72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3057 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0497  cytochrome C family protein  40.22 
 
 		 1053 aa  652    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3428  cytochrome C family protein  43.73 
 
 		 1017 aa  725    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.624718  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1152  cytochrome C family protein  45.49 
 
 		 1009 aa  780    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2884  cytochrome c family protein  42.71 
 
 		 1038 aa  682    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3057  cytochrome C family protein  100 
 
 		 1017 aa  2087    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2912  cytochrome c family protein  40.58 
 
 		 1046 aa  665    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.802585  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1193  cytochrome C family protein  91.16 
 
 		 1018 aa  1924    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0558  cytochrome c family protein  42.9 
 
 		 1036 aa  690    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1198  cytochrome C family protein  47.51 
 
 		 1143 aa  502  1e-140  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3052  cytochrome C family protein  47.45 
 
 		 1143 aa  492  1e-137  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1834  cytochrome C family protein  39.02 
 
 		 1611 aa  446  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3543  cytochrome C family protein  35.34 
 
 		 957 aa  398  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3564  cytochrome C family protein  35.38 
 
 		 955 aa  392  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3470  cytochrome C family protein  37.92 
 
 		 958 aa  388  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1153  cytochrome C family protein  37.92 
 
 		 958 aa  388  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3544  cytochrome C family protein  46.64 
 
 		 1106 aa  330  8e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2888  hypothetical protein  47.12 
 
 		 1294 aa  330  1.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3565  hypothetical protein  44.78 
 
 		 1110 aa  321  5e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2883  cytochrome c family protein  34.94 
 
 		 902 aa  300  1e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3427  cytochrome C family protein  30.2 
 
 		 1457 aa  221  7e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.476422  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0498  cytochrome C family protein  28.18 
 
 		 1281 aa  131  5.0000000000000004e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.618718  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3426  cytochrome C family protein  27.66 
 
 		 901 aa  96.3  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.360069  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0077  cytochrome C family protein  24.93 
 
 		 2499 aa  86.7  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0075  cytochrome C family protein  28.5 
 
 		 2222 aa  83.2  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3563  cytochrome C family protein  25 
 
 		 1276 aa  80.5  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3724  cytochrome C family protein  31.43 
 
 		 1691 aa  79.7  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2035  cytochrome C family protein  26.06 
 
 		 1596 aa  74.7  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0398  cytochrome C family protein  24.79 
 
 		 672 aa  73.2  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0120  cytochrome C family protein  26.2 
 
 		 2026 aa  72  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.345457  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2882  cytochrome c family protein  28.12 
 
 		 688 aa  71.2  0.00000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0580  high-molecular-weight cytochrome c  31.6 
 
 		 869 aa  71.2  0.00000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2869  cytochrome C family protein  28.35 
 
 		 1196 aa  70.5  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00106509  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3417  cytochrome C family protein  28.99 
 
 		 939 aa  69.7  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000650224  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0571  cytochrome c family protein  28.37 
 
 		 1848 aa  69.7  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2899  high-molecular-weight cytochrome c  24.62 
 
 		 979 aa  69.3  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1154  cytochrome C family protein  26.76 
 
 		 1454 aa  67.8  0.0000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0499  cytochrome C family protein  26.22 
 
 		 1379 aa  67.4  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00294186  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0575  cytochrome c family protein  26.9 
 
 		 1127 aa  67.4  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0076  cytochrome C family protein  23.54 
 
 		 1438 aa  65.1  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0500  cytochrome C family protein  23.42 
 
 		 1496 aa  60.5  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00446809  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2470  high-molecular-weight cytochrome c  25.22 
 
 		 1521 aa  58.5  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1826  cytochrome C family protein  26.78 
 
 		 1645 aa  58.5  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3542  cytochrome C family protein  25.15 
 
 		 1453 aa  57.4  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2645  hypothetical protein  21.68 
 
 		 867 aa  55.8  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.519217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3261  cytochrome C family protein  23.59 
 
 		 656 aa  55.5  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0573  cytochrome C family protein  28.95 
 
 		 1672 aa  55.1  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3268  cytochrome C family protein  24.61 
 
 		 1329 aa  54.7  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3068  cytochrome c family protein  24.18 
 
 		 650 aa  54.7  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3077  multihaem cytochrome  24.33 
 
 		 1330 aa  54.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2904  cytochrome C family protein  28.8 
 
 		 655 aa  53.1  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1823  cytochrome C family protein  25.43 
 
 		 1525 aa  52.4  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3174  cytochrome C family protein  24.86 
 
 		 1329 aa  52  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.246364  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0702  cytochrome c family protein  24.19 
 
 		 1916 aa  52  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2998  cytochrome C family protein  28.8 
 
 		 655 aa  51.6  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3166  cytochrome C family protein  23.63 
 
 		 650 aa  51.2  0.00009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2816  cytochrome c like protein  28.72 
 
 		 655 aa  50.8  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16928  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2495  cytochrome c family protein  24.45 
 
 		 646 aa  50.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1836  cytochrome C family protein  24.21 
 
 		 658 aa  49.7  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3049  cytochrome C family protein  25.48 
 
 		 2081 aa  48.9  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3540  hypothetical protein  28.14 
 
 		 1289 aa  49.3  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1837  cytochrome C family protein  23.96 
 
 		 429 aa  48.5  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0934  cytochrome C family protein  27.6 
 
 		 337 aa  48.5  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3218  cytochrome c family protein  27.11 
 
 		 480 aa  48.1  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0562793  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2762  cytochrome C family protein  25.88 
 
 		 454 aa  47.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2898  high-molecular-weight cytochrome c  25.3 
 
 		 2803 aa  47.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0581  high-molecular-weight cytochrome c  24.1 
 
 		 2912 aa  47  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1829  hypothetical protein  24.5 
 
 		 570 aa  46.2  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1124  cytochrome C family protein  21.91 
 
 		 658 aa  46.2  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932844  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1542  cytochrome C family protein  24.23 
 
 		 655 aa  45.1  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0724057 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0692  cytochrome c family protein  21.88 
 
 		 330 aa  45.1  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000351861 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2903  cytochrome C family protein  29.39 
 
 		 455 aa  44.3  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.864697  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1995  cytochrome C family protein  23.29 
 
 		 658 aa  44.7  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.279857  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>