109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003776 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003776  decaheme cytochrome c MtrF  100 
 
 		 754 aa  1575    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2696  hypothetical protein  22.53 
 
 		 822 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1211  decaheme cytochrome c MtrF  26.04 
 
 		 639 aa  99.8  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2694  decaheme cytochrome c MtrF  24.53 
 
 		 640 aa  99  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2576  decaheme cytochrome c MtrF  24.68 
 
 		 639 aa  98.2  5e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.134423  decreased coverage  0.00876105 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2508  decaheme cytochrome c MtrF  24.96 
 
 		 639 aa  97.8  6e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00292179  decreased coverage  0.000509076 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1580  decaheme cytochrome c MtrF  23.32 
 
 		 639 aa  95.9  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0766819  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1591  decaheme cytochrome c MtrF  23.17 
 
 		 639 aa  95.1  4e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000158979  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2763  decaheme cytochrome c MtrF  25.52 
 
 		 639 aa  94.7  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0120659  hitchhiker  0.0000444921 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1614  decaheme cytochrome c MtrF  25.39 
 
 		 639 aa  93.6  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0474266  normal  0.168927 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1187  hypothetical protein  23.94 
 
 		 778 aa  91.7  5e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3098  hypothetical protein  21.91 
 
 		 789 aa  89.7  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0918  decaheme cytochrome c  22.65 
 
 		 764 aa  89.7  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.613412  normal  0.552776 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0998  decaheme cytochrome c  24.4 
 
 		 766 aa  89  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1528  decaheme cytochrome c MtrF  23.78 
 
 		 646 aa  89  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1780  decaheme cytochrome c MtrF  24.37 
 
 		 639 aa  87.8  6e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1268  hypothetical protein  22.43 
 
 		 789 aa  87.8  7e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.487663  hitchhiker  0.00130496 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0913  decaheme cytochrome c  22.92 
 
 		 770 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.546873  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1479  hypothetical protein  31.5 
 
 		 833 aa  84.7  0.000000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0424195  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3108  hypothetical protein  21.88 
 
 		 788 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1509  decaheme cytochrome c  24.84 
 
 		 764 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.130709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1478  decaheme cytochrome c  24.68 
 
 		 761 aa  82  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.174618  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2874  decaheme cytochrome c  24.68 
 
 		 764 aa  82  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0594793  hitchhiker  0.00000891097 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2523  hypothetical protein  22.07 
 
 		 757 aa  81.6  0.00000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3251  hypothetical protein  21.95 
 
 		 788 aa  81.3  0.00000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2674  decaheme cytochrome c MtrF  24.07 
 
 		 639 aa  81.3  0.00000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0899912  normal  0.105553 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1473  decaheme cytochrome c  24.52 
 
 		 761 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000262006  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2764  hypothetical protein  31.96 
 
 		 843 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.185672  hitchhiker  0.000000808171 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2299  hypothetical protein  22.27 
 
 		 809 aa  72.8  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2613  decaheme cytochrome c  23.41 
 
 		 762 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000355284  hitchhiker  0.00000740819 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2787  decaheme cytochrome c  23.27 
 
 		 762 aa  72  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0256712 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2680  decaheme cytochrome c  23.18 
 
 		 762 aa  72  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.463028  unclonable  0.0000643351 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1659  decaheme cytochrome c  23.5 
 
 		 758 aa  70.9  0.00000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4083  hypothetical protein  29.24 
 
 		 826 aa  70.9  0.00000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0344261  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1380  decaheme cytochrome c  23.97 
 
 		 765 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1257  hypothetical protein  20.93 
 
 		 762 aa  70.5  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1527  decaheme cytochrome c  21.43 
 
 		 722 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2521  decaheme cytochrome c MtrF  28.02 
 
 		 639 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2216  hypothetical protein  27.99 
 
 		 898 aa  68.9  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.352223  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2636  decaheme cytochrome c  20.85 
 
 		 724 aa  68.6  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2637  decaheme cytochrome c  22.11 
 
 		 653 aa  68.6  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2992  hypothetical protein  22.51 
 
 		 781 aa  68.2  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.507941  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2292  hypothetical protein  21.68 
 
 		 782 aa  67.8  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2228  decaheme cytochrome c  21.41 
 
 		 755 aa  65.5  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.236086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2522  decaheme cytochrome c  22.59 
 
 		 720 aa  65.5  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3371  hypothetical protein  22.7 
 
 		 895 aa  65.1  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.94917  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4080  hypothetical protein  25.46 
 
 		 936 aa  64.3  0.000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000183317  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1731  multiheme cytochrome  27.61 
 
 		 898 aa  64.3  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1658  hypothetical protein  27.99 
 
 		 898 aa  64.3  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.131846  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1478  decaheme cytochrome c  20.28 
 
 		 663 aa  63.5  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000254716  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1210  decaheme cytochrome c  21.22 
 
 		 727 aa  62.8  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.260087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3263  hypothetical protein  32.11 
 
 		 655 aa  61.2  0.00000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1345  multiheme cytochrome  29.29 
 
 		 742 aa  60.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1209  decaheme cytochrome c  20.12 
 
 		 729 aa  60.1  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00658895  normal  0.327868 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3097  hypothetical protein  21.72 
 
 		 781 aa  60.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1244  hypothetical protein  29.29 
 
 		 742 aa  60.5  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0505071  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2603  hypothetical protein  28.79 
 
 		 742 aa  58.9  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430741  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2507  hypothetical protein  27.35 
 
 		 700 aa  58.9  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116766  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3286  hypothetical protein  21.27 
 
 		 714 aa  57.8  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.909593  hitchhiker  0.000000468411 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2695  decaheme cytochrome c  21.68 
 
 		 719 aa  57.8  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.734788  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3573  decaheme cytochrome c  22.04 
 
 		 716 aa  57.8  0.0000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2676  decaheme cytochrome c  20.72 
 
 		 650 aa  57.4  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000503474  normal  0.0214929 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1356  hypothetical protein  30 
 
 		 696 aa  57  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0734371 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1590  decaheme cytochrome c  21.34 
 
 		 730 aa  57  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000452412  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3125  decaheme cytochrome c  21.38 
 
 		 667 aa  57  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00001045  hitchhiker  0.00000606277 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4517  hypothetical protein  30.65 
 
 		 642 aa  56.6  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.247929 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4079  hypothetical protein  22.79 
 
 		 885 aa  56.2  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.299167  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1409  hypothetical protein  30 
 
 		 696 aa  56.6  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1778  decaheme cytochrome c  21.23 
 
 		 671 aa  55.5  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3200  hypothetical protein  22.7 
 
 		 820 aa  55.5  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1713  hypothetical protein  22.25 
 
 		 945 aa  55.8  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.436521  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2843  hypothetical protein  27.05 
 
 		 701 aa  55.1  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2991  hypothetical protein  27.05 
 
 		 701 aa  55.1  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1515  hypothetical protein  27.05 
 
 		 701 aa  55.1  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2765  decaheme cytochrome c  20.73 
 
 		 650 aa  54.7  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00105295  hitchhiker  0.000000731399 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1579  decaheme cytochrome c  21.21 
 
 		 730 aa  54.3  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00874065  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1613  decaheme cytochrome c  21.21 
 
 		 730 aa  54.7  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000196014  normal  0.166254 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1612  decaheme cytochrome c  20.5 
 
 		 650 aa  54.3  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0130523  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2578  decaheme cytochrome c  20.79 
 
 		 650 aa  53.5  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00427395  decreased coverage  0.00803379 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2990  hypothetical protein  25.71 
 
 		 680 aa  53.9  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2862  hypothetical protein  27.05 
 
 		 698 aa  53.9  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0438  hypothetical protein  22.76 
 
 		 791 aa  53.5  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.398757  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2907  hypothetical protein  23.06 
 
 		 793 aa  53.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1421  hypothetical protein  27.66 
 
 		 657 aa  53.1  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.515821 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2524  decaheme cytochrome c  23.01 
 
 		 725 aa  52.8  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000418395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2525  decaheme cytochrome c  22.88 
 
 		 656 aa  52.4  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000837992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2580  hypothetical protein  27.8 
 
 		 677 aa  52.8  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1578  decaheme cytochrome c  20.5 
 
 		 650 aa  52.4  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000205402  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2510  decaheme cytochrome c  21.9 
 
 		 655 aa  52  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0178218  hitchhiker  0.000666167 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1589  decaheme cytochrome c  20.5 
 
 		 650 aa  52  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000235795  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2675  decaheme cytochrome c  20.87 
 
 		 724 aa  51.6  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000733685  normal  0.0455406 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0447  hypothetical protein  29.61 
 
 		 612 aa  50.8  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.476837 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4161  hypothetical protein  21.04 
 
 		 785 aa  50.4  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0782432 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3588  decaheme cytochrome c  21.68 
 
 		 745 aa  50.4  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0437  hypothetical protein  22.36 
 
 		 791 aa  50.4  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2697  decaheme cytochrome c  23.23 
 
 		 745 aa  49.3  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0633196  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2509  decaheme cytochrome c  20.6 
 
 		 731 aa  48.5  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000184393  hitchhiker  0.000632353 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4048  hypothetical protein  21.29 
 
 		 764 aa  48.5  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0409  hypothetical protein  27.05 
 
 		 782 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0963  hypothetical protein  23.32 
 
 		 816 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.830117  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>