107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1778 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1778  decaheme cytochrome c  100 
 
 		 671 aa  1389    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2510  decaheme cytochrome c  68.88 
 
 		 655 aa  923    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0178218  hitchhiker  0.000666167 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2637  decaheme cytochrome c  52.7 
 
 		 653 aa  679    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2525  decaheme cytochrome c  64.09 
 
 		 656 aa  840    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000837992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1478  decaheme cytochrome c  54.1 
 
 		 663 aa  687    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000254716  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1525  decaheme cytochrome c  50.72 
 
 		 660 aa  639    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.100516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3125  decaheme cytochrome c  52.53 
 
 		 667 aa  679    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00001045  hitchhiker  0.00000606277 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2698  decaheme cytochrome c  50.36 
 
 		 671 aa  608  9.999999999999999e-173  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0681671  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2578  decaheme cytochrome c  49.42 
 
 		 650 aa  585  1e-166  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00427395  decreased coverage  0.00803379 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1589  decaheme cytochrome c  49.42 
 
 		 650 aa  585  1e-166  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000235795  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1578  decaheme cytochrome c  49.28 
 
 		 650 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000205402  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1612  decaheme cytochrome c  49.28 
 
 		 650 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0130523  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2765  decaheme cytochrome c  49.28 
 
 		 650 aa  585  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00105295  hitchhiker  0.000000731399 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2676  decaheme cytochrome c  49.28 
 
 		 650 aa  581  1e-164  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000503474  normal  0.0214929 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1208  decaheme cytochrome c  46.69 
 
 		 656 aa  552  1e-156  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.474569  normal  0.550051 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1780  decaheme cytochrome c MtrF  30.6 
 
 		 639 aa  260  4e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2674  decaheme cytochrome c MtrF  30.71 
 
 		 639 aa  252  2e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0899912  normal  0.105553 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2508  decaheme cytochrome c MtrF  31.02 
 
 		 639 aa  251  4e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00292179  decreased coverage  0.000509076 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1211  decaheme cytochrome c MtrF  31.27 
 
 		 639 aa  249  8e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2576  decaheme cytochrome c MtrF  30.62 
 
 		 639 aa  249  9e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.134423  decreased coverage  0.00876105 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2694  decaheme cytochrome c MtrF  30.25 
 
 		 640 aa  243  7.999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1580  decaheme cytochrome c MtrF  30.4 
 
 		 639 aa  243  1e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0766819  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1614  decaheme cytochrome c MtrF  30.26 
 
 		 639 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0474266  normal  0.168927 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2763  decaheme cytochrome c MtrF  29.73 
 
 		 639 aa  238  4e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0120659  hitchhiker  0.0000444921 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1591  decaheme cytochrome c MtrF  29.25 
 
 		 639 aa  233  1e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000158979  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1528  decaheme cytochrome c MtrF  29.94 
 
 		 646 aa  224  4.9999999999999996e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2521  decaheme cytochrome c MtrF  30.56 
 
 		 639 aa  217  5.9999999999999996e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3466  hypothetical protein  34.03 
 
 		 785 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.724503 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4048  hypothetical protein  28.19 
 
 		 764 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0998  decaheme cytochrome c  24.46 
 
 		 766 aa  102  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3124  decaheme cytochrome c  22.21 
 
 		 741 aa  98.6  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00184772  hitchhiker  0.000042193 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1526  decaheme cytochrome c  23.39 
 
 		 738 aa  97.4  8e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.324001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2524  decaheme cytochrome c  22.92 
 
 		 725 aa  97.1  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000418395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1210  decaheme cytochrome c  22.59 
 
 		 727 aa  96.3  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.260087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0918  decaheme cytochrome c  25.03 
 
 		 764 aa  95.9  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.613412  normal  0.552776 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2509  decaheme cytochrome c  23.11 
 
 		 731 aa  90.9  7e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000184393  hitchhiker  0.000632353 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1527  decaheme cytochrome c  21.85 
 
 		 722 aa  90.9  7e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3588  decaheme cytochrome c  22.81 
 
 		 745 aa  90.1  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1658  hypothetical protein  27.16 
 
 		 898 aa  89.7  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.131846  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2696  hypothetical protein  22.46 
 
 		 822 aa  89  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2292  hypothetical protein  26.75 
 
 		 782 aa  88.2  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2522  decaheme cytochrome c  23.28 
 
 		 720 aa  88.2  5e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1731  multiheme cytochrome  26.84 
 
 		 898 aa  87.4  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2216  hypothetical protein  26.84 
 
 		 898 aa  86.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.352223  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1209  decaheme cytochrome c  23.6 
 
 		 729 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00658895  normal  0.327868 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2577  decaheme cytochrome c  22.85 
 
 		 731 aa  84  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00883016  decreased coverage  0.00925289 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0913  decaheme cytochrome c  23.09 
 
 		 770 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.546873  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2636  decaheme cytochrome c  21.4 
 
 		 724 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2675  decaheme cytochrome c  23.47 
 
 		 724 aa  80.9  0.00000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000733685  normal  0.0455406 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3573  decaheme cytochrome c  23.22 
 
 		 716 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2613  decaheme cytochrome c  24.21 
 
 		 762 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000355284  hitchhiker  0.00000740819 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1579  decaheme cytochrome c  22.92 
 
 		 730 aa  79  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00874065  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2697  decaheme cytochrome c  26.29 
 
 		 745 aa  78.2  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0633196  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2299  hypothetical protein  31.35 
 
 		 809 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1613  decaheme cytochrome c  22.79 
 
 		 730 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000196014  normal  0.166254 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1590  decaheme cytochrome c  22.25 
 
 		 730 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000452412  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2680  decaheme cytochrome c  24.79 
 
 		 762 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.463028  unclonable  0.0000643351 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4254  decaheme cytochrome c  21.73 
 
 		 729 aa  71.6  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.353597  unclonable  0.0000000280036 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2695  decaheme cytochrome c  21.76 
 
 		 719 aa  71.2  0.00000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.734788  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1478  decaheme cytochrome c  23.6 
 
 		 761 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.174618  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1509  decaheme cytochrome c  23.77 
 
 		 764 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.130709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1473  decaheme cytochrome c  23.67 
 
 		 761 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000262006  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2874  decaheme cytochrome c  23.77 
 
 		 764 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0594793  hitchhiker  0.00000891097 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3286  hypothetical protein  22.14 
 
 		 714 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.909593  hitchhiker  0.000000468411 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1779  decaheme cytochrome c  22.37 
 
 		 735 aa  67.4  0.0000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2787  decaheme cytochrome c  23.65 
 
 		 762 aa  67  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0256712 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2228  decaheme cytochrome c  23.99 
 
 		 755 aa  64.7  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.236086  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1659  decaheme cytochrome c  23.24 
 
 		 758 aa  62.8  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1380  decaheme cytochrome c  21.44 
 
 		 765 aa  62  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1479  hypothetical protein  26.07 
 
 		 833 aa  61.6  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0424195  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0447  hypothetical protein  23.44 
 
 		 612 aa  61.2  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.476837 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4083  hypothetical protein  24.83 
 
 		 826 aa  60.8  0.00000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0344261  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0875  hypothetical protein  22.14 
 
 		 893 aa  60.1  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0421546 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1187  hypothetical protein  22.54 
 
 		 778 aa  54.7  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1345  multiheme cytochrome  23.11 
 
 		 742 aa  54.3  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4080  hypothetical protein  22.65 
 
 		 936 aa  53.9  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000183317  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2523  hypothetical protein  28.71 
 
 		 757 aa  53.9  0.000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0910  hypothetical protein  23.74 
 
 		 731 aa  53.5  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.688824 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1244  hypothetical protein  22.35 
 
 		 742 aa  53.5  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0505071  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3371  hypothetical protein  23.27 
 
 		 895 aa  53.5  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.94917  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003776  decaheme cytochrome c MtrF  21.07 
 
 		 754 aa  53.1  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3251  hypothetical protein  22.57 
 
 		 788 aa  51.6  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1213  decaheme cytochrome c MtrD  31.53 
 
 		 318 aa  50.4  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.766107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3098  hypothetical protein  22.22 
 
 		 789 aa  50.8  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0450  hypothetical protein  26.69 
 
 		 687 aa  49.3  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3108  hypothetical protein  22.3 
 
 		 788 aa  48.9  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6275  decaheme c-type cytochrome, OmcA/MtrC family  23.45 
 
 		 741 aa  48.5  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.772817 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2603  hypothetical protein  21.59 
 
 		 742 aa  47.8  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430741  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2638  cytochrome C family protein  29.71 
 
 		 329 aa  47.8  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.838087  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4079  hypothetical protein  21.69 
 
 		 885 aa  47  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.299167  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2692  cytochrome C family protein  31.78 
 
 		 319 aa  47  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3126  cytochrome C family protein  28.99 
 
 		 333 aa  46.6  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00631921  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1268  hypothetical protein  22.05 
 
 		 789 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.487663  hitchhiker  0.00130496 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2764  hypothetical protein  23.94 
 
 		 843 aa  45.8  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.185672  hitchhiker  0.000000808171 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1777  decaheme cytochrome c MtrA  30.5 
 
 		 333 aa  44.7  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2506  cytochrome C family protein  31.53 
 
 		 321 aa  44.7  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.365224  hitchhiker  0.00105775 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2574  cytochrome C family protein  31.53 
 
 		 321 aa  44.7  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.448859  hitchhiker  0.00699839 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2672  cytochrome C family protein  31.53 
 
 		 321 aa  44.7  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.655979  normal  0.0486911 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1207  decaheme cytochrome c MtrA  26.81 
 
 		 326 aa  44.7  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0298799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1524  cytochrome c family protein  27.54 
 
 		 333 aa  44.7  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.462693  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>