29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2850 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_2850  cytochrome c family protein  100 
 
 
309 aa  602  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.448853  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2756  cytochrome c family protein  98.71 
 
 
309 aa  594  1e-169  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2665  cytochrome c family protein  96.58 
 
 
299 aa  493  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0517248  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2645  hypothetical protein  64.31 
 
 
867 aa  340  2.9999999999999998e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.519217  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0450  cytochrome c family protein  33.78 
 
 
312 aa  126  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1541  cytochrome c family protein  31.4 
 
 
656 aa  116  6e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0115719 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0471  hypothetical protein  32.95 
 
 
790 aa  116  6e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0674457  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2189  cytochrome c family protein  33.18 
 
 
600 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0472  cytochrome c family protein  32.14 
 
 
664 aa  92  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.482092  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2666  hypothetical protein  32.74 
 
 
620 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5161  hypothetical protein  33.77 
 
 
794 aa  87.8  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2851  hypothetical protein  33.1 
 
 
618 aa  86.3  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.581823  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2757  hypothetical protein  30.85 
 
 
621 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0451  hypothetical protein  28.09 
 
 
621 aa  79.7  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.235672 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1146  hypothetical protein  24.66 
 
 
426 aa  51.2  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00972968  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0992  hypothetical protein  29.59 
 
 
294 aa  50.4  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2427  multihaem cytochrome  23.15 
 
 
280 aa  48.1  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000206964  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1542  cytochrome C family protein  25.88 
 
 
655 aa  47.4  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0724057 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1125  cytochrome C family protein  22.48 
 
 
426 aa  47.8  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.4798  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1440  hypothetical protein  25.26 
 
 
413 aa  45.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00370181  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1297  hypothetical protein  29.68 
 
 
279 aa  45.8  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.581727  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2644  hypothetical protein  29.69 
 
 
264 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404723  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1477  cytochrome C family protein  24.69 
 
 
334 aa  45.1  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000779097  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2674  decaheme cytochrome c MtrF  26.53 
 
 
639 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0899912  normal  0.105553 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1780  decaheme cytochrome c MtrF  26.22 
 
 
639 aa  44.3  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2576  decaheme cytochrome c MtrF  26.53 
 
 
639 aa  44.3  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.134423  decreased coverage  0.00876105 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2694  decaheme cytochrome c MtrF  25 
 
 
640 aa  43.9  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2508  decaheme cytochrome c MtrF  25.85 
 
 
639 aa  42.7  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00292179  decreased coverage  0.000509076 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2763  decaheme cytochrome c MtrF  24.16 
 
 
639 aa  42.4  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0120659  hitchhiker  0.0000444921 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>