84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2523 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2523  hypothetical protein  100 
 
 		 757 aa  1566    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1209  decaheme cytochrome c  28.47 
 
 		 729 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00658895  normal  0.327868 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2509  decaheme cytochrome c  28.38 
 
 		 731 aa  172  1e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000184393  hitchhiker  0.000632353 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2577  decaheme cytochrome c  28 
 
 		 731 aa  171  7e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00883016  decreased coverage  0.00925289 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2524  decaheme cytochrome c  28.5 
 
 		 725 aa  167  6.9999999999999995e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000418395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2695  decaheme cytochrome c  27.37 
 
 		 719 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.734788  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1779  decaheme cytochrome c  27.54 
 
 		 735 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3124  decaheme cytochrome c  26.79 
 
 		 741 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00184772  hitchhiker  0.000042193 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2675  decaheme cytochrome c  27.68 
 
 		 724 aa  162  3e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000733685  normal  0.0455406 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1590  decaheme cytochrome c  26.62 
 
 		 730 aa  159  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000452412  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1613  decaheme cytochrome c  26.62 
 
 		 730 aa  159  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000196014  normal  0.166254 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1579  decaheme cytochrome c  26.74 
 
 		 730 aa  159  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00874065  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1526  decaheme cytochrome c  26.54 
 
 		 738 aa  158  4e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.324001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2697  decaheme cytochrome c  25.94 
 
 		 745 aa  154  5.9999999999999996e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0633196  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1527  decaheme cytochrome c  26.2 
 
 		 722 aa  146  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2696  hypothetical protein  23.68 
 
 		 822 aa  145  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1210  decaheme cytochrome c  25.79 
 
 		 727 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.260087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2636  decaheme cytochrome c  25.4 
 
 		 724 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2522  decaheme cytochrome c  25.88 
 
 		 720 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2764  hypothetical protein  24.41 
 
 		 843 aa  114  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.185672  hitchhiker  0.000000808171 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1187  hypothetical protein  24.58 
 
 		 778 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3108  hypothetical protein  23.91 
 
 		 788 aa  99.4  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3588  decaheme cytochrome c  23.19 
 
 		 745 aa  98.2  5e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1268  hypothetical protein  23.37 
 
 		 789 aa  97.8  7e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.487663  hitchhiker  0.00130496 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3098  hypothetical protein  23.59 
 
 		 789 aa  91.3  6e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1479  hypothetical protein  28.43 
 
 		 833 aa  90.1  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0424195  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3125  decaheme cytochrome c  22.49 
 
 		 667 aa  89.7  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00001045  hitchhiker  0.00000606277 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3251  hypothetical protein  22.92 
 
 		 788 aa  88.6  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003776  decaheme cytochrome c MtrF  22.2 
 
 		 754 aa  84.3  0.000000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1478  decaheme cytochrome c  23.94 
 
 		 663 aa  75.5  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000254716  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2576  decaheme cytochrome c MtrF  24.33 
 
 		 639 aa  75.5  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.134423  decreased coverage  0.00876105 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2676  decaheme cytochrome c  22.38 
 
 		 650 aa  75.1  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000503474  normal  0.0214929 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2508  decaheme cytochrome c MtrF  24.33 
 
 		 639 aa  74.7  0.000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00292179  decreased coverage  0.000509076 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2698  decaheme cytochrome c  24.56 
 
 		 671 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0681671  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2578  decaheme cytochrome c  22.19 
 
 		 650 aa  73.9  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00427395  decreased coverage  0.00803379 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2674  decaheme cytochrome c MtrF  24.33 
 
 		 639 aa  73.9  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0899912  normal  0.105553 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4254  decaheme cytochrome c  22.33 
 
 		 729 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.353597  unclonable  0.0000000280036 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2510  decaheme cytochrome c  22.67 
 
 		 655 aa  72  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0178218  hitchhiker  0.000666167 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0998  decaheme cytochrome c  21.99 
 
 		 766 aa  70.9  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1211  decaheme cytochrome c MtrF  29.89 
 
 		 639 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1780  decaheme cytochrome c MtrF  23.54 
 
 		 639 aa  67.8  0.0000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2521  decaheme cytochrome c MtrF  25.64 
 
 		 639 aa  67.4  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1528  decaheme cytochrome c MtrF  24.4 
 
 		 646 aa  63.2  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1525  decaheme cytochrome c  22.97 
 
 		 660 aa  62.8  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.100516  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1778  decaheme cytochrome c  24.51 
 
 		 671 aa  58.9  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1421  hypothetical protein  28.06 
 
 		 657 aa  58.9  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.515821 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1208  decaheme cytochrome c  22.65 
 
 		 656 aa  59.3  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.474569  normal  0.550051 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0918  decaheme cytochrome c  22.48 
 
 		 764 aa  57.8  0.0000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.613412  normal  0.552776 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3286  hypothetical protein  22.14 
 
 		 714 aa  57  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.909593  hitchhiker  0.000000468411 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2525  decaheme cytochrome c  26.2 
 
 		 656 aa  56.2  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000837992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1580  decaheme cytochrome c MtrF  22.08 
 
 		 639 aa  55.5  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0766819  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2637  decaheme cytochrome c  23.36 
 
 		 653 aa  55.1  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2694  decaheme cytochrome c MtrF  26.46 
 
 		 640 aa  55.1  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1591  decaheme cytochrome c MtrF  22.3 
 
 		 639 aa  54.7  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000158979  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1614  decaheme cytochrome c MtrF  22.05 
 
 		 639 aa  54.7  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0474266  normal  0.168927 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1589  decaheme cytochrome c  21.99 
 
 		 650 aa  54.3  0.000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000235795  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2765  decaheme cytochrome c  21.99 
 
 		 650 aa  53.9  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00105295  hitchhiker  0.000000731399 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2763  decaheme cytochrome c MtrF  22.05 
 
 		 639 aa  53.5  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0120659  hitchhiker  0.0000444921 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2216  hypothetical protein  23.59 
 
 		 898 aa  52.4  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.352223  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1659  decaheme cytochrome c  29.05 
 
 		 758 aa  52  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2787  decaheme cytochrome c  29.19 
 
 		 762 aa  51.6  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0256712 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1380  decaheme cytochrome c  28.11 
 
 		 765 aa  50.8  0.00009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4083  hypothetical protein  28.19 
 
 		 826 aa  50.8  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0344261  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2874  decaheme cytochrome c  30.27 
 
 		 764 aa  50.4  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0594793  hitchhiker  0.00000891097 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1478  decaheme cytochrome c  30.27 
 
 		 761 aa  50.4  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.174618  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1612  decaheme cytochrome c  36.47 
 
 		 650 aa  50.1  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0130523  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1509  decaheme cytochrome c  30.27 
 
 		 764 aa  50.8  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.130709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1578  decaheme cytochrome c  36.47 
 
 		 650 aa  50.8  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000205402  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1473  decaheme cytochrome c  30.27 
 
 		 761 aa  50.8  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000262006  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2990  hypothetical protein  22.94 
 
 		 680 aa  50.1  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2613  decaheme cytochrome c  28.65 
 
 		 762 aa  49.3  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000355284  hitchhiker  0.00000740819 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2680  decaheme cytochrome c  28.65 
 
 		 762 aa  48.9  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.463028  unclonable  0.0000643351 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4079  hypothetical protein  24.8 
 
 		 885 aa  48.1  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.299167  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1658  hypothetical protein  22.74 
 
 		 898 aa  48.5  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.131846  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1731  multiheme cytochrome  22.74 
 
 		 898 aa  48.1  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4048  hypothetical protein  25 
 
 		 764 aa  47.8  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3573  decaheme cytochrome c  22.28 
 
 		 716 aa  47.4  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1356  hypothetical protein  35.59 
 
 		 696 aa  46.2  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0734371 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3263  hypothetical protein  22.99 
 
 		 655 aa  46.6  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0963  hypothetical protein  22.5 
 
 		 816 aa  45.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.830117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4517  hypothetical protein  26.98 
 
 		 642 aa  44.7  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.247929 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1409  hypothetical protein  34.19 
 
 		 696 aa  44.3  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0450  hypothetical protein  35.87 
 
 		 687 aa  44.3  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0447  hypothetical protein  37.5 
 
 		 612 aa  43.9  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.476837 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>