27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0438 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3097  hypothetical protein  61.89 
 
 
781 aa  940    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0437  hypothetical protein  97.09 
 
 
791 aa  1506    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2992  hypothetical protein  62.26 
 
 
781 aa  962    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.507941  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4161  hypothetical protein  47.97 
 
 
785 aa  639    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0782432 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0438  hypothetical protein  100 
 
 
791 aa  1631    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.398757  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2907  hypothetical protein  72.31 
 
 
793 aa  1091    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0409  hypothetical protein  68.26 
 
 
782 aa  1065    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3353  hypothetical protein  25.6 
 
 
856 aa  83.2  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3163  hypothetical protein  28.39 
 
 
857 aa  75.5  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0910  hypothetical protein  25.69 
 
 
731 aa  70.9  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.688824 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3279  hypothetical protein  27.23 
 
 
854 aa  66.2  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4083  hypothetical protein  25.12 
 
 
826 aa  63.9  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0344261  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0998  decaheme cytochrome c  22.55 
 
 
766 aa  56.6  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003776  decaheme cytochrome c MtrF  22.89 
 
 
754 aa  54.7  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0875  hypothetical protein  23.26 
 
 
893 aa  53.1  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0421546 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2521  decaheme cytochrome c MtrF  23.04 
 
 
639 aa  53.1  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1731  multiheme cytochrome  26 
 
 
898 aa  51.6  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1780  decaheme cytochrome c MtrF  22.91 
 
 
639 aa  50.1  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2299  hypothetical protein  23.7 
 
 
809 aa  49.3  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1658  hypothetical protein  25.37 
 
 
898 aa  47.8  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.131846  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1257  hypothetical protein  21.84 
 
 
762 aa  47.8  0.0009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4079  hypothetical protein  25.31 
 
 
885 aa  47.4  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.299167  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1659  decaheme cytochrome c  21.57 
 
 
758 aa  47  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1580  decaheme cytochrome c MtrF  22.32 
 
 
639 aa  46.2  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0766819  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  50 
 
 
2851 aa  47  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1713  hypothetical protein  33.33 
 
 
945 aa  46.6  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.436521  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1208  decaheme cytochrome c  26.67 
 
 
656 aa  45.1  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.474569  normal  0.550051 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>