97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2525 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2765  decaheme cytochrome c  49.56 
 
 		 650 aa  635    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00105295  hitchhiker  0.000000731399 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1478  decaheme cytochrome c  52.64 
 
 		 663 aa  706    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000254716  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2525  decaheme cytochrome c  100 
 
 		 656 aa  1358    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000837992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1578  decaheme cytochrome c  49.56 
 
 		 650 aa  638    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000205402  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1589  decaheme cytochrome c  49.71 
 
 		 650 aa  639    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000235795  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1525  decaheme cytochrome c  62.65 
 
 		 660 aa  820    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.100516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2676  decaheme cytochrome c  49.12 
 
 		 650 aa  637    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000503474  normal  0.0214929 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2637  decaheme cytochrome c  61.17 
 
 		 653 aa  837    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2510  decaheme cytochrome c  54.99 
 
 		 655 aa  735    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0178218  hitchhiker  0.000666167 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2698  decaheme cytochrome c  57.16 
 
 		 671 aa  722    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0681671  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1778  decaheme cytochrome c  64.09 
 
 		 671 aa  879    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3125  decaheme cytochrome c  59.35 
 
 		 667 aa  813    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00001045  hitchhiker  0.00000606277 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1612  decaheme cytochrome c  49.27 
 
 		 650 aa  632  1e-180  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0130523  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2578  decaheme cytochrome c  48.83 
 
 		 650 aa  632  1e-180  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00427395  decreased coverage  0.00803379 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1208  decaheme cytochrome c  47.51 
 
 		 656 aa  596  1e-169  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.474569  normal  0.550051 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2694  decaheme cytochrome c MtrF  32.38 
 
 		 640 aa  265  2e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1780  decaheme cytochrome c MtrF  30.87 
 
 		 639 aa  263  6.999999999999999e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2674  decaheme cytochrome c MtrF  31.77 
 
 		 639 aa  258  2e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0899912  normal  0.105553 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2576  decaheme cytochrome c MtrF  31.47 
 
 		 639 aa  257  5e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.134423  decreased coverage  0.00876105 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1211  decaheme cytochrome c MtrF  31.56 
 
 		 639 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2508  decaheme cytochrome c MtrF  31.32 
 
 		 639 aa  254  3e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00292179  decreased coverage  0.000509076 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1580  decaheme cytochrome c MtrF  31.55 
 
 		 639 aa  254  3e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0766819  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1528  decaheme cytochrome c MtrF  30.9 
 
 		 646 aa  252  2e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1614  decaheme cytochrome c MtrF  31.7 
 
 		 639 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0474266  normal  0.168927 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1591  decaheme cytochrome c MtrF  31.55 
 
 		 639 aa  249  8e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000158979  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2763  decaheme cytochrome c MtrF  30.84 
 
 		 639 aa  248  2e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0120659  hitchhiker  0.0000444921 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2521  decaheme cytochrome c MtrF  30.01 
 
 		 639 aa  233  6e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3466  hypothetical protein  26.74 
 
 		 785 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.724503 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0918  decaheme cytochrome c  26.23 
 
 		 764 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.613412  normal  0.552776 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4048  hypothetical protein  24.02 
 
 		 764 aa  128  3e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2524  decaheme cytochrome c  24.9 
 
 		 725 aa  117  8.999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000418395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0998  decaheme cytochrome c  25.04 
 
 		 766 aa  108  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2228  decaheme cytochrome c  24.49 
 
 		 755 aa  107  6e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.236086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1209  decaheme cytochrome c  25.36 
 
 		 729 aa  104  6e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00658895  normal  0.327868 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1779  decaheme cytochrome c  24.02 
 
 		 735 aa  104  6e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3588  decaheme cytochrome c  23.6 
 
 		 745 aa  102  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1527  decaheme cytochrome c  22.27 
 
 		 722 aa  102  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2613  decaheme cytochrome c  25.26 
 
 		 762 aa  99  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000355284  hitchhiker  0.00000740819 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3124  decaheme cytochrome c  24.9 
 
 		 741 aa  97.8  5e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00184772  hitchhiker  0.000042193 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2787  decaheme cytochrome c  24.82 
 
 		 762 aa  97.4  8e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0256712 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1526  decaheme cytochrome c  22.85 
 
 		 738 aa  97.1  8e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.324001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2522  decaheme cytochrome c  23.7 
 
 		 720 aa  96.7  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2680  decaheme cytochrome c  25.22 
 
 		 762 aa  95.9  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.463028  unclonable  0.0000643351 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2636  decaheme cytochrome c  22.99 
 
 		 724 aa  95.9  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2675  decaheme cytochrome c  23.55 
 
 		 724 aa  95.9  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000733685  normal  0.0455406 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1579  decaheme cytochrome c  23.76 
 
 		 730 aa  95.1  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00874065  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0913  decaheme cytochrome c  23.95 
 
 		 770 aa  94  7e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.546873  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1659  decaheme cytochrome c  24.23 
 
 		 758 aa  93.2  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1380  decaheme cytochrome c  24.09 
 
 		 765 aa  93.2  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1210  decaheme cytochrome c  22.77 
 
 		 727 aa  93.6  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.260087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1613  decaheme cytochrome c  23.89 
 
 		 730 aa  92.4  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000196014  normal  0.166254 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2216  hypothetical protein  26.72 
 
 		 898 aa  92  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.352223  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1658  hypothetical protein  29.22 
 
 		 898 aa  91.7  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.131846  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1590  decaheme cytochrome c  23.89 
 
 		 730 aa  91.7  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000452412  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1731  multiheme cytochrome  28.81 
 
 		 898 aa  90.9  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3286  hypothetical protein  23.8 
 
 		 714 aa  87.4  7e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.909593  hitchhiker  0.000000468411 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1478  decaheme cytochrome c  24.3 
 
 		 761 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.174618  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1473  decaheme cytochrome c  24.3 
 
 		 761 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000262006  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2874  decaheme cytochrome c  24.21 
 
 		 764 aa  84.7  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0594793  hitchhiker  0.00000891097 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1509  decaheme cytochrome c  24.21 
 
 		 764 aa  84  0.000000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.130709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2509  decaheme cytochrome c  22.49 
 
 		 731 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000184393  hitchhiker  0.000632353 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2523  hypothetical protein  23.26 
 
 		 757 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2292  hypothetical protein  25.47 
 
 		 782 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2696  hypothetical protein  22.32 
 
 		 822 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2697  decaheme cytochrome c  24.1 
 
 		 745 aa  78.2  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0633196  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2695  decaheme cytochrome c  21.59 
 
 		 719 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.734788  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2577  decaheme cytochrome c  24.82 
 
 		 731 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00883016  decreased coverage  0.00925289 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4254  decaheme cytochrome c  22.52 
 
 		 729 aa  70.9  0.00000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.353597  unclonable  0.0000000280036 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3573  decaheme cytochrome c  21.11 
 
 		 716 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0447  hypothetical protein  22.25 
 
 		 612 aa  65.9  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.476837 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2299  hypothetical protein  25.81 
 
 		 809 aa  64.7  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4083  hypothetical protein  25 
 
 		 826 aa  62  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0344261  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0450  hypothetical protein  25.24 
 
 		 687 aa  58.9  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0910  hypothetical protein  19.19 
 
 		 731 aa  58.9  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.688824 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4079  hypothetical protein  23.18 
 
 		 885 aa  57  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.299167  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1345  multiheme cytochrome  23.89 
 
 		 742 aa  55.5  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1244  hypothetical protein  23.89 
 
 		 742 aa  55.5  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0505071  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0875  hypothetical protein  26.42 
 
 		 893 aa  55.5  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0421546 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1257  hypothetical protein  24.34 
 
 		 762 aa  52  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6275  decaheme c-type cytochrome, OmcA/MtrC family  24.67 
 
 		 741 aa  51.2  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.772817 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003776  decaheme cytochrome c MtrF  21.88 
 
 		 754 aa  50.8  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2764  hypothetical protein  26.74 
 
 		 843 aa  50.8  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.185672  hitchhiker  0.000000808171 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4080  hypothetical protein  20.52 
 
 		 936 aa  50.8  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000183317  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1479  hypothetical protein  21.23 
 
 		 833 aa  50.4  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0424195  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1542  cytochrome C family protein  26.97 
 
 		 655 aa  49.7  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0724057 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2603  hypothetical protein  24.23 
 
 		 742 aa  49.7  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430741  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1421  hypothetical protein  28.26 
 
 		 657 aa  48.1  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.515821 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3371  hypothetical protein  23.23 
 
 		 895 aa  47.8  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.94917  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3218  cytochrome c family protein  25 
 
 		 480 aa  47  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0562793  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2990  hypothetical protein  27.42 
 
 		 680 aa  46.6  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2379  hypothetical protein  27.5 
 
 		 1111 aa  47  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.49944  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0963  hypothetical protein  20.67 
 
 		 816 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.830117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3108  hypothetical protein  21.95 
 
 		 788 aa  46.2  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3098  hypothetical protein  22.06 
 
 		 789 aa  45.4  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1409  hypothetical protein  24.4 
 
 		 696 aa  45.1  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3126  cytochrome C family protein  27.43 
 
 		 333 aa  44.7  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00631921  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2638  cytochrome C family protein  27.43 
 
 		 329 aa  44.3  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.838087  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>