99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1208 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2637  decaheme cytochrome c  51.78 
 
 		 653 aa  688    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2765  decaheme cytochrome c  65.71 
 
 		 650 aa  918    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00105295  hitchhiker  0.000000731399 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2676  decaheme cytochrome c  66.01 
 
 		 650 aa  917    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000503474  normal  0.0214929 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1208  decaheme cytochrome c  100 
 
 		 656 aa  1362    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.474569  normal  0.550051 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1612  decaheme cytochrome c  65.56 
 
 		 650 aa  914    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0130523  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2578  decaheme cytochrome c  66.31 
 
 		 650 aa  918    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00427395  decreased coverage  0.00803379 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1525  decaheme cytochrome c  53.17 
 
 		 660 aa  653    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.100516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1589  decaheme cytochrome c  65.71 
 
 		 650 aa  919    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000235795  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1578  decaheme cytochrome c  65.86 
 
 		 650 aa  918    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000205402  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1478  decaheme cytochrome c  57.89 
 
 		 663 aa  786    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000254716  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2510  decaheme cytochrome c  54.02 
 
 		 655 aa  696    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0178218  hitchhiker  0.000666167 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3125  decaheme cytochrome c  48.11 
 
 		 667 aa  591  1e-167  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00001045  hitchhiker  0.00000606277 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2525  decaheme cytochrome c  47.51 
 
 		 656 aa  566  1e-160  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000837992  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1778  decaheme cytochrome c  46.69 
 
 		 671 aa  552  1e-156  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2698  decaheme cytochrome c  45.52 
 
 		 671 aa  531  1e-149  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0681671  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1780  decaheme cytochrome c MtrF  32.44 
 
 		 639 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2576  decaheme cytochrome c MtrF  32.72 
 
 		 639 aa  310  5.9999999999999995e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.134423  decreased coverage  0.00876105 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2508  decaheme cytochrome c MtrF  32.12 
 
 		 639 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00292179  decreased coverage  0.000509076 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1580  decaheme cytochrome c MtrF  32.38 
 
 		 639 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0766819  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2674  decaheme cytochrome c MtrF  32.72 
 
 		 639 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0899912  normal  0.105553 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1211  decaheme cytochrome c MtrF  33.48 
 
 		 639 aa  300  4e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1614  decaheme cytochrome c MtrF  31.83 
 
 		 639 aa  299  1e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0474266  normal  0.168927 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1591  decaheme cytochrome c MtrF  32.08 
 
 		 639 aa  297  4e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000158979  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2763  decaheme cytochrome c MtrF  31.8 
 
 		 639 aa  294  3e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0120659  hitchhiker  0.0000444921 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2694  decaheme cytochrome c MtrF  33.58 
 
 		 640 aa  283  7.000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2521  decaheme cytochrome c MtrF  32.79 
 
 		 639 aa  274  3e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1528  decaheme cytochrome c MtrF  32.5 
 
 		 646 aa  267  5e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4048  hypothetical protein  24.62 
 
 		 764 aa  148  4.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3466  hypothetical protein  32.29 
 
 		 785 aa  139  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.724503 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2636  decaheme cytochrome c  26.15 
 
 		 724 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1527  decaheme cytochrome c  25.56 
 
 		 722 aa  125  3e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2522  decaheme cytochrome c  26.34 
 
 		 720 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1210  decaheme cytochrome c  25.16 
 
 		 727 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.260087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1590  decaheme cytochrome c  25.4 
 
 		 730 aa  117  5e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000452412  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2695  decaheme cytochrome c  24.47 
 
 		 719 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.734788  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1579  decaheme cytochrome c  24.76 
 
 		 730 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00874065  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2613  decaheme cytochrome c  26.27 
 
 		 762 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000355284  hitchhiker  0.00000740819 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1613  decaheme cytochrome c  25.27 
 
 		 730 aa  115  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000196014  normal  0.166254 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1209  decaheme cytochrome c  25.3 
 
 		 729 aa  113  9e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00658895  normal  0.327868 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2292  hypothetical protein  26.17 
 
 		 782 aa  110  6e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2675  decaheme cytochrome c  24.19 
 
 		 724 aa  109  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000733685  normal  0.0455406 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2524  decaheme cytochrome c  24.77 
 
 		 725 aa  109  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000418395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2680  decaheme cytochrome c  25.91 
 
 		 762 aa  106  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.463028  unclonable  0.0000643351 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2509  decaheme cytochrome c  23.76 
 
 		 731 aa  105  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000184393  hitchhiker  0.000632353 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3286  hypothetical protein  25.42 
 
 		 714 aa  106  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.909593  hitchhiker  0.000000468411 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1658  hypothetical protein  29.43 
 
 		 898 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.131846  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2216  hypothetical protein  29.4 
 
 		 898 aa  105  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.352223  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2787  decaheme cytochrome c  25.54 
 
 		 762 aa  103  7e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0256712 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3588  decaheme cytochrome c  27.92 
 
 		 745 aa  103  7e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1731  multiheme cytochrome  29.32 
 
 		 898 aa  103  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2577  decaheme cytochrome c  23.46 
 
 		 731 aa  97.1  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00883016  decreased coverage  0.00925289 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1779  decaheme cytochrome c  25.67 
 
 		 735 aa  96.7  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2299  hypothetical protein  26.34 
 
 		 809 aa  94  7e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1478  decaheme cytochrome c  25 
 
 		 761 aa  94  9e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.174618  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0875  hypothetical protein  23.32 
 
 		 893 aa  93.2  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0421546 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1473  decaheme cytochrome c  24.87 
 
 		 761 aa  93.6  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000262006  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3371  hypothetical protein  24.71 
 
 		 895 aa  93.6  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.94917  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2874  decaheme cytochrome c  24.9 
 
 		 764 aa  91.7  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0594793  hitchhiker  0.00000891097 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1659  decaheme cytochrome c  24.31 
 
 		 758 aa  92  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1509  decaheme cytochrome c  24.78 
 
 		 764 aa  91.7  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.130709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2228  decaheme cytochrome c  24.61 
 
 		 755 aa  90.9  7e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.236086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1380  decaheme cytochrome c  25.2 
 
 		 765 aa  90.5  8e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1526  decaheme cytochrome c  23.01 
 
 		 738 aa  89  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.324001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0918  decaheme cytochrome c  23.77 
 
 		 764 aa  88.2  4e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.613412  normal  0.552776 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2697  decaheme cytochrome c  26.22 
 
 		 745 aa  88.2  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0633196  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3573  decaheme cytochrome c  26.13 
 
 		 716 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4254  decaheme cytochrome c  25.29 
 
 		 729 aa  84.7  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.353597  unclonable  0.0000000280036 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4079  hypothetical protein  26.27 
 
 		 885 aa  84  0.000000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.299167  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2696  hypothetical protein  21.36 
 
 		 822 aa  73.9  0.000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3124  decaheme cytochrome c  26.81 
 
 		 741 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00184772  hitchhiker  0.000042193 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0913  decaheme cytochrome c  23.51 
 
 		 770 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.546873  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1713  hypothetical protein  25.61 
 
 		 945 aa  69.7  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.436521  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1244  hypothetical protein  25.17 
 
 		 742 aa  65.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0505071  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1345  multiheme cytochrome  24.16 
 
 		 742 aa  64.3  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0998  decaheme cytochrome c  27.39 
 
 		 766 aa  63.9  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3200  hypothetical protein  24.68 
 
 		 820 aa  62.8  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4080  hypothetical protein  22.06 
 
 		 936 aa  62  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000183317  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4083  hypothetical protein  22.87 
 
 		 826 aa  60.8  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0344261  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2603  hypothetical protein  24.41 
 
 		 742 aa  59.3  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430741  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0910  hypothetical protein  20.18 
 
 		 731 aa  59.7  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.688824 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2379  hypothetical protein  31.69 
 
 		 1111 aa  57  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.49944  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4517  hypothetical protein  22.97 
 
 		 642 aa  55.5  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.247929 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2523  hypothetical protein  22.25 
 
 		 757 aa  54.7  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1257  hypothetical protein  22.55 
 
 		 762 aa  53.5  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1421  hypothetical protein  25.39 
 
 		 657 aa  53.5  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.515821 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2990  hypothetical protein  25.39 
 
 		 680 aa  51.2  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3097  hypothetical protein  28 
 
 		 781 aa  51.2  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0450  hypothetical protein  38.54 
 
 		 687 aa  50.8  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0963  hypothetical protein  31.58 
 
 		 816 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.830117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6275  decaheme c-type cytochrome, OmcA/MtrC family  22.93 
 
 		 741 aa  48.9  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.772817 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2764  hypothetical protein  27.72 
 
 		 843 aa  45.8  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.185672  hitchhiker  0.000000808171 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2992  hypothetical protein  27.72 
 
 		 781 aa  46.6  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.507941  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2250  cytochrome c class III  27.73 
 
 		 538 aa  45.8  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000197158  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0447  hypothetical protein  31.25 
 
 		 612 aa  46.2  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.476837 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2507  hypothetical protein  24.35 
 
 		 700 aa  45.1  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116766  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1479  hypothetical protein  23.78 
 
 		 833 aa  45.1  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0424195  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0438  hypothetical protein  26.67 
 
 		 791 aa  45.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.398757  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3263  hypothetical protein  22.38 
 
 		 655 aa  43.9  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2580  hypothetical protein  23.63 
 
 		 677 aa  43.9  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>