23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3097 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_0409  hypothetical protein  55.75 
 
 
782 aa  795    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2907  hypothetical protein  69.9 
 
 
793 aa  1018    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3097  hypothetical protein  100 
 
 
781 aa  1605    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0438  hypothetical protein  61.89 
 
 
791 aa  923    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.398757  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2992  hypothetical protein  97.44 
 
 
781 aa  1555    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.507941  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0437  hypothetical protein  61.31 
 
 
791 aa  906    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4161  hypothetical protein  55.35 
 
 
785 aa  780    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0782432 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3353  hypothetical protein  24.68 
 
 
856 aa  71.2  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3163  hypothetical protein  26.7 
 
 
857 aa  67.8  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003776  decaheme cytochrome c MtrF  21.83 
 
 
754 aa  60.8  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0910  hypothetical protein  26.21 
 
 
731 aa  60.8  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.688824 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3371  hypothetical protein  22.53 
 
 
895 aa  60.1  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.94917  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4080  hypothetical protein  22.38 
 
 
936 aa  59.7  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000183317  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3279  hypothetical protein  26.75 
 
 
854 aa  59.3  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1208  decaheme cytochrome c  28 
 
 
656 aa  51.6  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.474569  normal  0.550051 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4083  hypothetical protein  24.03 
 
 
826 aa  50.8  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0344261  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4079  hypothetical protein  31.34 
 
 
885 aa  49.3  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.299167  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1713  hypothetical protein  31.21 
 
 
945 aa  46.2  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.436521  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3098  hypothetical protein  23.09 
 
 
789 aa  45.8  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0875  hypothetical protein  20.77 
 
 
893 aa  45.8  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0421546 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3110  hypothetical protein  47.27 
 
 
916 aa  45.4  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2299  hypothetical protein  25.58 
 
 
809 aa  44.7  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  54.55 
 
 
2851 aa  44.3  0.009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>