48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2666 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_2666  hypothetical protein  100 
 
 
620 aa  1217    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2645  hypothetical protein  64.94 
 
 
867 aa  755    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.519217  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2757  hypothetical protein  94.2 
 
 
621 aa  1094    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2851  hypothetical protein  94.98 
 
 
618 aa  1120    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.581823  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0451  hypothetical protein  32.69 
 
 
621 aa  313  4.999999999999999e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.235672 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0472  cytochrome c family protein  34.09 
 
 
664 aa  299  1e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.482092  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2189  cytochrome c family protein  31.68 
 
 
600 aa  196  1e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5161  hypothetical protein  31.59 
 
 
794 aa  195  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1541  cytochrome c family protein  29.77 
 
 
656 aa  193  8e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0115719 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0471  hypothetical protein  28.24 
 
 
790 aa  170  8e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0674457  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1440  hypothetical protein  27.25 
 
 
413 aa  85.5  0.000000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00370181  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2850  cytochrome c family protein  34.5 
 
 
309 aa  84.3  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.448853  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0450  cytochrome c family protein  27.89 
 
 
312 aa  82.8  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2756  cytochrome c family protein  34.06 
 
 
309 aa  82.8  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1146  hypothetical protein  24.23 
 
 
426 aa  81.3  0.00000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00972968  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2665  cytochrome c family protein  41.88 
 
 
299 aa  72.4  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0517248  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0992  hypothetical protein  25.86 
 
 
294 aa  68.9  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2339  hypothetical protein  27.04 
 
 
272 aa  67  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1087  hypothetical protein  31.5 
 
 
258 aa  58.9  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3135  hypothetical protein  21.53 
 
 
717 aa  57.8  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00342  putative exported protein of unknown function with cytochrome Cfamily domain  27.88 
 
 
263 aa  57.4  0.0000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0091  cytochrome C family protein  30.06 
 
 
256 aa  55.5  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.22622 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1297  hypothetical protein  28.76 
 
 
279 aa  55.1  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.581727  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0201  hypothetical protein  23.69 
 
 
258 aa  54.7  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1125  cytochrome C family protein  24.22 
 
 
426 aa  53.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.4798  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1542  cytochrome C family protein  23.38 
 
 
655 aa  53.1  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0724057 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2210  cytochrome c family protein  23.51 
 
 
711 aa  53.9  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3166  cytochrome C family protein  25.56 
 
 
650 aa  52.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2336  hypothetical protein  29.7 
 
 
238 aa  52.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2301  cytochrome c family protein  24.48 
 
 
709 aa  52.8  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2887  cytochrome c family protein  23.88 
 
 
884 aa  52.8  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0141387  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6896  hypothetical protein  30.56 
 
 
265 aa  51.6  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0193  hypothetical protein  29.09 
 
 
258 aa  51.6  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6650  hypothetical protein  30.39 
 
 
266 aa  51.6  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.237631  normal  0.336128 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2495  cytochrome c family protein  25.27 
 
 
646 aa  51.2  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0598  PKD  22.44 
 
 
806 aa  50.1  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00146483  normal  0.752324 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3068  cytochrome c family protein  23.78 
 
 
650 aa  49.7  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1836  cytochrome C family protein  31.69 
 
 
658 aa  48.5  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1124  cytochrome C family protein  23.48 
 
 
658 aa  47.8  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932844  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3261  cytochrome C family protein  26.45 
 
 
656 aa  47.8  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2466  hypothetical protein  24.49 
 
 
237 aa  47.4  0.0009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.437406 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0993  hypothetical protein  25.1 
 
 
291 aa  45.8  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000916347  decreased coverage  0.0000889659 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1136  hypothetical protein  25.71 
 
 
288 aa  45.1  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1996  cytochrome C family protein  27.42 
 
 
427 aa  44.7  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0405741  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1155  hypothetical protein  24.94 
 
 
1537 aa  44.7  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1528  decaheme cytochrome c MtrF  33.08 
 
 
646 aa  44.3  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0600  PKD  22.34 
 
 
712 aa  44.3  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000134554  normal  0.252595 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3544  cytochrome C family protein  27.22 
 
 
1106 aa  43.9  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>