101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3108 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_3098  hypothetical protein  95.44 
 
 		 789 aa  1545    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1187  hypothetical protein  77.16 
 
 		 778 aa  1300    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3108  hypothetical protein  100 
 
 		 788 aa  1632    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3251  hypothetical protein  96.07 
 
 		 788 aa  1557    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1268  hypothetical protein  95.06 
 
 		 789 aa  1558    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.487663  hitchhiker  0.00130496 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2696  hypothetical protein  33.41 
 
 		 822 aa  424  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1479  hypothetical protein  32.78 
 
 		 833 aa  366  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0424195  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2764  hypothetical protein  31.65 
 
 		 843 aa  359  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.185672  hitchhiker  0.000000808171 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2675  decaheme cytochrome c  27.72 
 
 		 724 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000733685  normal  0.0455406 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1779  decaheme cytochrome c  26.71 
 
 		 735 aa  193  9e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1579  decaheme cytochrome c  27.71 
 
 		 730 aa  193  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00874065  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2509  decaheme cytochrome c  26.89 
 
 		 731 aa  191  5.999999999999999e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000184393  hitchhiker  0.000632353 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2577  decaheme cytochrome c  26.94 
 
 		 731 aa  189  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00883016  decreased coverage  0.00925289 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1590  decaheme cytochrome c  27.09 
 
 		 730 aa  189  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000452412  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1613  decaheme cytochrome c  27.34 
 
 		 730 aa  189  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000196014  normal  0.166254 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2524  decaheme cytochrome c  26.1 
 
 		 725 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000418395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1210  decaheme cytochrome c  25.43 
 
 		 727 aa  184  6e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.260087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2636  decaheme cytochrome c  26.06 
 
 		 724 aa  183  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1209  decaheme cytochrome c  25.69 
 
 		 729 aa  183  1e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00658895  normal  0.327868 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2697  decaheme cytochrome c  25.44 
 
 		 745 aa  181  4e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0633196  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2695  decaheme cytochrome c  24.14 
 
 		 719 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.734788  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1526  decaheme cytochrome c  24.34 
 
 		 738 aa  161  5e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.324001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2522  decaheme cytochrome c  29.55 
 
 		 720 aa  160  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1527  decaheme cytochrome c  23.32 
 
 		 722 aa  156  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3124  decaheme cytochrome c  27.16 
 
 		 741 aa  154  5e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00184772  hitchhiker  0.000042193 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2613  decaheme cytochrome c  23.54 
 
 		 762 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000355284  hitchhiker  0.00000740819 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3573  decaheme cytochrome c  22.79 
 
 		 716 aa  119  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1659  decaheme cytochrome c  23.22 
 
 		 758 aa  115  5e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1478  decaheme cytochrome c  24.45 
 
 		 761 aa  114  6e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.174618  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2680  decaheme cytochrome c  24.11 
 
 		 762 aa  114  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.463028  unclonable  0.0000643351 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1473  decaheme cytochrome c  24.21 
 
 		 761 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000262006  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1509  decaheme cytochrome c  24.36 
 
 		 764 aa  113  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.130709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2874  decaheme cytochrome c  24.8 
 
 		 764 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0594793  hitchhiker  0.00000891097 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1345  multiheme cytochrome  25 
 
 		 742 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2603  hypothetical protein  24.97 
 
 		 742 aa  112  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430741  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4083  hypothetical protein  30.3 
 
 		 826 aa  110  8.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0344261  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2787  decaheme cytochrome c  24.26 
 
 		 762 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0256712 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1380  decaheme cytochrome c  23.72 
 
 		 765 aa  110  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1244  hypothetical protein  24.94 
 
 		 742 aa  109  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0505071  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0918  decaheme cytochrome c  22.93 
 
 		 764 aa  107  8e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.613412  normal  0.552776 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0913  decaheme cytochrome c  23.11 
 
 		 770 aa  105  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.546873  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2292  hypothetical protein  24.04 
 
 		 782 aa  102  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0998  decaheme cytochrome c  23.21 
 
 		 766 aa  98.6  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2228  decaheme cytochrome c  23.42 
 
 		 755 aa  96.3  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.236086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2694  decaheme cytochrome c MtrF  26.26 
 
 		 640 aa  95.9  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1211  decaheme cytochrome c MtrF  24.25 
 
 		 639 aa  92.8  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3588  decaheme cytochrome c  25.22 
 
 		 745 aa  92  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1614  decaheme cytochrome c MtrF  25.31 
 
 		 639 aa  92  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0474266  normal  0.168927 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6275  decaheme c-type cytochrome, OmcA/MtrC family  26.38 
 
 		 741 aa  92  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.772817 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4254  decaheme cytochrome c  22.56 
 
 		 729 aa  91.3  7e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.353597  unclonable  0.0000000280036 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1528  decaheme cytochrome c MtrF  25.62 
 
 		 646 aa  90.9  8e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4079  hypothetical protein  27.11 
 
 		 885 aa  88.6  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.299167  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0875  hypothetical protein  21.71 
 
 		 893 aa  85.5  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0421546 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003776  decaheme cytochrome c MtrF  21.88 
 
 		 754 aa  82  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2508  decaheme cytochrome c MtrF  24.72 
 
 		 639 aa  82  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00292179  decreased coverage  0.000509076 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2523  hypothetical protein  25.25 
 
 		 757 aa  82  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0910  hypothetical protein  22.73 
 
 		 731 aa  80.5  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.688824 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2216  hypothetical protein  25.93 
 
 		 898 aa  80.1  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.352223  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1658  hypothetical protein  25.93 
 
 		 898 aa  80.1  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.131846  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2521  decaheme cytochrome c MtrF  24.76 
 
 		 639 aa  79.3  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1731  multiheme cytochrome  25.93 
 
 		 898 aa  79  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1421  hypothetical protein  28.18 
 
 		 657 aa  78.6  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.515821 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3371  hypothetical protein  24.15 
 
 		 895 aa  78.2  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.94917  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1713  hypothetical protein  24.88 
 
 		 945 aa  77.4  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.436521  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2299  hypothetical protein  30.23 
 
 		 809 aa  75.9  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1257  hypothetical protein  30.2 
 
 		 762 aa  71.6  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1780  decaheme cytochrome c MtrF  33.33 
 
 		 639 aa  71.2  0.00000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3200  hypothetical protein  22.75 
 
 		 820 aa  68.9  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2676  decaheme cytochrome c  25.33 
 
 		 650 aa  68.2  0.0000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000503474  normal  0.0214929 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1591  decaheme cytochrome c MtrF  33.5 
 
 		 639 aa  68.2  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000158979  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1580  decaheme cytochrome c MtrF  33.5 
 
 		 639 aa  68.2  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0766819  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2763  decaheme cytochrome c MtrF  33.5 
 
 		 639 aa  67.8  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0120659  hitchhiker  0.0000444921 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0450  hypothetical protein  31.53 
 
 		 687 aa  67.4  0.0000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2576  decaheme cytochrome c MtrF  31.9 
 
 		 639 aa  67  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.134423  decreased coverage  0.00876105 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2674  decaheme cytochrome c MtrF  31.9 
 
 		 639 aa  66.2  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0899912  normal  0.105553 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4080  hypothetical protein  24.26 
 
 		 936 aa  65.5  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000183317  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4517  hypothetical protein  29.51 
 
 		 642 aa  64.7  0.000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.247929 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1589  decaheme cytochrome c  23.31 
 
 		 650 aa  64.3  0.000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000235795  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2990  hypothetical protein  28.57 
 
 		 680 aa  63.9  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1578  decaheme cytochrome c  23.31 
 
 		 650 aa  62.4  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000205402  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1612  decaheme cytochrome c  22.96 
 
 		 650 aa  62  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0130523  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2580  hypothetical protein  28.96 
 
 		 677 aa  61.2  0.00000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2698  decaheme cytochrome c  23.01 
 
 		 671 aa  61.2  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0681671  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3286  hypothetical protein  23.82 
 
 		 714 aa  60.8  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.909593  hitchhiker  0.000000468411 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2765  decaheme cytochrome c  22.71 
 
 		 650 aa  60.8  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00105295  hitchhiker  0.000000731399 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1409  hypothetical protein  30.05 
 
 		 696 aa  55.8  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2507  hypothetical protein  29.1 
 
 		 700 aa  55.8  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116766  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3263  hypothetical protein  28.49 
 
 		 655 aa  55.8  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2843  hypothetical protein  30.14 
 
 		 701 aa  54.7  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1515  hypothetical protein  30.14 
 
 		 701 aa  54.7  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2991  hypothetical protein  30.14 
 
 		 701 aa  54.7  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2862  hypothetical protein  30.14 
 
 		 698 aa  54.3  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1356  hypothetical protein  29.53 
 
 		 696 aa  53.5  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0734371 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0447  hypothetical protein  28.26 
 
 		 612 aa  52.4  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.476837 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3163  hypothetical protein  28.1 
 
 		 857 aa  51.2  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1778  decaheme cytochrome c  22.3 
 
 		 671 aa  48.9  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3466  hypothetical protein  22.29 
 
 		 785 aa  47.8  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.724503 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4048  hypothetical protein  24.66 
 
 		 764 aa  46.2  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3353  hypothetical protein  26.36 
 
 		 856 aa  46.6  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0963  hypothetical protein  26.58 
 
 		 816 aa  45.8  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.830117  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>