112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_4080 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_4080  hypothetical protein  100 
 
 		 936 aa  1892    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000183317  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3371  hypothetical protein  39.56 
 
 		 895 aa  568  1e-160  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.94917  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0875  hypothetical protein  37.94 
 
 		 893 aa  543  1e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0421546 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2292  hypothetical protein  39.76 
 
 		 782 aa  531  1e-149  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4079  hypothetical protein  38.69 
 
 		 885 aa  476  1e-132  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.299167  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1713  hypothetical protein  33.93 
 
 		 945 aa  419  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.436521  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2299  hypothetical protein  32.87 
 
 		 809 aa  326  2e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4083  hypothetical protein  28.17 
 
 		 826 aa  200  9e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0344261  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0910  hypothetical protein  26.25 
 
 		 731 aa  158  4e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.688824 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2603  hypothetical protein  27.03 
 
 		 742 aa  147  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430741  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1244  hypothetical protein  26.69 
 
 		 742 aa  142  3e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0505071  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1345  multiheme cytochrome  26.58 
 
 		 742 aa  140  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3200  hypothetical protein  26.26 
 
 		 820 aa  136  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6275  decaheme c-type cytochrome, OmcA/MtrC family  24 
 
 		 741 aa  131  5.0000000000000004e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.772817 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1780  decaheme cytochrome c MtrF  22.23 
 
 		 639 aa  127  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2763  decaheme cytochrome c MtrF  23.06 
 
 		 639 aa  126  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0120659  hitchhiker  0.0000444921 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1614  decaheme cytochrome c MtrF  23.06 
 
 		 639 aa  125  4e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0474266  normal  0.168927 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2674  decaheme cytochrome c MtrF  22.57 
 
 		 639 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0899912  normal  0.105553 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1580  decaheme cytochrome c MtrF  22.04 
 
 		 639 aa  122  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0766819  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2508  decaheme cytochrome c MtrF  22.54 
 
 		 639 aa  121  6e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00292179  decreased coverage  0.000509076 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1591  decaheme cytochrome c MtrF  23.33 
 
 		 639 aa  121  6e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000158979  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2576  decaheme cytochrome c MtrF  22.46 
 
 		 639 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.134423  decreased coverage  0.00876105 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1731  multiheme cytochrome  27.04 
 
 		 898 aa  118  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2216  hypothetical protein  26.71 
 
 		 898 aa  115  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.352223  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1658  hypothetical protein  27.08 
 
 		 898 aa  115  5e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.131846  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1528  decaheme cytochrome c MtrF  23.22 
 
 		 646 aa  111  7.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1257  hypothetical protein  25.69 
 
 		 762 aa  110  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2521  decaheme cytochrome c MtrF  22.76 
 
 		 639 aa  109  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1211  decaheme cytochrome c MtrF  23.95 
 
 		 639 aa  102  4e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2694  decaheme cytochrome c MtrF  21.64 
 
 		 640 aa  98.2  6e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2613  decaheme cytochrome c  24.21 
 
 		 762 aa  92.8  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000355284  hitchhiker  0.00000740819 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0963  hypothetical protein  26.08 
 
 		 816 aa  92.8  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.830117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2680  decaheme cytochrome c  24.21 
 
 		 762 aa  92.4  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.463028  unclonable  0.0000643351 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1187  hypothetical protein  24.79 
 
 		 778 aa  87.8  8e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0918  decaheme cytochrome c  23.67 
 
 		 764 aa  84  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.613412  normal  0.552776 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2787  decaheme cytochrome c  24.38 
 
 		 762 aa  83.2  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0256712 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3466  hypothetical protein  23.87 
 
 		 785 aa  82.8  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.724503 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2524  decaheme cytochrome c  25.17 
 
 		 725 aa  81.3  0.00000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000418395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1380  decaheme cytochrome c  24.86 
 
 		 765 aa  81.3  0.00000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1659  decaheme cytochrome c  23.8 
 
 		 758 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1509  decaheme cytochrome c  23.51 
 
 		 764 aa  80.1  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.130709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1478  decaheme cytochrome c  23.36 
 
 		 761 aa  79  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.174618  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1473  decaheme cytochrome c  23.36 
 
 		 761 aa  79  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000262006  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2874  decaheme cytochrome c  23.36 
 
 		 764 aa  79  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0594793  hitchhiker  0.00000891097 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2636  decaheme cytochrome c  25.7 
 
 		 724 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2695  decaheme cytochrome c  23.88 
 
 		 719 aa  76.3  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.734788  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3588  decaheme cytochrome c  23.68 
 
 		 745 aa  73.9  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0913  decaheme cytochrome c  21.07 
 
 		 770 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.546873  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3108  hypothetical protein  23.91 
 
 		 788 aa  72  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4048  hypothetical protein  21.56 
 
 		 764 aa  72  0.00000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3098  hypothetical protein  23.86 
 
 		 789 aa  71.6  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1612  decaheme cytochrome c  27.04 
 
 		 650 aa  72  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0130523  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2696  hypothetical protein  22.63 
 
 		 822 aa  71.2  0.00000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1589  decaheme cytochrome c  26.73 
 
 		 650 aa  70.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000235795  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1578  decaheme cytochrome c  26.1 
 
 		 650 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000205402  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2765  decaheme cytochrome c  26.42 
 
 		 650 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00105295  hitchhiker  0.000000731399 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3251  hypothetical protein  22.71 
 
 		 788 aa  68.9  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1525  decaheme cytochrome c  22.82 
 
 		 660 aa  68.2  0.0000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.100516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1268  hypothetical protein  23.24 
 
 		 789 aa  67.8  0.0000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.487663  hitchhiker  0.00130496 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1209  decaheme cytochrome c  24.3 
 
 		 729 aa  67.4  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00658895  normal  0.327868 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3286  hypothetical protein  21.78 
 
 		 714 aa  67.4  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.909593  hitchhiker  0.000000468411 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1479  hypothetical protein  25 
 
 		 833 aa  66.6  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0424195  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3125  decaheme cytochrome c  21.57 
 
 		 667 aa  66.6  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00001045  hitchhiker  0.00000606277 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2676  decaheme cytochrome c  25.15 
 
 		 650 aa  66.2  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000503474  normal  0.0214929 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2698  decaheme cytochrome c  22.52 
 
 		 671 aa  65.9  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0681671  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2578  decaheme cytochrome c  26.07 
 
 		 650 aa  64.7  0.000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00427395  decreased coverage  0.00803379 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2228  decaheme cytochrome c  22.9 
 
 		 755 aa  64.7  0.000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.236086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2379  hypothetical protein  23.61 
 
 		 1111 aa  64.7  0.000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.49944  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2577  decaheme cytochrome c  24.94 
 
 		 731 aa  64.3  0.000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00883016  decreased coverage  0.00925289 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003776  decaheme cytochrome c MtrF  24.75 
 
 		 754 aa  63.2  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2637  decaheme cytochrome c  19.14 
 
 		 653 aa  62.8  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1526  decaheme cytochrome c  23.18 
 
 		 738 aa  62.4  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.324001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3163  hypothetical protein  22.19 
 
 		 857 aa  62  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1208  decaheme cytochrome c  22.58 
 
 		 656 aa  62  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.474569  normal  0.550051 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0998  decaheme cytochrome c  22.26 
 
 		 766 aa  61.2  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1779  decaheme cytochrome c  22.22 
 
 		 735 aa  60.5  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2507  hypothetical protein  40.74 
 
 		 700 aa  60.8  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116766  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3573  decaheme cytochrome c  24.05 
 
 		 716 aa  60.8  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2907  hypothetical protein  23.46 
 
 		 793 aa  59.7  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1527  decaheme cytochrome c  23.22 
 
 		 722 aa  59.7  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2697  decaheme cytochrome c  23.11 
 
 		 745 aa  59.3  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0633196  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1356  hypothetical protein  45.07 
 
 		 696 aa  57.8  0.0000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0734371 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2675  decaheme cytochrome c  24.26 
 
 		 724 aa  57.8  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000733685  normal  0.0455406 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2764  hypothetical protein  23.65 
 
 		 843 aa  57.8  0.0000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.185672  hitchhiker  0.000000808171 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1210  decaheme cytochrome c  24.84 
 
 		 727 aa  57.4  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.260087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2523  hypothetical protein  24.01 
 
 		 757 aa  57.4  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2522  decaheme cytochrome c  23.11 
 
 		 720 aa  57  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3279  hypothetical protein  22.52 
 
 		 854 aa  55.8  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2509  decaheme cytochrome c  23.77 
 
 		 731 aa  55.5  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000184393  hitchhiker  0.000632353 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3353  hypothetical protein  22.42 
 
 		 856 aa  55.1  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1409  hypothetical protein  43.66 
 
 		 696 aa  55.1  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2862  hypothetical protein  39.51 
 
 		 698 aa  55.1  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3124  decaheme cytochrome c  21.6 
 
 		 741 aa  54.7  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00184772  hitchhiker  0.000042193 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1778  decaheme cytochrome c  22.42 
 
 		 671 aa  54.7  0.000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2843  hypothetical protein  39.51 
 
 		 701 aa  54.7  0.000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2991  hypothetical protein  39.51 
 
 		 701 aa  54.7  0.000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1515  hypothetical protein  39.51 
 
 		 701 aa  54.7  0.000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1590  decaheme cytochrome c  24.7 
 
 		 730 aa  53.9  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000452412  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1579  decaheme cytochrome c  24.7 
 
 		 730 aa  53.9  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00874065  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4254  decaheme cytochrome c  21.83 
 
 		 729 aa  53.9  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.353597  unclonable  0.0000000280036 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>