88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3125 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1778  decaheme cytochrome c  52.53 
 
 		 671 aa  679    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2525  decaheme cytochrome c  59.35 
 
 		 656 aa  780    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000837992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1525  decaheme cytochrome c  65.87 
 
 		 660 aa  877    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.100516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3125  decaheme cytochrome c  100 
 
 		 667 aa  1386    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00001045  hitchhiker  0.00000606277 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2637  decaheme cytochrome c  60.66 
 
 		 653 aa  824    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2698  decaheme cytochrome c  67.55 
 
 		 671 aa  899    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0681671  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2510  decaheme cytochrome c  55.34 
 
 		 655 aa  736    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0178218  hitchhiker  0.000666167 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1578  decaheme cytochrome c  50.51 
 
 		 650 aa  622  1e-177  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000205402  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1589  decaheme cytochrome c  50.36 
 
 		 650 aa  620  1e-176  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000235795  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2765  decaheme cytochrome c  50.07 
 
 		 650 aa  617  1e-175  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00105295  hitchhiker  0.000000731399 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1612  decaheme cytochrome c  50.22 
 
 		 650 aa  617  1e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0130523  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2676  decaheme cytochrome c  49.64 
 
 		 650 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000503474  normal  0.0214929 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2578  decaheme cytochrome c  49.49 
 
 		 650 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00427395  decreased coverage  0.00803379 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1208  decaheme cytochrome c  48.11 
 
 		 656 aa  591  1e-167  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.474569  normal  0.550051 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1478  decaheme cytochrome c  45.82 
 
 		 663 aa  555  1e-157  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000254716  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1780  decaheme cytochrome c MtrF  31.93 
 
 		 639 aa  264  3e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2674  decaheme cytochrome c MtrF  32.69 
 
 		 639 aa  258  3e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0899912  normal  0.105553 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2508  decaheme cytochrome c MtrF  32.24 
 
 		 639 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00292179  decreased coverage  0.000509076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2576  decaheme cytochrome c MtrF  31.95 
 
 		 639 aa  254  3e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.134423  decreased coverage  0.00876105 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1614  decaheme cytochrome c MtrF  30.71 
 
 		 639 aa  243  7e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0474266  normal  0.168927 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1580  decaheme cytochrome c MtrF  30.71 
 
 		 639 aa  240  5.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0766819  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1591  decaheme cytochrome c MtrF  30.67 
 
 		 639 aa  234  3e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000158979  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2763  decaheme cytochrome c MtrF  31 
 
 		 639 aa  233  1e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0120659  hitchhiker  0.0000444921 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1211  decaheme cytochrome c MtrF  30.86 
 
 		 639 aa  229  1e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1528  decaheme cytochrome c MtrF  31.96 
 
 		 646 aa  226  9e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2694  decaheme cytochrome c MtrF  30.67 
 
 		 640 aa  224  3e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2521  decaheme cytochrome c MtrF  31.14 
 
 		 639 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4048  hypothetical protein  32.75 
 
 		 764 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3466  hypothetical protein  30.64 
 
 		 785 aa  117  5e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.724503 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2613  decaheme cytochrome c  24.34 
 
 		 762 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000355284  hitchhiker  0.00000740819 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2680  decaheme cytochrome c  24.65 
 
 		 762 aa  108  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.463028  unclonable  0.0000643351 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2524  decaheme cytochrome c  23.82 
 
 		 725 aa  105  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000418395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2787  decaheme cytochrome c  24.69 
 
 		 762 aa  105  4e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0256712 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1527  decaheme cytochrome c  22.95 
 
 		 722 aa  104  5e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0918  decaheme cytochrome c  23.77 
 
 		 764 aa  102  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.613412  normal  0.552776 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1590  decaheme cytochrome c  22.76 
 
 		 730 aa  102  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000452412  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1209  decaheme cytochrome c  23.55 
 
 		 729 aa  101  4e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00658895  normal  0.327868 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1210  decaheme cytochrome c  22.01 
 
 		 727 aa  101  5e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.260087  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1659  decaheme cytochrome c  24.14 
 
 		 758 aa  101  5e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1380  decaheme cytochrome c  24.11 
 
 		 765 aa  101  5e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1579  decaheme cytochrome c  22.15 
 
 		 730 aa  100  6e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00874065  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1613  decaheme cytochrome c  22.62 
 
 		 730 aa  99.4  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000196014  normal  0.166254 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2675  decaheme cytochrome c  23.31 
 
 		 724 aa  99  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000733685  normal  0.0455406 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0998  decaheme cytochrome c  25 
 
 		 766 aa  95.1  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2509  decaheme cytochrome c  22.49 
 
 		 731 aa  92.8  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000184393  hitchhiker  0.000632353 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1478  decaheme cytochrome c  22.81 
 
 		 761 aa  91.7  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.174618  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1509  decaheme cytochrome c  22.85 
 
 		 764 aa  91.7  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.130709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2874  decaheme cytochrome c  22.72 
 
 		 764 aa  90.5  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0594793  hitchhiker  0.00000891097 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1473  decaheme cytochrome c  23.15 
 
 		 761 aa  90.1  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000262006  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2522  decaheme cytochrome c  22.29 
 
 		 720 aa  89  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3286  hypothetical protein  22.84 
 
 		 714 aa  88.2  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.909593  hitchhiker  0.000000468411 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2577  decaheme cytochrome c  22.76 
 
 		 731 aa  87.4  8e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00883016  decreased coverage  0.00925289 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1779  decaheme cytochrome c  23.36 
 
 		 735 aa  87  9e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1526  decaheme cytochrome c  23.51 
 
 		 738 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.324001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1658  hypothetical protein  26.45 
 
 		 898 aa  85.9  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.131846  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2228  decaheme cytochrome c  23.11 
 
 		 755 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.236086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2216  hypothetical protein  26.16 
 
 		 898 aa  85.1  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.352223  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2523  hypothetical protein  22.49 
 
 		 757 aa  84.7  0.000000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1731  multiheme cytochrome  26.45 
 
 		 898 aa  84.3  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2695  decaheme cytochrome c  22.18 
 
 		 719 aa  81.6  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.734788  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3124  decaheme cytochrome c  24.23 
 
 		 741 aa  81.3  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00184772  hitchhiker  0.000042193 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2636  decaheme cytochrome c  22.11 
 
 		 724 aa  81.3  0.00000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2292  hypothetical protein  26.21 
 
 		 782 aa  78.6  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3588  decaheme cytochrome c  24.02 
 
 		 745 aa  74.3  0.000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2697  decaheme cytochrome c  25.27 
 
 		 745 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0633196  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4254  decaheme cytochrome c  22.28 
 
 		 729 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.353597  unclonable  0.0000000280036 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3371  hypothetical protein  22.63 
 
 		 895 aa  68.2  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.94917  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2299  hypothetical protein  28.1 
 
 		 809 aa  65.9  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0447  hypothetical protein  22.9 
 
 		 612 aa  64.7  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.476837 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0875  hypothetical protein  23.93 
 
 		 893 aa  63.5  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0421546 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2696  hypothetical protein  23.31 
 
 		 822 aa  59.3  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1257  hypothetical protein  27.98 
 
 		 762 aa  59.3  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4080  hypothetical protein  22.55 
 
 		 936 aa  58.5  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000183317  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4079  hypothetical protein  25.75 
 
 		 885 aa  58.2  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.299167  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0913  decaheme cytochrome c  22.4 
 
 		 770 aa  58.2  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.546873  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1244  hypothetical protein  24.15 
 
 		 742 aa  56.6  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0505071  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0450  hypothetical protein  25.94 
 
 		 687 aa  56.2  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1345  multiheme cytochrome  23.91 
 
 		 742 aa  53.9  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2603  hypothetical protein  26.29 
 
 		 742 aa  53.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430741  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6275  decaheme c-type cytochrome, OmcA/MtrC family  25.11 
 
 		 741 aa  52.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.772817 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1421  hypothetical protein  31.41 
 
 		 657 aa  52.4  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.515821 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3573  decaheme cytochrome c  23.26 
 
 		 716 aa  50.1  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1525  hypothetical protein  33.64 
 
 		 220 aa  49.3  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.415046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4517  hypothetical protein  23.66 
 
 		 642 aa  48.5  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.247929 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4083  hypothetical protein  24.88 
 
 		 826 aa  48.5  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0344261  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1713  hypothetical protein  23.4 
 
 		 945 aa  47.8  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.436521  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2990  hypothetical protein  22.56 
 
 		 680 aa  46.2  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003776  decaheme cytochrome c MtrF  24.86 
 
 		 754 aa  43.9  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>