112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2521 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1780  decaheme cytochrome c MtrF  62.93 
 
 		 639 aa  860    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2508  decaheme cytochrome c MtrF  65.48 
 
 		 639 aa  855    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00292179  decreased coverage  0.000509076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2576  decaheme cytochrome c MtrF  66.29 
 
 		 639 aa  863    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.134423  decreased coverage  0.00876105 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2674  decaheme cytochrome c MtrF  66.13 
 
 		 639 aa  864    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0899912  normal  0.105553 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1211  decaheme cytochrome c MtrF  65.06 
 
 		 639 aa  837    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1591  decaheme cytochrome c MtrF  63.08 
 
 		 639 aa  850    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000158979  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2521  decaheme cytochrome c MtrF  100 
 
 		 639 aa  1331    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1580  decaheme cytochrome c MtrF  63.55 
 
 		 639 aa  855    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0766819  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1528  decaheme cytochrome c MtrF  67.59 
 
 		 646 aa  881    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2694  decaheme cytochrome c MtrF  63.18 
 
 		 640 aa  836    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1614  decaheme cytochrome c MtrF  63.24 
 
 		 639 aa  852    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0474266  normal  0.168927 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2763  decaheme cytochrome c MtrF  64.52 
 
 		 639 aa  845    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0120659  hitchhiker  0.0000444921 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1589  decaheme cytochrome c  34.05 
 
 		 650 aa  326  8.000000000000001e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000235795  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2765  decaheme cytochrome c  33.9 
 
 		 650 aa  324  2e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00105295  hitchhiker  0.000000731399 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1612  decaheme cytochrome c  33.74 
 
 		 650 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0130523  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1578  decaheme cytochrome c  33.59 
 
 		 650 aa  321  3e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000205402  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2676  decaheme cytochrome c  33.23 
 
 		 650 aa  318  3e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000503474  normal  0.0214929 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2578  decaheme cytochrome c  33.02 
 
 		 650 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00427395  decreased coverage  0.00803379 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1208  decaheme cytochrome c  32.79 
 
 		 656 aa  300  4e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.474569  normal  0.550051 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1478  decaheme cytochrome c  30.5 
 
 		 663 aa  295  2e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000254716  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2510  decaheme cytochrome c  30.42 
 
 		 655 aa  249  1e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0178218  hitchhiker  0.000666167 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2637  decaheme cytochrome c  29.88 
 
 		 653 aa  247  6e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3125  decaheme cytochrome c  31.14 
 
 		 667 aa  244  5e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00001045  hitchhiker  0.00000606277 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2525  decaheme cytochrome c  30.01 
 
 		 656 aa  240  5.999999999999999e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000837992  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1778  decaheme cytochrome c  30.56 
 
 		 671 aa  237  5.0000000000000005e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4048  hypothetical protein  26.53 
 
 		 764 aa  220  7.999999999999999e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3466  hypothetical protein  26.44 
 
 		 785 aa  211  4e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.724503 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2698  decaheme cytochrome c  29.61 
 
 		 671 aa  210  8e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0681671  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1525  decaheme cytochrome c  28.51 
 
 		 660 aa  194  6e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.100516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3286  hypothetical protein  26.53 
 
 		 714 aa  179  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.909593  hitchhiker  0.000000468411 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2292  hypothetical protein  24.36 
 
 		 782 aa  137  8e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2696  hypothetical protein  26.15 
 
 		 822 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2509  decaheme cytochrome c  24.32 
 
 		 731 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000184393  hitchhiker  0.000632353 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2522  decaheme cytochrome c  25.5 
 
 		 720 aa  127  5e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1479  hypothetical protein  24.03 
 
 		 833 aa  127  5e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0424195  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2577  decaheme cytochrome c  24.63 
 
 		 731 aa  126  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00883016  decreased coverage  0.00925289 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1779  decaheme cytochrome c  25.62 
 
 		 735 aa  125  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1209  decaheme cytochrome c  24.33 
 
 		 729 aa  124  7e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00658895  normal  0.327868 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3588  decaheme cytochrome c  24.25 
 
 		 745 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2603  hypothetical protein  27.74 
 
 		 742 aa  120  7e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430741  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1210  decaheme cytochrome c  25.63 
 
 		 727 aa  120  9e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.260087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0918  decaheme cytochrome c  23.57 
 
 		 764 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.613412  normal  0.552776 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1579  decaheme cytochrome c  24.39 
 
 		 730 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00874065  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1526  decaheme cytochrome c  22.94 
 
 		 738 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.324001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1345  multiheme cytochrome  26.23 
 
 		 742 aa  118  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4083  hypothetical protein  25.48 
 
 		 826 aa  117  6e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0344261  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1590  decaheme cytochrome c  24.25 
 
 		 730 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000452412  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1613  decaheme cytochrome c  24.11 
 
 		 730 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000196014  normal  0.166254 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1244  hypothetical protein  26.8 
 
 		 742 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0505071  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3371  hypothetical protein  22.87 
 
 		 895 aa  114  6e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.94917  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2764  hypothetical protein  23.59 
 
 		 843 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.185672  hitchhiker  0.000000808171 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1527  decaheme cytochrome c  23.4 
 
 		 722 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4080  hypothetical protein  22.63 
 
 		 936 aa  108  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000183317  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2675  decaheme cytochrome c  23.92 
 
 		 724 aa  108  4e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000733685  normal  0.0455406 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2695  decaheme cytochrome c  23.67 
 
 		 719 aa  107  9e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.734788  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2636  decaheme cytochrome c  25.47 
 
 		 724 aa  106  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2697  decaheme cytochrome c  22.98 
 
 		 745 aa  104  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0633196  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2228  decaheme cytochrome c  24.02 
 
 		 755 aa  103  8e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.236086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2787  decaheme cytochrome c  25.45 
 
 		 762 aa  102  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0256712 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1380  decaheme cytochrome c  25.04 
 
 		 765 aa  101  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3573  decaheme cytochrome c  24.93 
 
 		 716 aa  101  5e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1478  decaheme cytochrome c  23.97 
 
 		 761 aa  98.6  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.174618  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0998  decaheme cytochrome c  22.93 
 
 		 766 aa  98.2  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1509  decaheme cytochrome c  23.65 
 
 		 764 aa  98.2  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.130709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4079  hypothetical protein  25.14 
 
 		 885 aa  97.8  5e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.299167  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1473  decaheme cytochrome c  23.97 
 
 		 761 aa  97.4  6e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000262006  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2874  decaheme cytochrome c  23.52 
 
 		 764 aa  97.1  9e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0594793  hitchhiker  0.00000891097 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1731  multiheme cytochrome  26.77 
 
 		 898 aa  95.9  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1658  hypothetical protein  26.77 
 
 		 898 aa  96.3  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.131846  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3124  decaheme cytochrome c  23.24 
 
 		 741 aa  94  8e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00184772  hitchhiker  0.000042193 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2613  decaheme cytochrome c  24.95 
 
 		 762 aa  92.8  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000355284  hitchhiker  0.00000740819 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2680  decaheme cytochrome c  25 
 
 		 762 aa  92.4  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.463028  unclonable  0.0000643351 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1659  decaheme cytochrome c  25.18 
 
 		 758 aa  92  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2524  decaheme cytochrome c  23.36 
 
 		 725 aa  92  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000418395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2216  hypothetical protein  26.43 
 
 		 898 aa  91.3  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.352223  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0910  hypothetical protein  21.65 
 
 		 731 aa  89.7  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.688824 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4254  decaheme cytochrome c  22.79 
 
 		 729 aa  90.5  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.353597  unclonable  0.0000000280036 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0447  hypothetical protein  23.57 
 
 		 612 aa  87.4  8e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.476837 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2299  hypothetical protein  24.06 
 
 		 809 aa  87  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3200  hypothetical protein  23.48 
 
 		 820 aa  85.5  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1257  hypothetical protein  23.05 
 
 		 762 aa  84  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3251  hypothetical protein  24.67 
 
 		 788 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3108  hypothetical protein  24.76 
 
 		 788 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0875  hypothetical protein  23.38 
 
 		 893 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0421546 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3098  hypothetical protein  24.67 
 
 		 789 aa  77  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1187  hypothetical protein  23.42 
 
 		 778 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1268  hypothetical protein  24.48 
 
 		 789 aa  72  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.487663  hitchhiker  0.00130496 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3263  hypothetical protein  29.57 
 
 		 655 aa  71.6  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003776  decaheme cytochrome c MtrF  28.02 
 
 		 754 aa  69.7  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2580  hypothetical protein  23.61 
 
 		 677 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4517  hypothetical protein  30.77 
 
 		 642 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.247929 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0913  decaheme cytochrome c  22.06 
 
 		 770 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.546873  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2990  hypothetical protein  23.58 
 
 		 680 aa  64.7  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1409  hypothetical protein  28.36 
 
 		 696 aa  62.4  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1356  hypothetical protein  28.36 
 
 		 696 aa  61.6  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0734371 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1713  hypothetical protein  24.58 
 
 		 945 aa  61.2  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.436521  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2862  hypothetical protein  27 
 
 		 698 aa  60.5  0.00000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2507  hypothetical protein  28.28 
 
 		 700 aa  60.1  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116766  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2523  hypothetical protein  29.14 
 
 		 757 aa  59.3  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2991  hypothetical protein  27 
 
 		 701 aa  59.3  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>