105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2509 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1779  decaheme cytochrome c  73.76 
 
 		 735 aa  1083    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2509  decaheme cytochrome c  100 
 
 		 731 aa  1523    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000184393  hitchhiker  0.000632353 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2577  decaheme cytochrome c  93.71 
 
 		 731 aa  1392    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00883016  decreased coverage  0.00925289 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2636  decaheme cytochrome c  61.14 
 
 		 724 aa  894    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2675  decaheme cytochrome c  87.3 
 
 		 724 aa  1288    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000733685  normal  0.0455406 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1209  decaheme cytochrome c  68.38 
 
 		 729 aa  1037    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00658895  normal  0.327868 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1210  decaheme cytochrome c  65.98 
 
 		 727 aa  1015    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.260087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1590  decaheme cytochrome c  83.47 
 
 		 730 aa  1251    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000452412  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2522  decaheme cytochrome c  64.03 
 
 		 720 aa  934    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2524  decaheme cytochrome c  69.06 
 
 		 725 aa  1068    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000418395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1579  decaheme cytochrome c  83.2 
 
 		 730 aa  1252    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00874065  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1526  decaheme cytochrome c  59.76 
 
 		 738 aa  890    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.324001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1527  decaheme cytochrome c  67.23 
 
 		 722 aa  991    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2695  decaheme cytochrome c  64.72 
 
 		 719 aa  968    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.734788  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2697  decaheme cytochrome c  52.4 
 
 		 745 aa  768    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0633196  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1613  decaheme cytochrome c  83.47 
 
 		 730 aa  1252    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000196014  normal  0.166254 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3124  decaheme cytochrome c  55.64 
 
 		 741 aa  826    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00184772  hitchhiker  0.000042193 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3588  decaheme cytochrome c  36.65 
 
 		 745 aa  451  1e-125  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4254  decaheme cytochrome c  37.52 
 
 		 729 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.353597  unclonable  0.0000000280036 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3573  decaheme cytochrome c  35.58 
 
 		 716 aa  432  1e-120  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2696  hypothetical protein  35.96 
 
 		 822 aa  208  3e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2523  hypothetical protein  28.38 
 
 		 757 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2764  hypothetical protein  38.1 
 
 		 843 aa  194  3e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.185672  hitchhiker  0.000000808171 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1479  hypothetical protein  29.01 
 
 		 833 aa  192  1e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0424195  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3108  hypothetical protein  27.03 
 
 		 788 aa  193  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3098  hypothetical protein  26.49 
 
 		 789 aa  184  7e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1268  hypothetical protein  26.28 
 
 		 789 aa  180  9e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.487663  hitchhiker  0.00130496 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1187  hypothetical protein  26.02 
 
 		 778 aa  179  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3251  hypothetical protein  26.28 
 
 		 788 aa  175  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1780  decaheme cytochrome c MtrF  26.08 
 
 		 639 aa  172  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2576  decaheme cytochrome c MtrF  26.28 
 
 		 639 aa  159  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.134423  decreased coverage  0.00876105 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2508  decaheme cytochrome c MtrF  25.88 
 
 		 639 aa  158  4e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00292179  decreased coverage  0.000509076 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2674  decaheme cytochrome c MtrF  26.05 
 
 		 639 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0899912  normal  0.105553 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1591  decaheme cytochrome c MtrF  26.01 
 
 		 639 aa  156  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000158979  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1580  decaheme cytochrome c MtrF  25.85 
 
 		 639 aa  156  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0766819  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1614  decaheme cytochrome c MtrF  25.81 
 
 		 639 aa  151  4e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0474266  normal  0.168927 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2763  decaheme cytochrome c MtrF  25.61 
 
 		 639 aa  147  5e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0120659  hitchhiker  0.0000444921 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1211  decaheme cytochrome c MtrF  25.85 
 
 		 639 aa  145  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2676  decaheme cytochrome c  25.03 
 
 		 650 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000503474  normal  0.0214929 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2578  decaheme cytochrome c  25.16 
 
 		 650 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00427395  decreased coverage  0.00803379 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1528  decaheme cytochrome c MtrF  25.9 
 
 		 646 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1589  decaheme cytochrome c  26.13 
 
 		 650 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000235795  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1578  decaheme cytochrome c  25.99 
 
 		 650 aa  135  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000205402  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1612  decaheme cytochrome c  25.43 
 
 		 650 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0130523  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2765  decaheme cytochrome c  24.87 
 
 		 650 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00105295  hitchhiker  0.000000731399 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2521  decaheme cytochrome c MtrF  24.51 
 
 		 639 aa  125  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2694  decaheme cytochrome c MtrF  25.18 
 
 		 640 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1208  decaheme cytochrome c  24.35 
 
 		 656 aa  118  3e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.474569  normal  0.550051 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2216  hypothetical protein  28.29 
 
 		 898 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.352223  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1658  hypothetical protein  29.02 
 
 		 898 aa  115  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.131846  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1731  multiheme cytochrome  29.02 
 
 		 898 aa  114  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3125  decaheme cytochrome c  22.94 
 
 		 667 aa  112  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00001045  hitchhiker  0.00000606277 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1778  decaheme cytochrome c  23.67 
 
 		 671 aa  109  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6275  decaheme c-type cytochrome, OmcA/MtrC family  25.96 
 
 		 741 aa  106  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.772817 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1478  decaheme cytochrome c  23.2 
 
 		 663 aa  105  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000254716  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3200  hypothetical protein  31.32 
 
 		 820 aa  101  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2510  decaheme cytochrome c  23.61 
 
 		 655 aa  101  6e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0178218  hitchhiker  0.000666167 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4083  hypothetical protein  27.88 
 
 		 826 aa  100  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0344261  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2292  hypothetical protein  28.11 
 
 		 782 aa  99.8  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2637  decaheme cytochrome c  22.91 
 
 		 653 aa  93.6  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0998  decaheme cytochrome c  24.55 
 
 		 766 aa  93.6  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2698  decaheme cytochrome c  24.51 
 
 		 671 aa  93.2  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0681671  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0918  decaheme cytochrome c  23.19 
 
 		 764 aa  90.1  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.613412  normal  0.552776 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1345  multiheme cytochrome  25.77 
 
 		 742 aa  89.4  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2299  hypothetical protein  27.91 
 
 		 809 aa  87.4  9e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2603  hypothetical protein  25.63 
 
 		 742 aa  85.9  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430741  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1244  hypothetical protein  25.77 
 
 		 742 aa  85.5  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0505071  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3286  hypothetical protein  23.03 
 
 		 714 aa  85.5  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.909593  hitchhiker  0.000000468411 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1525  decaheme cytochrome c  23.46 
 
 		 660 aa  82  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.100516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1257  hypothetical protein  23.39 
 
 		 762 aa  81.3  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0913  decaheme cytochrome c  24.01 
 
 		 770 aa  77  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.546873  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2228  decaheme cytochrome c  22.96 
 
 		 755 aa  74.7  0.000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.236086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0910  hypothetical protein  23.64 
 
 		 731 aa  73.6  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.688824 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2525  decaheme cytochrome c  25.17 
 
 		 656 aa  73.9  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000837992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3466  hypothetical protein  24.19 
 
 		 785 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.724503 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1421  hypothetical protein  22.88 
 
 		 657 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.515821 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4048  hypothetical protein  20.45 
 
 		 764 aa  68.6  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4079  hypothetical protein  25.96 
 
 		 885 aa  68.2  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.299167  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0963  hypothetical protein  21.97 
 
 		 816 aa  66.6  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.830117  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0875  hypothetical protein  24.72 
 
 		 893 aa  60.8  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0421546 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2379  hypothetical protein  25.32 
 
 		 1111 aa  60.1  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.49944  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003776  decaheme cytochrome c MtrF  21.14 
 
 		 754 aa  59.3  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3371  hypothetical protein  22.68 
 
 		 895 aa  59.7  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.94917  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1409  hypothetical protein  21.86 
 
 		 696 aa  59.3  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1713  hypothetical protein  24.45 
 
 		 945 aa  58.9  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.436521  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1356  hypothetical protein  21.58 
 
 		 696 aa  58.9  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0734371 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2507  hypothetical protein  28.57 
 
 		 700 aa  58.2  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116766  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2862  hypothetical protein  23.33 
 
 		 698 aa  53.9  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4080  hypothetical protein  23.74 
 
 		 936 aa  52.8  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000183317  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2613  decaheme cytochrome c  23.24 
 
 		 762 aa  52.8  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000355284  hitchhiker  0.00000740819 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2843  hypothetical protein  23.09 
 
 		 701 aa  52.4  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2991  hypothetical protein  23.09 
 
 		 701 aa  52.4  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1515  hypothetical protein  23.09 
 
 		 701 aa  52.4  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2990  hypothetical protein  24.35 
 
 		 680 aa  50.8  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0450  hypothetical protein  27.68 
 
 		 687 aa  49.7  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4517  hypothetical protein  28.42 
 
 		 642 aa  48.9  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.247929 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1380  decaheme cytochrome c  25.48 
 
 		 765 aa  48.5  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2787  decaheme cytochrome c  26.23 
 
 		 762 aa  48.1  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0256712 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2580  hypothetical protein  21.9 
 
 		 677 aa  47.8  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0447  hypothetical protein  21.36 
 
 		 612 aa  46.2  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.476837 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>