89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4517 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4517  hypothetical protein  100 
 
 		 642 aa  1337    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.247929 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0447  hypothetical protein  58.96 
 
 		 612 aa  762    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.476837 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0450  hypothetical protein  61.15 
 
 		 687 aa  850    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3263  hypothetical protein  57.25 
 
 		 655 aa  727    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2580  hypothetical protein  44.93 
 
 		 677 aa  546  1e-154  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2990  hypothetical protein  46.02 
 
 		 680 aa  537  1e-151  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1421  hypothetical protein  43.99 
 
 		 657 aa  537  1e-151  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.515821 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1409  hypothetical protein  42.09 
 
 		 696 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1356  hypothetical protein  41.81 
 
 		 696 aa  513  1e-144  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0734371 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2507  hypothetical protein  41.74 
 
 		 700 aa  500  1e-140  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116766  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2991  hypothetical protein  43.82 
 
 		 701 aa  487  1e-136  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2843  hypothetical protein  43.82 
 
 		 701 aa  487  1e-136  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2862  hypothetical protein  43.82 
 
 		 698 aa  487  1e-136  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1515  hypothetical protein  43.82 
 
 		 701 aa  488  1e-136  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3140.2  hypothetical protein  41.61 
 
 		 310 aa  213  7e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3140.3  hypothetical protein  55.41 
 
 		 122 aa  99.4  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1614  decaheme cytochrome c MtrF  24.46 
 
 		 639 aa  97.1  8e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0474266  normal  0.168927 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1580  decaheme cytochrome c MtrF  24.64 
 
 		 639 aa  95.1  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0766819  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1211  decaheme cytochrome c MtrF  33.16 
 
 		 639 aa  73.9  0.000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2694  decaheme cytochrome c MtrF  34.03 
 
 		 640 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1187  hypothetical protein  33.51 
 
 		 778 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2521  decaheme cytochrome c MtrF  30.77 
 
 		 639 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1591  decaheme cytochrome c MtrF  33.33 
 
 		 639 aa  67.4  0.0000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000158979  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2764  hypothetical protein  34.44 
 
 		 843 aa  67.4  0.0000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.185672  hitchhiker  0.000000808171 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2763  decaheme cytochrome c MtrF  33.33 
 
 		 639 aa  66.6  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0120659  hitchhiker  0.0000444921 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1780  decaheme cytochrome c MtrF  25.83 
 
 		 639 aa  65.9  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1208  decaheme cytochrome c  22.97 
 
 		 656 aa  65.1  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.474569  normal  0.550051 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0998  decaheme cytochrome c  28.63 
 
 		 766 aa  64.7  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3108  hypothetical protein  29.51 
 
 		 788 aa  64.7  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3251  hypothetical protein  31.89 
 
 		 788 aa  64.3  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2674  decaheme cytochrome c MtrF  30.48 
 
 		 639 aa  64.7  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0899912  normal  0.105553 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1528  decaheme cytochrome c MtrF  31.02 
 
 		 646 aa  64.3  0.000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1268  hypothetical protein  29.51 
 
 		 789 aa  63.9  0.000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.487663  hitchhiker  0.00130496 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2508  decaheme cytochrome c MtrF  30.48 
 
 		 639 aa  63.5  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00292179  decreased coverage  0.000509076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2576  decaheme cytochrome c MtrF  30.69 
 
 		 639 aa  63.5  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.134423  decreased coverage  0.00876105 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2613  decaheme cytochrome c  33.68 
 
 		 762 aa  63.2  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000355284  hitchhiker  0.00000740819 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2787  decaheme cytochrome c  32.43 
 
 		 762 aa  63.2  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0256712 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0913  decaheme cytochrome c  29.73 
 
 		 770 aa  62  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.546873  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2696  hypothetical protein  29.95 
 
 		 822 aa  61.6  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3098  hypothetical protein  29.51 
 
 		 789 aa  62  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2680  decaheme cytochrome c  33.16 
 
 		 762 aa  61.6  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.463028  unclonable  0.0000643351 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2676  decaheme cytochrome c  25.63 
 
 		 650 aa  61.2  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000503474  normal  0.0214929 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1578  decaheme cytochrome c  25.4 
 
 		 650 aa  60.8  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000205402  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2695  decaheme cytochrome c  27.57 
 
 		 719 aa  60.8  0.00000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.734788  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2765  decaheme cytochrome c  25 
 
 		 650 aa  60.5  0.00000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00105295  hitchhiker  0.000000731399 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2228  decaheme cytochrome c  30.77 
 
 		 755 aa  60.5  0.00000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.236086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0918  decaheme cytochrome c  35.71 
 
 		 764 aa  60.5  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.613412  normal  0.552776 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3125  decaheme cytochrome c  23.93 
 
 		 667 aa  60.5  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00001045  hitchhiker  0.00000606277 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1589  decaheme cytochrome c  25 
 
 		 650 aa  60.1  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000235795  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2522  decaheme cytochrome c  29.15 
 
 		 720 aa  59.7  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1612  decaheme cytochrome c  25 
 
 		 650 aa  59.3  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0130523  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2636  decaheme cytochrome c  29.32 
 
 		 724 aa  59.3  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1527  decaheme cytochrome c  28 
 
 		 722 aa  59.3  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3200  hypothetical protein  28.19 
 
 		 820 aa  58.9  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1479  hypothetical protein  30.48 
 
 		 833 aa  58.5  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0424195  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2578  decaheme cytochrome c  25.63 
 
 		 650 aa  58.9  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00427395  decreased coverage  0.00803379 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1210  decaheme cytochrome c  34 
 
 		 727 aa  58.2  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.260087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1380  decaheme cytochrome c  40 
 
 		 765 aa  58.5  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0910  hypothetical protein  23.13 
 
 		 731 aa  58.2  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.688824 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1659  decaheme cytochrome c  37.5 
 
 		 758 aa  58.2  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003776  decaheme cytochrome c MtrF  29.73 
 
 		 754 aa  57  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2675  decaheme cytochrome c  30.51 
 
 		 724 aa  57  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000733685  normal  0.0455406 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2874  decaheme cytochrome c  34.62 
 
 		 764 aa  55.1  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0594793  hitchhiker  0.00000891097 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2379  hypothetical protein  27.83 
 
 		 1111 aa  55.1  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.49944  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1478  decaheme cytochrome c  34.62 
 
 		 761 aa  55.1  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.174618  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1509  decaheme cytochrome c  34.62 
 
 		 764 aa  55.1  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.130709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1473  decaheme cytochrome c  34.62 
 
 		 761 aa  54.7  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000262006  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1478  decaheme cytochrome c  21.88 
 
 		 663 aa  53.9  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000254716  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1590  decaheme cytochrome c  26.94 
 
 		 730 aa  53.1  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000452412  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1579  decaheme cytochrome c  26.94 
 
 		 730 aa  52.8  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00874065  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2637  decaheme cytochrome c  24.65 
 
 		 653 aa  52.4  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1209  decaheme cytochrome c  26.82 
 
 		 729 aa  53.1  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00658895  normal  0.327868 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1613  decaheme cytochrome c  26.94 
 
 		 730 aa  53.1  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000196014  normal  0.166254 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3588  decaheme cytochrome c  31.91 
 
 		 745 aa  52.8  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3286  hypothetical protein  27.27 
 
 		 714 aa  52.8  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.909593  hitchhiker  0.000000468411 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2524  decaheme cytochrome c  27.37 
 
 		 725 aa  52.4  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000418395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4079  hypothetical protein  23.77 
 
 		 885 aa  52.4  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.299167  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1526  decaheme cytochrome c  34.88 
 
 		 738 aa  52.4  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.324001  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1779  decaheme cytochrome c  28.02 
 
 		 735 aa  52  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1713  hypothetical protein  42.42 
 
 		 945 aa  51.6  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.436521  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3124  decaheme cytochrome c  27.07 
 
 		 741 aa  50.4  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00184772  hitchhiker  0.000042193 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2577  decaheme cytochrome c  27.72 
 
 		 731 aa  50.1  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00883016  decreased coverage  0.00925289 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2509  decaheme cytochrome c  27.37 
 
 		 731 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000184393  hitchhiker  0.000632353 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1778  decaheme cytochrome c  22.96 
 
 		 671 aa  49.3  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2697  decaheme cytochrome c  31.96 
 
 		 745 aa  47.8  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0633196  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4080  hypothetical protein  23.08 
 
 		 936 aa  46.2  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000183317  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2523  hypothetical protein  26.47 
 
 		 757 aa  45.4  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4254  decaheme cytochrome c  25.25 
 
 		 729 aa  45.8  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.353597  unclonable  0.0000000280036 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1157  alkaline phosphatase  54.29 
 
 		 545 aa  44.7  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00798229 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>