110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1528 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1780  decaheme cytochrome c MtrF  62.44 
 
 		 639 aa  847    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2508  decaheme cytochrome c MtrF  62.58 
 
 		 639 aa  821    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00292179  decreased coverage  0.000509076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2576  decaheme cytochrome c MtrF  62.8 
 
 		 639 aa  825    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.134423  decreased coverage  0.00876105 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2674  decaheme cytochrome c MtrF  62.58 
 
 		 639 aa  825    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0899912  normal  0.105553 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1211  decaheme cytochrome c MtrF  59.72 
 
 		 639 aa  813    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1591  decaheme cytochrome c MtrF  61.36 
 
 		 639 aa  837    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000158979  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2521  decaheme cytochrome c MtrF  67.59 
 
 		 639 aa  888    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1580  decaheme cytochrome c MtrF  61.67 
 
 		 639 aa  843    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0766819  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1528  decaheme cytochrome c MtrF  100 
 
 		 646 aa  1336    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2694  decaheme cytochrome c MtrF  67.8 
 
 		 640 aa  894    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1614  decaheme cytochrome c MtrF  61.36 
 
 		 639 aa  839    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0474266  normal  0.168927 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2763  decaheme cytochrome c MtrF  62.54 
 
 		 639 aa  834    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0120659  hitchhiker  0.0000444921 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1589  decaheme cytochrome c  32.65 
 
 		 650 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000235795  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2765  decaheme cytochrome c  33.38 
 
 		 650 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00105295  hitchhiker  0.000000731399 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1612  decaheme cytochrome c  33.09 
 
 		 650 aa  307  3e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0130523  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1578  decaheme cytochrome c  32.49 
 
 		 650 aa  303  9e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000205402  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2578  decaheme cytochrome c  33.63 
 
 		 650 aa  301  4e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00427395  decreased coverage  0.00803379 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2676  decaheme cytochrome c  33.28 
 
 		 650 aa  300  7e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000503474  normal  0.0214929 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1208  decaheme cytochrome c  33.67 
 
 		 656 aa  296  6e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.474569  normal  0.550051 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1478  decaheme cytochrome c  30.65 
 
 		 663 aa  281  2e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000254716  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2525  decaheme cytochrome c  31.5 
 
 		 656 aa  263  6e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000837992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2637  decaheme cytochrome c  30.59 
 
 		 653 aa  262  1e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2510  decaheme cytochrome c  31.96 
 
 		 655 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0178218  hitchhiker  0.000666167 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3125  decaheme cytochrome c  32.43 
 
 		 667 aa  251  3e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00001045  hitchhiker  0.00000606277 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1778  decaheme cytochrome c  30.84 
 
 		 671 aa  247  4.9999999999999997e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4048  hypothetical protein  28.52 
 
 		 764 aa  219  2e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1525  decaheme cytochrome c  30.59 
 
 		 660 aa  217  5.9999999999999996e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.100516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2698  decaheme cytochrome c  29.84 
 
 		 671 aa  213  9e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0681671  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3466  hypothetical protein  26.46 
 
 		 785 aa  207  5e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.724503 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3286  hypothetical protein  27.38 
 
 		 714 aa  189  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.909593  hitchhiker  0.000000468411 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2509  decaheme cytochrome c  25.81 
 
 		 731 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000184393  hitchhiker  0.000632353 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1779  decaheme cytochrome c  25.13 
 
 		 735 aa  145  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2292  hypothetical protein  25.21 
 
 		 782 aa  144  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2577  decaheme cytochrome c  25.68 
 
 		 731 aa  144  6e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00883016  decreased coverage  0.00925289 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1590  decaheme cytochrome c  25.94 
 
 		 730 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000452412  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2695  decaheme cytochrome c  25.66 
 
 		 719 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.734788  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1579  decaheme cytochrome c  25.8 
 
 		 730 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00874065  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1613  decaheme cytochrome c  25.8 
 
 		 730 aa  140  7e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000196014  normal  0.166254 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1210  decaheme cytochrome c  24.97 
 
 		 727 aa  134  6e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.260087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1209  decaheme cytochrome c  24.43 
 
 		 729 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00658895  normal  0.327868 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2522  decaheme cytochrome c  24.77 
 
 		 720 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1345  multiheme cytochrome  25.97 
 
 		 742 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1244  hypothetical protein  26.11 
 
 		 742 aa  131  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0505071  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2697  decaheme cytochrome c  24.18 
 
 		 745 aa  130  6e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0633196  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2603  hypothetical protein  26.44 
 
 		 742 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430741  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0918  decaheme cytochrome c  24.65 
 
 		 764 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.613412  normal  0.552776 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3124  decaheme cytochrome c  24.52 
 
 		 741 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00184772  hitchhiker  0.000042193 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2675  decaheme cytochrome c  25.17 
 
 		 724 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000733685  normal  0.0455406 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2696  hypothetical protein  25.5 
 
 		 822 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0875  hypothetical protein  24.12 
 
 		 893 aa  127  6e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0421546 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1527  decaheme cytochrome c  23.7 
 
 		 722 aa  127  7e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3588  decaheme cytochrome c  24.84 
 
 		 745 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1479  hypothetical protein  23.3 
 
 		 833 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0424195  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2787  decaheme cytochrome c  26.9 
 
 		 762 aa  120  9e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0256712 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4083  hypothetical protein  23.9 
 
 		 826 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0344261  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2524  decaheme cytochrome c  24.02 
 
 		 725 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000418395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3573  decaheme cytochrome c  22.92 
 
 		 716 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3371  hypothetical protein  22.83 
 
 		 895 aa  118  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.94917  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1380  decaheme cytochrome c  26.45 
 
 		 765 aa  117  6e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1526  decaheme cytochrome c  22.71 
 
 		 738 aa  117  7.999999999999999e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.324001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2636  decaheme cytochrome c  24.26 
 
 		 724 aa  114  6e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2613  decaheme cytochrome c  24.32 
 
 		 762 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000355284  hitchhiker  0.00000740819 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1478  decaheme cytochrome c  25.13 
 
 		 761 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.174618  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1473  decaheme cytochrome c  25.1 
 
 		 761 aa  110  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000262006  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4080  hypothetical protein  23.03 
 
 		 936 aa  109  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000183317  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2874  decaheme cytochrome c  25.03 
 
 		 764 aa  108  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0594793  hitchhiker  0.00000891097 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2228  decaheme cytochrome c  26.06 
 
 		 755 aa  106  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.236086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4254  decaheme cytochrome c  23.01 
 
 		 729 aa  104  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.353597  unclonable  0.0000000280036 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2680  decaheme cytochrome c  24.18 
 
 		 762 aa  102  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.463028  unclonable  0.0000643351 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0998  decaheme cytochrome c  25.12 
 
 		 766 aa  101  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1659  decaheme cytochrome c  23.87 
 
 		 758 aa  101  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3251  hypothetical protein  26.55 
 
 		 788 aa  99.4  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4079  hypothetical protein  24.8 
 
 		 885 aa  99  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.299167  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1658  hypothetical protein  28.39 
 
 		 898 aa  98.2  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.131846  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3098  hypothetical protein  27 
 
 		 789 aa  96.3  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1731  multiheme cytochrome  28.02 
 
 		 898 aa  97.1  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2299  hypothetical protein  23.87 
 
 		 809 aa  94.4  6e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2216  hypothetical protein  27.83 
 
 		 898 aa  93.2  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.352223  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3200  hypothetical protein  24.07 
 
 		 820 aa  93.6  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1268  hypothetical protein  25.81 
 
 		 789 aa  93.2  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.487663  hitchhiker  0.00130496 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3108  hypothetical protein  24.67 
 
 		 788 aa  92.8  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1257  hypothetical protein  22.33 
 
 		 762 aa  91.3  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6275  decaheme c-type cytochrome, OmcA/MtrC family  23.38 
 
 		 741 aa  90.5  8e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.772817 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2764  hypothetical protein  30.88 
 
 		 843 aa  89.7  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.185672  hitchhiker  0.000000808171 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003776  decaheme cytochrome c MtrF  23.3 
 
 		 754 aa  87.8  6e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1187  hypothetical protein  24.42 
 
 		 778 aa  85.1  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1713  hypothetical protein  28.45 
 
 		 945 aa  79.7  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.436521  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0913  decaheme cytochrome c  22.62 
 
 		 770 aa  79  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.546873  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0910  hypothetical protein  20.87 
 
 		 731 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.688824 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0447  hypothetical protein  32.5 
 
 		 612 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.476837 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3263  hypothetical protein  30.37 
 
 		 655 aa  64.7  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4517  hypothetical protein  31.02 
 
 		 642 aa  64.3  0.000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.247929 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3353  hypothetical protein  26.93 
 
 		 856 aa  63.9  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2580  hypothetical protein  31.18 
 
 		 677 aa  63.5  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2507  hypothetical protein  28.86 
 
 		 700 aa  60.8  0.00000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116766  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1421  hypothetical protein  26.55 
 
 		 657 aa  60.1  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.515821 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3163  hypothetical protein  25.41 
 
 		 857 aa  57  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2523  hypothetical protein  27.27 
 
 		 757 aa  56.2  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2862  hypothetical protein  27.69 
 
 		 698 aa  55.1  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1356  hypothetical protein  27.04 
 
 		 696 aa  53.1  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0734371 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>