104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3371 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0875  hypothetical protein  60.41 
 
 		 893 aa  1069    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0421546 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3371  hypothetical protein  100 
 
 		 895 aa  1835    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.94917  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2292  hypothetical protein  43.7 
 
 		 782 aa  598  1e-169  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4080  hypothetical protein  40.88 
 
 		 936 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000183317  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4079  hypothetical protein  34.09 
 
 		 885 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.299167  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1713  hypothetical protein  33.13 
 
 		 945 aa  398  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.436521  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2299  hypothetical protein  41.67 
 
 		 809 aa  328  3e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4083  hypothetical protein  26.81 
 
 		 826 aa  181  5.999999999999999e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0344261  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0910  hypothetical protein  26.55 
 
 		 731 aa  154  5.9999999999999996e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.688824 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3200  hypothetical protein  25.18 
 
 		 820 aa  143  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1244  hypothetical protein  24.8 
 
 		 742 aa  142  3e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0505071  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2603  hypothetical protein  24.58 
 
 		 742 aa  139  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430741  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1345  multiheme cytochrome  25.17 
 
 		 742 aa  133  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1780  decaheme cytochrome c MtrF  23.81 
 
 		 639 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2576  decaheme cytochrome c MtrF  23.54 
 
 		 639 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.134423  decreased coverage  0.00876105 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2508  decaheme cytochrome c MtrF  23.6 
 
 		 639 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00292179  decreased coverage  0.000509076 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2674  decaheme cytochrome c MtrF  23.54 
 
 		 639 aa  127  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0899912  normal  0.105553 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1580  decaheme cytochrome c MtrF  23.6 
 
 		 639 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0766819  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1614  decaheme cytochrome c MtrF  23.4 
 
 		 639 aa  123  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0474266  normal  0.168927 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2763  decaheme cytochrome c MtrF  23.48 
 
 		 639 aa  121  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0120659  hitchhiker  0.0000444921 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1528  decaheme cytochrome c MtrF  22.71 
 
 		 646 aa  120  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1591  decaheme cytochrome c MtrF  23.9 
 
 		 639 aa  119  3e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000158979  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2680  decaheme cytochrome c  24.17 
 
 		 762 aa  114  6e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.463028  unclonable  0.0000643351 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2613  decaheme cytochrome c  24.17 
 
 		 762 aa  114  9e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000355284  hitchhiker  0.00000740819 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2521  decaheme cytochrome c MtrF  23.45 
 
 		 639 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1268  hypothetical protein  22.15 
 
 		 789 aa  112  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.487663  hitchhiker  0.00130496 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2787  decaheme cytochrome c  23.68 
 
 		 762 aa  111  6e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0256712 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3098  hypothetical protein  23.05 
 
 		 789 aa  110  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1257  hypothetical protein  26.25 
 
 		 762 aa  110  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1731  multiheme cytochrome  26.24 
 
 		 898 aa  107  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0918  decaheme cytochrome c  23.75 
 
 		 764 aa  106  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.613412  normal  0.552776 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3251  hypothetical protein  22.92 
 
 		 788 aa  105  4e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1658  hypothetical protein  26.12 
 
 		 898 aa  105  4e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.131846  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1211  decaheme cytochrome c MtrF  22.98 
 
 		 639 aa  104  7e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2216  hypothetical protein  25.75 
 
 		 898 aa  102  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.352223  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6275  decaheme c-type cytochrome, OmcA/MtrC family  23.54 
 
 		 741 aa  100  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.772817 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2694  decaheme cytochrome c MtrF  22.8 
 
 		 640 aa  99  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1589  decaheme cytochrome c  26.9 
 
 		 650 aa  98.2  5e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000235795  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2874  decaheme cytochrome c  22.82 
 
 		 764 aa  98.6  5e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0594793  hitchhiker  0.00000891097 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1478  decaheme cytochrome c  22.82 
 
 		 761 aa  98.2  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.174618  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1578  decaheme cytochrome c  26.9 
 
 		 650 aa  98.2  6e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000205402  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2765  decaheme cytochrome c  26.57 
 
 		 650 aa  98.2  6e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00105295  hitchhiker  0.000000731399 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1612  decaheme cytochrome c  26.34 
 
 		 650 aa  97.8  7e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0130523  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1509  decaheme cytochrome c  22.82 
 
 		 764 aa  97.8  8e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.130709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1473  decaheme cytochrome c  22.68 
 
 		 761 aa  97.8  9e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000262006  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1659  decaheme cytochrome c  22.72 
 
 		 758 aa  97.4  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0913  decaheme cytochrome c  23.75 
 
 		 770 aa  96.7  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.546873  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1208  decaheme cytochrome c  25.06 
 
 		 656 aa  95.1  5e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.474569  normal  0.550051 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2676  decaheme cytochrome c  25.85 
 
 		 650 aa  94.4  9e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000503474  normal  0.0214929 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1380  decaheme cytochrome c  22.48 
 
 		 765 aa  91.7  6e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3466  hypothetical protein  24.8 
 
 		 785 aa  89  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.724503 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2578  decaheme cytochrome c  24.6 
 
 		 650 aa  88.6  5e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00427395  decreased coverage  0.00803379 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0998  decaheme cytochrome c  22.58 
 
 		 766 aa  88.2  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0963  hypothetical protein  24.15 
 
 		 816 aa  88.2  6e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.830117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3108  hypothetical protein  24.79 
 
 		 788 aa  86.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1187  hypothetical protein  25 
 
 		 778 aa  84.7  0.000000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1478  decaheme cytochrome c  23.38 
 
 		 663 aa  84.7  0.000000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000254716  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4254  decaheme cytochrome c  22.1 
 
 		 729 aa  84.7  0.000000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.353597  unclonable  0.0000000280036 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3573  decaheme cytochrome c  22.77 
 
 		 716 aa  82.4  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2636  decaheme cytochrome c  25.59 
 
 		 724 aa  80.9  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3588  decaheme cytochrome c  25.59 
 
 		 745 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2379  hypothetical protein  27.36 
 
 		 1111 aa  72.4  0.00000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.49944  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1526  decaheme cytochrome c  24.14 
 
 		 738 aa  72  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.324001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2228  decaheme cytochrome c  22.93 
 
 		 755 aa  71.2  0.00000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.236086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2764  hypothetical protein  22.08 
 
 		 843 aa  71.2  0.00000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.185672  hitchhiker  0.000000808171 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3286  hypothetical protein  22.26 
 
 		 714 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.909593  hitchhiker  0.000000468411 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2696  hypothetical protein  24.94 
 
 		 822 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2522  decaheme cytochrome c  24.11 
 
 		 720 aa  68.6  0.0000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3125  decaheme cytochrome c  22.63 
 
 		 667 aa  68.2  0.0000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00001045  hitchhiker  0.00000606277 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2637  decaheme cytochrome c  22.06 
 
 		 653 aa  67.8  0.0000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2524  decaheme cytochrome c  23.79 
 
 		 725 aa  67.8  0.0000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000418395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2695  decaheme cytochrome c  25.35 
 
 		 719 aa  66.6  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.734788  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003776  decaheme cytochrome c MtrF  22.82 
 
 		 754 aa  65.9  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1527  decaheme cytochrome c  25.6 
 
 		 722 aa  65.1  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2697  decaheme cytochrome c  23.47 
 
 		 745 aa  63.9  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0633196  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3124  decaheme cytochrome c  22.98 
 
 		 741 aa  63.2  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00184772  hitchhiker  0.000042193 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1479  hypothetical protein  22.42 
 
 		 833 aa  61.6  0.00000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0424195  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3163  hypothetical protein  24.74 
 
 		 857 aa  60.8  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1209  decaheme cytochrome c  22.02 
 
 		 729 aa  60.5  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00658895  normal  0.327868 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1779  decaheme cytochrome c  22.8 
 
 		 735 aa  58.9  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2992  hypothetical protein  22.79 
 
 		 781 aa  57.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.507941  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2509  decaheme cytochrome c  21.99 
 
 		 731 aa  55.1  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000184393  hitchhiker  0.000632353 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2577  decaheme cytochrome c  22.4 
 
 		 731 aa  55.1  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00883016  decreased coverage  0.00925289 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1778  decaheme cytochrome c  23.4 
 
 		 671 aa  53.9  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2675  decaheme cytochrome c  21.94 
 
 		 724 aa  53.5  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000733685  normal  0.0455406 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1590  decaheme cytochrome c  24.41 
 
 		 730 aa  53.1  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000452412  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1579  decaheme cytochrome c  23.7 
 
 		 730 aa  53.5  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00874065  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3097  hypothetical protein  22.75 
 
 		 781 aa  53.5  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4048  hypothetical protein  21.88 
 
 		 764 aa  52.4  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2907  hypothetical protein  21.63 
 
 		 793 aa  52.4  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1613  decaheme cytochrome c  24.15 
 
 		 730 aa  51.2  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000196014  normal  0.166254 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1525  decaheme cytochrome c  24.57 
 
 		 660 aa  50.8  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.100516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1210  decaheme cytochrome c  22.07 
 
 		 727 aa  49.7  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.260087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3353  hypothetical protein  46 
 
 		 856 aa  49.3  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3279  hypothetical protein  46.81 
 
 		 854 aa  47.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2510  decaheme cytochrome c  21.36 
 
 		 655 aa  46.6  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0178218  hitchhiker  0.000666167 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2525  decaheme cytochrome c  23.35 
 
 		 656 aa  46.6  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000837992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2507  hypothetical protein  32.56 
 
 		 700 aa  47  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116766  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2698  decaheme cytochrome c  30.26 
 
 		 671 aa  47  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0681671  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2843  hypothetical protein  31.65 
 
 		 701 aa  45.1  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>