  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2268  hypothetical protein  33.33 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2546  hypothetical protein  38.61 
 
 		 220 aa  70.5  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000133101  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2690  hypothetical protein  31.34 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0297464 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2932  hypothetical protein  31.01 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0270  hypothetical protein  31.3 
 
 		 178 aa  61.6  0.000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0149554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3390  hypothetical protein  28.57 
 
 		 179 aa  60.5  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0611  hypothetical protein  32.41 
 
 		 184 aa  57.8  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3457  hypothetical protein  29.79 
 
 		 347 aa  45.8  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434571 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2210  cytochrome c family protein  23.66 
 
 		 711 aa  45.1  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2822  hypothetical protein  30.17 
 
 		 340 aa  44.3  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000171082  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2048  cytochrome c family protein  25.38 
 
 		 340 aa  43.1  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.36956e-16  hitchhiker  0.000000028762 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3163  cytochrome C family protein  24.7 
 
 		 442 aa  42.4  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>