100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1525 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1778  decaheme cytochrome c  50.72 
 
 		 671 aa  674    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1589  decaheme cytochrome c  53.95 
 
 		 650 aa  691    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000235795  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1208  decaheme cytochrome c  53.17 
 
 		 656 aa  689    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.474569  normal  0.550051 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2676  decaheme cytochrome c  53.51 
 
 		 650 aa  689    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000503474  normal  0.0214929 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2637  decaheme cytochrome c  64.96 
 
 		 653 aa  892    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2525  decaheme cytochrome c  62.65 
 
 		 656 aa  827    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000837992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1578  decaheme cytochrome c  53.65 
 
 		 650 aa  687    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000205402  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2578  decaheme cytochrome c  53.22 
 
 		 650 aa  684    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00427395  decreased coverage  0.00803379 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1525  decaheme cytochrome c  100 
 
 		 660 aa  1368    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.100516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2510  decaheme cytochrome c  55.97 
 
 		 655 aa  748    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0178218  hitchhiker  0.000666167 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2765  decaheme cytochrome c  54.09 
 
 		 650 aa  692    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00105295  hitchhiker  0.000000731399 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2698  decaheme cytochrome c  60 
 
 		 671 aa  790    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0681671  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3125  decaheme cytochrome c  65.87 
 
 		 667 aa  914    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00001045  hitchhiker  0.00000606277 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1612  decaheme cytochrome c  53.65 
 
 		 650 aa  687    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0130523  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1478  decaheme cytochrome c  46.85 
 
 		 663 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000254716  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1780  decaheme cytochrome c MtrF  30.56 
 
 		 639 aa  249  1e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2508  decaheme cytochrome c MtrF  30.48 
 
 		 639 aa  240  6.999999999999999e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00292179  decreased coverage  0.000509076 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2674  decaheme cytochrome c MtrF  29.76 
 
 		 639 aa  239  1e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0899912  normal  0.105553 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2576  decaheme cytochrome c MtrF  30.15 
 
 		 639 aa  238  2e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.134423  decreased coverage  0.00876105 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2694  decaheme cytochrome c MtrF  30.17 
 
 		 640 aa  229  1e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1614  decaheme cytochrome c MtrF  29.74 
 
 		 639 aa  227  4e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0474266  normal  0.168927 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1580  decaheme cytochrome c MtrF  29.62 
 
 		 639 aa  227  4e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0766819  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1211  decaheme cytochrome c MtrF  29.01 
 
 		 639 aa  224  3e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2763  decaheme cytochrome c MtrF  29.75 
 
 		 639 aa  224  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0120659  hitchhiker  0.0000444921 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1591  decaheme cytochrome c MtrF  29.45 
 
 		 639 aa  221  3e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000158979  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1528  decaheme cytochrome c MtrF  30.53 
 
 		 646 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2521  decaheme cytochrome c MtrF  29.6 
 
 		 639 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4048  hypothetical protein  26.38 
 
 		 764 aa  131  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3466  hypothetical protein  28.61 
 
 		 785 aa  115  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.724503 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1527  decaheme cytochrome c  23.7 
 
 		 722 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2522  decaheme cytochrome c  22.82 
 
 		 720 aa  102  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0918  decaheme cytochrome c  24.3 
 
 		 764 aa  100  6e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.613412  normal  0.552776 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2524  decaheme cytochrome c  23.44 
 
 		 725 aa  99.4  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000418395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1210  decaheme cytochrome c  23.17 
 
 		 727 aa  97.8  5e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.260087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3286  hypothetical protein  24.04 
 
 		 714 aa  97.8  6e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.909593  hitchhiker  0.000000468411 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2636  decaheme cytochrome c  23.8 
 
 		 724 aa  96.3  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2509  decaheme cytochrome c  23.36 
 
 		 731 aa  92  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000184393  hitchhiker  0.000632353 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2577  decaheme cytochrome c  23.69 
 
 		 731 aa  90.1  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00883016  decreased coverage  0.00925289 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2695  decaheme cytochrome c  22.6 
 
 		 719 aa  89.4  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.734788  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2613  decaheme cytochrome c  23.62 
 
 		 762 aa  87.4  8e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000355284  hitchhiker  0.00000740819 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1658  hypothetical protein  27.69 
 
 		 898 aa  84.7  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.131846  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1731  multiheme cytochrome  27.31 
 
 		 898 aa  84  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2675  decaheme cytochrome c  23.92 
 
 		 724 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000733685  normal  0.0455406 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2216  hypothetical protein  27.2 
 
 		 898 aa  82.8  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.352223  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2228  decaheme cytochrome c  22.44 
 
 		 755 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.236086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1579  decaheme cytochrome c  23.14 
 
 		 730 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00874065  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2680  decaheme cytochrome c  24.09 
 
 		 762 aa  78.2  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.463028  unclonable  0.0000643351 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1613  decaheme cytochrome c  23.14 
 
 		 730 aa  77.4  0.0000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000196014  normal  0.166254 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1590  decaheme cytochrome c  23.14 
 
 		 730 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000452412  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1209  decaheme cytochrome c  22.81 
 
 		 729 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00658895  normal  0.327868 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2787  decaheme cytochrome c  23.06 
 
 		 762 aa  75.5  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0256712 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0913  decaheme cytochrome c  22.12 
 
 		 770 aa  74.3  0.000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.546873  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3588  decaheme cytochrome c  24.55 
 
 		 745 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2292  hypothetical protein  26.64 
 
 		 782 aa  73.2  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1478  decaheme cytochrome c  23.02 
 
 		 761 aa  72  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.174618  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2696  hypothetical protein  22.5 
 
 		 822 aa  71.6  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2697  decaheme cytochrome c  23.86 
 
 		 745 aa  71.2  0.00000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0633196  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1473  decaheme cytochrome c  22.06 
 
 		 761 aa  71.2  0.00000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000262006  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2874  decaheme cytochrome c  23.9 
 
 		 764 aa  70.9  0.00000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0594793  hitchhiker  0.00000891097 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1509  decaheme cytochrome c  23.9 
 
 		 764 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.130709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0998  decaheme cytochrome c  28.07 
 
 		 766 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1345  multiheme cytochrome  27.04 
 
 		 742 aa  69.7  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3124  decaheme cytochrome c  25.13 
 
 		 741 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00184772  hitchhiker  0.000042193 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1380  decaheme cytochrome c  24.83 
 
 		 765 aa  68.2  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4080  hypothetical protein  22.82 
 
 		 936 aa  67.8  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000183317  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2603  hypothetical protein  26.72 
 
 		 742 aa  66.2  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430741  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1244  hypothetical protein  25.86 
 
 		 742 aa  64.3  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0505071  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1526  decaheme cytochrome c  26.37 
 
 		 738 aa  63.9  0.000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.324001  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1779  decaheme cytochrome c  24.38 
 
 		 735 aa  63.5  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1659  decaheme cytochrome c  22.07 
 
 		 758 aa  63.2  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4079  hypothetical protein  24.25 
 
 		 885 aa  61.6  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.299167  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0875  hypothetical protein  24.59 
 
 		 893 aa  60.8  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0421546 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2299  hypothetical protein  27.01 
 
 		 809 aa  60.5  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2523  hypothetical protein  23.16 
 
 		 757 aa  60.5  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1257  hypothetical protein  26.19 
 
 		 762 aa  58.9  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1187  hypothetical protein  22.26 
 
 		 778 aa  56.2  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3371  hypothetical protein  21.73 
 
 		 895 aa  55.5  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.94917  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0450  hypothetical protein  25.95 
 
 		 687 aa  52.8  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2991  hypothetical protein  26.34 
 
 		 701 aa  52.8  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2843  hypothetical protein  26.34 
 
 		 701 aa  52.8  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1421  hypothetical protein  25.41 
 
 		 657 aa  52.8  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.515821 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1515  hypothetical protein  26.34 
 
 		 701 aa  52.8  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0447  hypothetical protein  23.64 
 
 		 612 aa  53.1  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.476837 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2990  hypothetical protein  25.26 
 
 		 680 aa  52.8  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2862  hypothetical protein  26.49 
 
 		 698 aa  51.6  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3573  decaheme cytochrome c  23.18 
 
 		 716 aa  51.2  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0963  hypothetical protein  20.99 
 
 		 816 aa  50.8  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.830117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1409  hypothetical protein  24.86 
 
 		 696 aa  48.9  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2764  hypothetical protein  24.38 
 
 		 843 aa  49.3  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.185672  hitchhiker  0.000000808171 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1356  hypothetical protein  24.86 
 
 		 696 aa  48.1  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0734371 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6275  decaheme c-type cytochrome, OmcA/MtrC family  21.15 
 
 		 741 aa  47.8  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.772817 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1713  hypothetical protein  22.46 
 
 		 945 aa  47.4  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.436521  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0910  hypothetical protein  21.47 
 
 		 731 aa  46.6  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.688824 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2638  cytochrome C family protein  28.69 
 
 		 329 aa  46.2  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.838087  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4254  decaheme cytochrome c  21.45 
 
 		 729 aa  45.4  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.353597  unclonable  0.0000000280036 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3126  cytochrome C family protein  28.69 
 
 		 333 aa  45.4  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00631921  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2796  fibronectin type III domain-containing protein  28.49 
 
 		 2153 aa  45.4  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1542  cytochrome C family protein  27.67 
 
 		 655 aa  45.1  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0724057 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2507  hypothetical protein  25.84 
 
 		 700 aa  44.7  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116766  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4083  hypothetical protein  21.68 
 
 		 826 aa  43.9  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0344261  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>