105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1779 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1779  decaheme cytochrome c  100 
 
 		 735 aa  1530    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2509  decaheme cytochrome c  73.76 
 
 		 731 aa  1083    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000184393  hitchhiker  0.000632353 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2577  decaheme cytochrome c  73.49 
 
 		 731 aa  1070    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00883016  decreased coverage  0.00925289 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2636  decaheme cytochrome c  57.51 
 
 		 724 aa  835    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2675  decaheme cytochrome c  76.25 
 
 		 724 aa  1116    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000733685  normal  0.0455406 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1209  decaheme cytochrome c  64.57 
 
 		 729 aa  960    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00658895  normal  0.327868 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1210  decaheme cytochrome c  63.02 
 
 		 727 aa  968    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.260087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1590  decaheme cytochrome c  74.9 
 
 		 730 aa  1114    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000452412  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2522  decaheme cytochrome c  59.92 
 
 		 720 aa  877    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2524  decaheme cytochrome c  64.11 
 
 		 725 aa  961    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000418395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1579  decaheme cytochrome c  74.76 
 
 		 730 aa  1114    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00874065  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1526  decaheme cytochrome c  62.1 
 
 		 738 aa  916    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.324001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1527  decaheme cytochrome c  64.35 
 
 		 722 aa  935    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2695  decaheme cytochrome c  62.59 
 
 		 719 aa  918    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.734788  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2697  decaheme cytochrome c  58.98 
 
 		 745 aa  898    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0633196  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1613  decaheme cytochrome c  74.9 
 
 		 730 aa  1114    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000196014  normal  0.166254 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3124  decaheme cytochrome c  63.8 
 
 		 741 aa  963    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00184772  hitchhiker  0.000042193 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3588  decaheme cytochrome c  37.65 
 
 		 745 aa  458  1e-127  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3573  decaheme cytochrome c  36.8 
 
 		 716 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4254  decaheme cytochrome c  36.91 
 
 		 729 aa  427  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.353597  unclonable  0.0000000280036 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2764  hypothetical protein  30.45 
 
 		 843 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.185672  hitchhiker  0.000000808171 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2696  hypothetical protein  35.53 
 
 		 822 aa  211  3e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1479  hypothetical protein  30.02 
 
 		 833 aa  210  7e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0424195  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3108  hypothetical protein  26.85 
 
 		 788 aa  196  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3098  hypothetical protein  26.35 
 
 		 789 aa  193  1e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3251  hypothetical protein  26.07 
 
 		 788 aa  189  1e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2523  hypothetical protein  27.54 
 
 		 757 aa  189  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1268  hypothetical protein  26.28 
 
 		 789 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.487663  hitchhiker  0.00130496 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1187  hypothetical protein  30.94 
 
 		 778 aa  177  6e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1780  decaheme cytochrome c MtrF  26.69 
 
 		 639 aa  170  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2576  decaheme cytochrome c MtrF  27.58 
 
 		 639 aa  157  8e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.134423  decreased coverage  0.00876105 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2508  decaheme cytochrome c MtrF  27.68 
 
 		 639 aa  156  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00292179  decreased coverage  0.000509076 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2674  decaheme cytochrome c MtrF  27.34 
 
 		 639 aa  156  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0899912  normal  0.105553 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1211  decaheme cytochrome c MtrF  25.46 
 
 		 639 aa  144  4e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1580  decaheme cytochrome c MtrF  25.17 
 
 		 639 aa  144  5e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0766819  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1591  decaheme cytochrome c MtrF  24.93 
 
 		 639 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000158979  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1528  decaheme cytochrome c MtrF  24.52 
 
 		 646 aa  139  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1614  decaheme cytochrome c MtrF  25.13 
 
 		 639 aa  139  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0474266  normal  0.168927 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2763  decaheme cytochrome c MtrF  25.21 
 
 		 639 aa  135  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0120659  hitchhiker  0.0000444921 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2578  decaheme cytochrome c  24.58 
 
 		 650 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00427395  decreased coverage  0.00803379 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2676  decaheme cytochrome c  27.75 
 
 		 650 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000503474  normal  0.0214929 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1589  decaheme cytochrome c  24.9 
 
 		 650 aa  125  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000235795  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1578  decaheme cytochrome c  24.74 
 
 		 650 aa  125  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000205402  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1612  decaheme cytochrome c  24.35 
 
 		 650 aa  124  6e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0130523  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2765  decaheme cytochrome c  27.98 
 
 		 650 aa  122  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00105295  hitchhiker  0.000000731399 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2521  decaheme cytochrome c MtrF  25.89 
 
 		 639 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2694  decaheme cytochrome c MtrF  24.4 
 
 		 640 aa  120  6e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2216  hypothetical protein  28.71 
 
 		 898 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.352223  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1658  hypothetical protein  28.54 
 
 		 898 aa  112  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.131846  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1731  multiheme cytochrome  28.54 
 
 		 898 aa  112  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1208  decaheme cytochrome c  26.21 
 
 		 656 aa  109  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.474569  normal  0.550051 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3125  decaheme cytochrome c  24.04 
 
 		 667 aa  106  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00001045  hitchhiker  0.00000606277 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6275  decaheme c-type cytochrome, OmcA/MtrC family  29.61 
 
 		 741 aa  103  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.772817 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2525  decaheme cytochrome c  24.84 
 
 		 656 aa  103  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000837992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1478  decaheme cytochrome c  26.06 
 
 		 663 aa  103  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000254716  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4083  hypothetical protein  29.14 
 
 		 826 aa  100  7e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0344261  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2292  hypothetical protein  29.53 
 
 		 782 aa  98.2  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3286  hypothetical protein  22.82 
 
 		 714 aa  95.5  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.909593  hitchhiker  0.000000468411 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3200  hypothetical protein  24.28 
 
 		 820 aa  93.2  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1257  hypothetical protein  24.11 
 
 		 762 aa  93.2  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2510  decaheme cytochrome c  23.04 
 
 		 655 aa  90.1  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0178218  hitchhiker  0.000666167 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0910  hypothetical protein  23.61 
 
 		 731 aa  87.4  9e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.688824 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1244  hypothetical protein  23.42 
 
 		 742 aa  87  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0505071  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1778  decaheme cytochrome c  22.95 
 
 		 671 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0998  decaheme cytochrome c  23.59 
 
 		 766 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2637  decaheme cytochrome c  26.02 
 
 		 653 aa  84.3  0.000000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2603  hypothetical protein  23.44 
 
 		 742 aa  83.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430741  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0918  decaheme cytochrome c  23.73 
 
 		 764 aa  83.2  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.613412  normal  0.552776 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1345  multiheme cytochrome  23.22 
 
 		 742 aa  83.2  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2299  hypothetical protein  26.84 
 
 		 809 aa  80.9  0.00000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0913  decaheme cytochrome c  24.52 
 
 		 770 aa  77.4  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.546873  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3466  hypothetical protein  24.81 
 
 		 785 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.724503 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1713  hypothetical protein  24.94 
 
 		 945 aa  69.7  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.436521  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4079  hypothetical protein  24.51 
 
 		 885 aa  69.3  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.299167  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2228  decaheme cytochrome c  22.38 
 
 		 755 aa  67.4  0.0000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.236086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1380  decaheme cytochrome c  24.58 
 
 		 765 aa  63.2  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4048  hypothetical protein  20.41 
 
 		 764 aa  63.2  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0875  hypothetical protein  24.61 
 
 		 893 aa  63.2  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0421546 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3371  hypothetical protein  23.54 
 
 		 895 aa  62.8  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.94917  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0963  hypothetical protein  23.15 
 
 		 816 aa  61.2  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.830117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2379  hypothetical protein  27.86 
 
 		 1111 aa  60.5  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.49944  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2507  hypothetical protein  26.77 
 
 		 700 aa  59.3  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116766  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2698  decaheme cytochrome c  26.57 
 
 		 671 aa  58.5  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0681671  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4080  hypothetical protein  22.09 
 
 		 936 aa  56.2  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000183317  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003776  decaheme cytochrome c MtrF  22.9 
 
 		 754 aa  56.2  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1525  decaheme cytochrome c  23.53 
 
 		 660 aa  53.1  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.100516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4517  hypothetical protein  28.02 
 
 		 642 aa  52  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.247929 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1356  hypothetical protein  27.03 
 
 		 696 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0734371 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1478  decaheme cytochrome c  23.68 
 
 		 761 aa  49.3  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.174618  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2580  hypothetical protein  29.47 
 
 		 677 aa  49.7  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1473  decaheme cytochrome c  23.68 
 
 		 761 aa  49.3  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000262006  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1409  hypothetical protein  27.03 
 
 		 696 aa  48.9  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2990  hypothetical protein  29.03 
 
 		 680 aa  48.9  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2843  hypothetical protein  28.11 
 
 		 701 aa  49.3  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2862  hypothetical protein  28.11 
 
 		 698 aa  49.3  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2991  hypothetical protein  28.11 
 
 		 701 aa  48.9  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1515  hypothetical protein  28.11 
 
 		 701 aa  49.3  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3263  hypothetical protein  28.73 
 
 		 655 aa  46.2  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0447  hypothetical protein  21.34 
 
 		 612 aa  45.4  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.476837 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3353  hypothetical protein  32.18 
 
 		 856 aa  45.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>