112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2508 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1780  decaheme cytochrome c MtrF  87.93 
 
 		 639 aa  1199    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2508  decaheme cytochrome c MtrF  100 
 
 		 639 aa  1323    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00292179  decreased coverage  0.000509076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2576  decaheme cytochrome c MtrF  98.59 
 
 		 639 aa  1309    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.134423  decreased coverage  0.00876105 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2674  decaheme cytochrome c MtrF  97.18 
 
 		 639 aa  1271    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0899912  normal  0.105553 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1211  decaheme cytochrome c MtrF  65.98 
 
 		 639 aa  875    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1591  decaheme cytochrome c MtrF  83.86 
 
 		 639 aa  1151    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000158979  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2521  decaheme cytochrome c MtrF  64.39 
 
 		 639 aa  840    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1580  decaheme cytochrome c MtrF  84.01 
 
 		 639 aa  1155    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0766819  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1528  decaheme cytochrome c MtrF  62.29 
 
 		 646 aa  797    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2763  decaheme cytochrome c MtrF  83.54 
 
 		 639 aa  1136    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0120659  hitchhiker  0.0000444921 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2694  decaheme cytochrome c MtrF  60.67 
 
 		 640 aa  784    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1614  decaheme cytochrome c MtrF  84.33 
 
 		 639 aa  1158    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0474266  normal  0.168927 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2676  decaheme cytochrome c  33.89 
 
 		 650 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000503474  normal  0.0214929 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1589  decaheme cytochrome c  33.99 
 
 		 650 aa  335  1e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000235795  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2578  decaheme cytochrome c  33.78 
 
 		 650 aa  335  2e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00427395  decreased coverage  0.00803379 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2765  decaheme cytochrome c  33.84 
 
 		 650 aa  334  2e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00105295  hitchhiker  0.000000731399 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1578  decaheme cytochrome c  33.79 
 
 		 650 aa  331  3e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000205402  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1612  decaheme cytochrome c  33.63 
 
 		 650 aa  330  5.0000000000000004e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0130523  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1208  decaheme cytochrome c  32.49 
 
 		 656 aa  317  3e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.474569  normal  0.550051 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1478  decaheme cytochrome c  29.02 
 
 		 663 aa  287  5e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000254716  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2510  decaheme cytochrome c  30.92 
 
 		 655 aa  264  3e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0178218  hitchhiker  0.000666167 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3125  decaheme cytochrome c  32.52 
 
 		 667 aa  263  1e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00001045  hitchhiker  0.00000606277 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1778  decaheme cytochrome c  31.22 
 
 		 671 aa  260  5.0000000000000005e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2637  decaheme cytochrome c  30.21 
 
 		 653 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2525  decaheme cytochrome c  31.42 
 
 		 656 aa  234  3e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000837992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3466  hypothetical protein  26.58 
 
 		 785 aa  228  4e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.724503 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1525  decaheme cytochrome c  29.54 
 
 		 660 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.100516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2698  decaheme cytochrome c  30.09 
 
 		 671 aa  214  4.9999999999999996e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0681671  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4048  hypothetical protein  27.48 
 
 		 764 aa  212  2e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3286  hypothetical protein  25.55 
 
 		 714 aa  178  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.909593  hitchhiker  0.000000468411 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1210  decaheme cytochrome c  26.53 
 
 		 727 aa  151  4e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.260087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2509  decaheme cytochrome c  25.58 
 
 		 731 aa  150  7e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000184393  hitchhiker  0.000632353 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1779  decaheme cytochrome c  27.38 
 
 		 735 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3588  decaheme cytochrome c  24.83 
 
 		 745 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1590  decaheme cytochrome c  26.48 
 
 		 730 aa  147  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000452412  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1579  decaheme cytochrome c  26.75 
 
 		 730 aa  147  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00874065  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2577  decaheme cytochrome c  25.81 
 
 		 731 aa  145  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00883016  decreased coverage  0.00925289 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2696  hypothetical protein  26.07 
 
 		 822 aa  145  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1613  decaheme cytochrome c  26.34 
 
 		 730 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000196014  normal  0.166254 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1209  decaheme cytochrome c  26.08 
 
 		 729 aa  144  7e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00658895  normal  0.327868 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2292  hypothetical protein  24.86 
 
 		 782 aa  139  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2675  decaheme cytochrome c  25.93 
 
 		 724 aa  137  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000733685  normal  0.0455406 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2695  decaheme cytochrome c  25.67 
 
 		 719 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.734788  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1527  decaheme cytochrome c  24.23 
 
 		 722 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3573  decaheme cytochrome c  25 
 
 		 716 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2603  hypothetical protein  28.55 
 
 		 742 aa  134  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430741  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1345  multiheme cytochrome  28.26 
 
 		 742 aa  133  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2522  decaheme cytochrome c  24.73 
 
 		 720 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1244  hypothetical protein  27.93 
 
 		 742 aa  133  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0505071  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1479  hypothetical protein  25.06 
 
 		 833 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0424195  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3371  hypothetical protein  24.07 
 
 		 895 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.94917  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4083  hypothetical protein  25.82 
 
 		 826 aa  128  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0344261  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2697  decaheme cytochrome c  24.38 
 
 		 745 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0633196  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3124  decaheme cytochrome c  24.2 
 
 		 741 aa  127  7e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00184772  hitchhiker  0.000042193 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0918  decaheme cytochrome c  24.77 
 
 		 764 aa  125  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.613412  normal  0.552776 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2524  decaheme cytochrome c  24.77 
 
 		 725 aa  125  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000418395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1526  decaheme cytochrome c  22.91 
 
 		 738 aa  120  9e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.324001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4080  hypothetical protein  22.43 
 
 		 936 aa  117  5e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000183317  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2228  decaheme cytochrome c  24.43 
 
 		 755 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.236086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3200  hypothetical protein  26.17 
 
 		 820 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0875  hypothetical protein  22.91 
 
 		 893 aa  112  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0421546 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4079  hypothetical protein  27.68 
 
 		 885 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.299167  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1257  hypothetical protein  24.5 
 
 		 762 aa  107  6e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2613  decaheme cytochrome c  23.38 
 
 		 762 aa  106  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000355284  hitchhiker  0.00000740819 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1478  decaheme cytochrome c  24.8 
 
 		 761 aa  105  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.174618  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1509  decaheme cytochrome c  24.84 
 
 		 764 aa  105  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.130709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1473  decaheme cytochrome c  24.67 
 
 		 761 aa  104  6e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000262006  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2874  decaheme cytochrome c  24.71 
 
 		 764 aa  103  8e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0594793  hitchhiker  0.00000891097 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2787  decaheme cytochrome c  23.98 
 
 		 762 aa  103  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0256712 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2636  decaheme cytochrome c  24.7 
 
 		 724 aa  102  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1659  decaheme cytochrome c  24.07 
 
 		 758 aa  100  7e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0998  decaheme cytochrome c  22.72 
 
 		 766 aa  100  9e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003776  decaheme cytochrome c MtrF  23.52 
 
 		 754 aa  99.4  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2680  decaheme cytochrome c  23.19 
 
 		 762 aa  99  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.463028  unclonable  0.0000643351 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4254  decaheme cytochrome c  23.33 
 
 		 729 aa  97.8  5e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.353597  unclonable  0.0000000280036 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1380  decaheme cytochrome c  24.64 
 
 		 765 aa  97.4  6e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2764  hypothetical protein  28.81 
 
 		 843 aa  94.7  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.185672  hitchhiker  0.000000808171 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0910  hypothetical protein  22.05 
 
 		 731 aa  92.4  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.688824 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2299  hypothetical protein  26.12 
 
 		 809 aa  89.7  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2216  hypothetical protein  25.88 
 
 		 898 aa  89.4  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.352223  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1731  multiheme cytochrome  26.16 
 
 		 898 aa  89  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3251  hypothetical protein  24.66 
 
 		 788 aa  88.6  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1658  hypothetical protein  26.16 
 
 		 898 aa  88.2  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.131846  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3108  hypothetical protein  24.38 
 
 		 788 aa  84.3  0.000000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6275  decaheme c-type cytochrome, OmcA/MtrC family  27.83 
 
 		 741 aa  83.6  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.772817 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1187  hypothetical protein  23.1 
 
 		 778 aa  81.3  0.00000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2580  hypothetical protein  23.51 
 
 		 677 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1713  hypothetical protein  26.3 
 
 		 945 aa  78.6  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.436521  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2523  hypothetical protein  22.59 
 
 		 757 aa  73.9  0.000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0913  decaheme cytochrome c  23.3 
 
 		 770 aa  71.2  0.00000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.546873  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0963  hypothetical protein  23.31 
 
 		 816 aa  71.2  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.830117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0447  hypothetical protein  28.22 
 
 		 612 aa  71.2  0.00000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.476837 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3098  hypothetical protein  31.98 
 
 		 789 aa  67.8  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1268  hypothetical protein  29.63 
 
 		 789 aa  65.9  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.487663  hitchhiker  0.00130496 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3263  hypothetical protein  28.8 
 
 		 655 aa  65.5  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4517  hypothetical protein  30.48 
 
 		 642 aa  63.5  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.247929 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1421  hypothetical protein  26.49 
 
 		 657 aa  62.4  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.515821 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1515  hypothetical protein  26.42 
 
 		 701 aa  61.6  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2843  hypothetical protein  26.42 
 
 		 701 aa  61.6  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2991  hypothetical protein  26.42 
 
 		 701 aa  61.2  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>