103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_3098 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_3098  hypothetical protein  100 
 
 
789 aa  1639    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1187  hypothetical protein  77.06 
 
 
778 aa  1300    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3108  hypothetical protein  95.44 
 
 
788 aa  1565    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3251  hypothetical protein  95.94 
 
 
788 aa  1553    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1268  hypothetical protein  96.07 
 
 
789 aa  1578    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.487663  hitchhiker  0.00130496 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2696  hypothetical protein  33.72 
 
 
822 aa  427  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1479  hypothetical protein  32.63 
 
 
833 aa  363  5.0000000000000005e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0424195  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2764  hypothetical protein  31.62 
 
 
843 aa  359  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.185672  hitchhiker  0.000000808171 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2675  decaheme cytochrome c  27.27 
 
 
724 aa  200  9e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000733685  normal  0.0455406 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1779  decaheme cytochrome c  26.33 
 
 
735 aa  193  1e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1210  decaheme cytochrome c  26.12 
 
 
727 aa  188  3e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.260087  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2509  decaheme cytochrome c  26.47 
 
 
731 aa  187  5e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000184393  hitchhiker  0.000632353 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1579  decaheme cytochrome c  26.85 
 
 
730 aa  187  5e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00874065  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2524  decaheme cytochrome c  26.26 
 
 
725 aa  187  9e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000418395  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1209  decaheme cytochrome c  26.14 
 
 
729 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00658895  normal  0.327868 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2577  decaheme cytochrome c  26.19 
 
 
731 aa  185  3e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00883016  decreased coverage  0.00925289 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1590  decaheme cytochrome c  26.32 
 
 
730 aa  183  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000452412  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1613  decaheme cytochrome c  26.57 
 
 
730 aa  183  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000196014  normal  0.166254 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2636  decaheme cytochrome c  26 
 
 
724 aa  179  3e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2697  decaheme cytochrome c  25.51 
 
 
745 aa  177  6e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0633196  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2695  decaheme cytochrome c  24.05 
 
 
719 aa  168  4e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.734788  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1527  decaheme cytochrome c  23.24 
 
 
722 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1526  decaheme cytochrome c  23.67 
 
 
738 aa  157  6e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.324001  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2522  decaheme cytochrome c  30.39 
 
 
720 aa  157  9e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3124  decaheme cytochrome c  27.5 
 
 
741 aa  155  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00184772  hitchhiker  0.000042193 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2613  decaheme cytochrome c  23.58 
 
 
762 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000355284  hitchhiker  0.00000740819 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1478  decaheme cytochrome c  24.64 
 
 
761 aa  120  7e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.174618  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1659  decaheme cytochrome c  23.82 
 
 
758 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1473  decaheme cytochrome c  24.64 
 
 
761 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000262006  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1509  decaheme cytochrome c  24.56 
 
 
764 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.130709  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3573  decaheme cytochrome c  23.66 
 
 
716 aa  118  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2874  decaheme cytochrome c  24.38 
 
 
764 aa  118  5e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0594793  hitchhiker  0.00000891097 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1345  multiheme cytochrome  24.39 
 
 
742 aa  117  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2603  hypothetical protein  24.71 
 
 
742 aa  117  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430741  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2680  decaheme cytochrome c  23.39 
 
 
762 aa  115  3e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.463028  unclonable  0.0000643351 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2787  decaheme cytochrome c  23.27 
 
 
762 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0256712 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1244  hypothetical protein  24.26 
 
 
742 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0505071  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1380  decaheme cytochrome c  23.91 
 
 
765 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4083  hypothetical protein  29.66 
 
 
826 aa  108  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0344261  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2292  hypothetical protein  23.23 
 
 
782 aa  106  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2694  decaheme cytochrome c MtrF  25.25 
 
 
640 aa  102  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3371  hypothetical protein  21.77 
 
 
895 aa  101  6e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.94917  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1211  decaheme cytochrome c MtrF  24.63 
 
 
639 aa  97.8  7e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2228  decaheme cytochrome c  23.72 
 
 
755 aa  97.1  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.236086  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1528  decaheme cytochrome c MtrF  26.52 
 
 
646 aa  96.7  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0998  decaheme cytochrome c  22.4 
 
 
766 aa  94  9e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6275  decaheme c-type cytochrome, OmcA/MtrC family  24.83 
 
 
741 aa  92  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.772817 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0913  decaheme cytochrome c  22.17 
 
 
770 aa  91.3  6e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.546873  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0918  decaheme cytochrome c  22.13 
 
 
764 aa  90.5  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.613412  normal  0.552776 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3588  decaheme cytochrome c  25.06 
 
 
745 aa  90.1  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4254  decaheme cytochrome c  23.04 
 
 
729 aa  90.1  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.353597  unclonable  0.0000000280036 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003776  decaheme cytochrome c MtrF  21.91 
 
 
754 aa  88.2  6e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0875  hypothetical protein  21.55 
 
 
893 aa  86.7  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0421546 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1713  hypothetical protein  25.66 
 
 
945 aa  84.7  0.000000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.436521  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4079  hypothetical protein  26.74 
 
 
885 aa  82.8  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.299167  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1257  hypothetical protein  30.24 
 
 
762 aa  82.4  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2299  hypothetical protein  30.23 
 
 
809 aa  81.3  0.00000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2523  hypothetical protein  21.52 
 
 
757 aa  78.2  0.0000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2216  hypothetical protein  25.43 
 
 
898 aa  77  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.352223  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1421  hypothetical protein  29.91 
 
 
657 aa  76.6  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.515821 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2521  decaheme cytochrome c MtrF  24.67 
 
 
639 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1658  hypothetical protein  25.19 
 
 
898 aa  76.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.131846  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1731  multiheme cytochrome  25.19 
 
 
898 aa  75.1  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3200  hypothetical protein  23.38 
 
 
820 aa  72.8  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1580  decaheme cytochrome c MtrF  25.75 
 
 
639 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0766819  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2676  decaheme cytochrome c  22.28 
 
 
650 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000503474  normal  0.0214929 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1591  decaheme cytochrome c MtrF  33.5 
 
 
639 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000158979  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1614  decaheme cytochrome c MtrF  33.5 
 
 
639 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0474266  normal  0.168927 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2763  decaheme cytochrome c MtrF  33.5 
 
 
639 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0120659  hitchhiker  0.0000444921 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1780  decaheme cytochrome c MtrF  32.31 
 
 
639 aa  69.3  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2576  decaheme cytochrome c MtrF  31.9 
 
 
639 aa  68.6  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.134423  decreased coverage  0.00876105 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4080  hypothetical protein  24.63 
 
 
936 aa  67.8  0.0000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000183317  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2674  decaheme cytochrome c MtrF  31.9 
 
 
639 aa  67.8  0.0000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0899912  normal  0.105553 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2508  decaheme cytochrome c MtrF  31.98 
 
 
639 aa  67.4  0.0000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00292179  decreased coverage  0.000509076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2578  decaheme cytochrome c  22.28 
 
 
650 aa  67  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00427395  decreased coverage  0.00803379 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0910  hypothetical protein  21.39 
 
 
731 aa  65.9  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.688824 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1578  decaheme cytochrome c  22.37 
 
 
650 aa  65.9  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000205402  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1612  decaheme cytochrome c  22.41 
 
 
650 aa  65.9  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0130523  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0450  hypothetical protein  31.53 
 
 
687 aa  65.1  0.000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1589  decaheme cytochrome c  22.11 
 
 
650 aa  63.5  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000235795  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2765  decaheme cytochrome c  21.98 
 
 
650 aa  62.8  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00105295  hitchhiker  0.000000731399 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4517  hypothetical protein  29.51 
 
 
642 aa  61.6  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.247929 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2990  hypothetical protein  29.12 
 
 
680 aa  60.8  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2580  hypothetical protein  28.96 
 
 
677 aa  58.5  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3286  hypothetical protein  23.22 
 
 
714 aa  58.2  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.909593  hitchhiker  0.000000468411 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2698  decaheme cytochrome c  22.06 
 
 
671 aa  57  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0681671  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3263  hypothetical protein  28.49 
 
 
655 aa  53.5  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3163  hypothetical protein  29.05 
 
 
857 aa  53.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2507  hypothetical protein  46.77 
 
 
700 aa  53.1  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116766  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1409  hypothetical protein  30.53 
 
 
696 aa  52.8  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2843  hypothetical protein  30.14 
 
 
701 aa  52  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1515  hypothetical protein  30.14 
 
 
701 aa  52  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2991  hypothetical protein  30.14 
 
 
701 aa  52  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1356  hypothetical protein  46.77 
 
 
696 aa  51.2  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0734371 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2862  hypothetical protein  30.14 
 
 
698 aa  51.6  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1778  decaheme cytochrome c  22.22 
 
 
671 aa  51.2  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0447  hypothetical protein  28.26 
 
 
612 aa  50.4  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.476837 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3279  hypothetical protein  27.32 
 
 
854 aa  48.1  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0963  hypothetical protein  22.1 
 
 
816 aa  45.4  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.830117  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3466  hypothetical protein  22.16 
 
 
785 aa  44.7  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.724503 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>