109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2874 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_1659  decaheme cytochrome c  79.35 
 
 
758 aa  1186    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2874  decaheme cytochrome c  100 
 
 
764 aa  1562    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0594793  hitchhiker  0.00000891097 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2613  decaheme cytochrome c  81.72 
 
 
762 aa  1242    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000355284  hitchhiker  0.00000740819 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2680  decaheme cytochrome c  82.25 
 
 
762 aa  1226    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.463028  unclonable  0.0000643351 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2787  decaheme cytochrome c  82.38 
 
 
762 aa  1228    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0256712 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2228  decaheme cytochrome c  53.39 
 
 
755 aa  759    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.236086  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1478  decaheme cytochrome c  99.48 
 
 
761 aa  1494    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.174618  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0918  decaheme cytochrome c  46.78 
 
 
764 aa  646    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.613412  normal  0.552776 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1380  decaheme cytochrome c  77.65 
 
 
765 aa  1154    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1473  decaheme cytochrome c  99.21 
 
 
761 aa  1492    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000262006  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1509  decaheme cytochrome c  99.74 
 
 
764 aa  1560    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.130709  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0998  decaheme cytochrome c  45.76 
 
 
766 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0913  decaheme cytochrome c  45.92 
 
 
770 aa  557  1e-157  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.546873  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1211  decaheme cytochrome c MtrF  26.19 
 
 
639 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2696  hypothetical protein  25.94 
 
 
822 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1268  hypothetical protein  25.12 
 
 
789 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.487663  hitchhiker  0.00130496 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3098  hypothetical protein  24.14 
 
 
789 aa  127  7e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1187  hypothetical protein  24.32 
 
 
778 aa  124  6e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1780  decaheme cytochrome c MtrF  24.29 
 
 
639 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3108  hypothetical protein  24.61 
 
 
788 aa  121  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3251  hypothetical protein  24.7 
 
 
788 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2637  decaheme cytochrome c  24.9 
 
 
653 aa  118  5e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1580  decaheme cytochrome c MtrF  25.1 
 
 
639 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0766819  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2508  decaheme cytochrome c MtrF  24.34 
 
 
639 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00292179  decreased coverage  0.000509076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2576  decaheme cytochrome c MtrF  24.34 
 
 
639 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.134423  decreased coverage  0.00876105 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1614  decaheme cytochrome c MtrF  25.35 
 
 
639 aa  112  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0474266  normal  0.168927 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1208  decaheme cytochrome c  25.29 
 
 
656 aa  111  5e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.474569  normal  0.550051 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2674  decaheme cytochrome c MtrF  24.47 
 
 
639 aa  110  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0899912  normal  0.105553 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1591  decaheme cytochrome c MtrF  25.03 
 
 
639 aa  110  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000158979  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2763  decaheme cytochrome c MtrF  24.44 
 
 
639 aa  105  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0120659  hitchhiker  0.0000444921 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3125  decaheme cytochrome c  22.72 
 
 
667 aa  104  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00001045  hitchhiker  0.00000606277 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1528  decaheme cytochrome c MtrF  24.38 
 
 
646 aa  100  7e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3200  hypothetical protein  26.39 
 
 
820 aa  100  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1658  hypothetical protein  36.79 
 
 
898 aa  99.8  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.131846  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2216  hypothetical protein  36.79 
 
 
898 aa  99  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.352223  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1589  decaheme cytochrome c  23.89 
 
 
650 aa  99  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000235795  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1578  decaheme cytochrome c  24.65 
 
 
650 aa  99  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000205402  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2292  hypothetical protein  24.56 
 
 
782 aa  99  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0875  hypothetical protein  23.23 
 
 
893 aa  98.2  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0421546 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2765  decaheme cytochrome c  24.52 
 
 
650 aa  98.2  5e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00105295  hitchhiker  0.000000731399 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1731  multiheme cytochrome  36.27 
 
 
898 aa  98.2  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4083  hypothetical protein  25.71 
 
 
826 aa  97.4  8e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0344261  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1612  decaheme cytochrome c  24.52 
 
 
650 aa  97.4  8e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0130523  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2299  hypothetical protein  22.88 
 
 
809 aa  97.1  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2521  decaheme cytochrome c MtrF  23.49 
 
 
639 aa  95.9  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3371  hypothetical protein  22.28 
 
 
895 aa  95.9  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.94917  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2578  decaheme cytochrome c  24.65 
 
 
650 aa  95.5  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00427395  decreased coverage  0.00803379 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2676  decaheme cytochrome c  24.77 
 
 
650 aa  94.4  7e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000503474  normal  0.0214929 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2603  hypothetical protein  25.35 
 
 
742 aa  92  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430741  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2698  decaheme cytochrome c  23.37 
 
 
671 aa  88.6  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0681671  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2694  decaheme cytochrome c MtrF  24.42 
 
 
640 aa  88.2  6e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1345  multiheme cytochrome  24.52 
 
 
742 aa  87.4  9e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1478  decaheme cytochrome c  25.41 
 
 
663 aa  87.4  9e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000254716  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2764  hypothetical protein  23.74 
 
 
843 aa  87  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.185672  hitchhiker  0.000000808171 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1244  hypothetical protein  24.78 
 
 
742 aa  86.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0505071  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1778  decaheme cytochrome c  23.89 
 
 
671 aa  85.1  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3588  decaheme cytochrome c  27.3 
 
 
745 aa  85.1  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3573  decaheme cytochrome c  25.46 
 
 
716 aa  85.1  0.000000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2525  decaheme cytochrome c  22.88 
 
 
656 aa  80.5  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000837992  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003776  decaheme cytochrome c MtrF  24.8 
 
 
754 aa  76.6  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6275  decaheme c-type cytochrome, OmcA/MtrC family  23.54 
 
 
741 aa  77  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.772817 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2510  decaheme cytochrome c  26.48 
 
 
655 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0178218  hitchhiker  0.000666167 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1210  decaheme cytochrome c  23.2 
 
 
727 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.260087  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0963  hypothetical protein  23.73 
 
 
816 aa  74.3  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.830117  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4080  hypothetical protein  22.92 
 
 
936 aa  73.6  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000183317  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4079  hypothetical protein  23.37 
 
 
885 aa  73.2  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.299167  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2522  decaheme cytochrome c  22.17 
 
 
720 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1525  decaheme cytochrome c  23.98 
 
 
660 aa  71.2  0.00000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.100516  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3286  hypothetical protein  23.24 
 
 
714 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.909593  hitchhiker  0.000000468411 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1713  hypothetical protein  26.97 
 
 
945 aa  68.9  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.436521  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1257  hypothetical protein  24.32 
 
 
762 aa  68.6  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2524  decaheme cytochrome c  21.5 
 
 
725 aa  66.6  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000418395  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1479  hypothetical protein  28.23 
 
 
833 aa  65.5  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0424195  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2636  decaheme cytochrome c  23.38 
 
 
724 aa  62.4  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1527  decaheme cytochrome c  21.81 
 
 
722 aa  60.1  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0910  hypothetical protein  23.43 
 
 
731 aa  59.3  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.688824 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2507  hypothetical protein  29.73 
 
 
700 aa  57.8  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116766  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3163  hypothetical protein  23.71 
 
 
857 aa  57.4  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2675  decaheme cytochrome c  21.6 
 
 
724 aa  57.4  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000733685  normal  0.0455406 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1356  hypothetical protein  36.08 
 
 
696 aa  56.6  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0734371 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3466  hypothetical protein  25.14 
 
 
785 aa  56.6  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.724503 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2695  decaheme cytochrome c  22.38 
 
 
719 aa  55.5  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.734788  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1409  hypothetical protein  37.11 
 
 
696 aa  55.1  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4517  hypothetical protein  34.62 
 
 
642 aa  54.7  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.247929 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3124  decaheme cytochrome c  22.34 
 
 
741 aa  54.3  0.000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00184772  hitchhiker  0.000042193 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0447  hypothetical protein  34.38 
 
 
612 aa  52.8  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.476837 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3353  hypothetical protein  23.92 
 
 
856 aa  52.4  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2523  hypothetical protein  30.27 
 
 
757 aa  51.2  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4254  decaheme cytochrome c  21.77 
 
 
729 aa  51.6  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.353597  unclonable  0.0000000280036 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2580  hypothetical protein  33.03 
 
 
677 aa  50.4  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2862  hypothetical protein  33.33 
 
 
698 aa  49.7  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3263  hypothetical protein  29.15 
 
 
655 aa  49.7  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1421  hypothetical protein  31 
 
 
657 aa  48.9  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.515821 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2843  hypothetical protein  33.33 
 
 
701 aa  49.3  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0450  hypothetical protein  40.91 
 
 
687 aa  48.9  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2991  hypothetical protein  33.33 
 
 
701 aa  49.3  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1515  hypothetical protein  33.33 
 
 
701 aa  49.3  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2379  hypothetical protein  29.66 
 
 
1111 aa  48.5  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.49944  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1978  hypothetical protein  61.76 
 
 
568 aa  48.5  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.308445  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2990  hypothetical protein  32 
 
 
680 aa  48.5  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>