104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2577 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1779  decaheme cytochrome c  73.49 
 
 		 735 aa  1083    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2509  decaheme cytochrome c  93.71 
 
 		 731 aa  1411    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000184393  hitchhiker  0.000632353 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2577  decaheme cytochrome c  100 
 
 		 731 aa  1523    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00883016  decreased coverage  0.00925289 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2636  decaheme cytochrome c  60.87 
 
 		 724 aa  902    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2675  decaheme cytochrome c  90.03 
 
 		 724 aa  1319    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000733685  normal  0.0455406 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1209  decaheme cytochrome c  69.19 
 
 		 729 aa  1051    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00658895  normal  0.327868 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1210  decaheme cytochrome c  68.03 
 
 		 727 aa  1041    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.260087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1590  decaheme cytochrome c  84.29 
 
 		 730 aa  1261    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000452412  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2522  decaheme cytochrome c  64.74 
 
 		 720 aa  948    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2524  decaheme cytochrome c  70.96 
 
 		 725 aa  1089    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000418395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1579  decaheme cytochrome c  84.02 
 
 		 730 aa  1260    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00874065  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1526  decaheme cytochrome c  60.03 
 
 		 738 aa  895    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.324001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1527  decaheme cytochrome c  67.23 
 
 		 722 aa  994    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2695  decaheme cytochrome c  66.25 
 
 		 719 aa  987    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.734788  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2697  decaheme cytochrome c  51.3 
 
 		 745 aa  759    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0633196  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1613  decaheme cytochrome c  84.29 
 
 		 730 aa  1262    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000196014  normal  0.166254 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3124  decaheme cytochrome c  55.51 
 
 		 741 aa  833    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00184772  hitchhiker  0.000042193 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3588  decaheme cytochrome c  37.4 
 
 		 745 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4254  decaheme cytochrome c  37.29 
 
 		 729 aa  442  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.353597  unclonable  0.0000000280036 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3573  decaheme cytochrome c  36.45 
 
 		 716 aa  438  1e-121  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2696  hypothetical protein  28.62 
 
 		 822 aa  237  6e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2764  hypothetical protein  30.14 
 
 		 843 aa  225  3e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.185672  hitchhiker  0.000000808171 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1479  hypothetical protein  29.23 
 
 		 833 aa  201  5e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0424195  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2523  hypothetical protein  28.12 
 
 		 757 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3108  hypothetical protein  27.44 
 
 		 788 aa  196  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3098  hypothetical protein  26.51 
 
 		 789 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1268  hypothetical protein  26.39 
 
 		 789 aa  183  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.487663  hitchhiker  0.00130496 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1187  hypothetical protein  26.14 
 
 		 778 aa  182  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3251  hypothetical protein  26.83 
 
 		 788 aa  181  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1780  decaheme cytochrome c MtrF  26.21 
 
 		 639 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2576  decaheme cytochrome c MtrF  26.17 
 
 		 639 aa  165  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.134423  decreased coverage  0.00876105 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2508  decaheme cytochrome c MtrF  26.31 
 
 		 639 aa  163  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00292179  decreased coverage  0.000509076 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2674  decaheme cytochrome c MtrF  26.28 
 
 		 639 aa  162  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0899912  normal  0.105553 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1580  decaheme cytochrome c MtrF  26.01 
 
 		 639 aa  161  4e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0766819  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1591  decaheme cytochrome c MtrF  25.91 
 
 		 639 aa  159  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000158979  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1614  decaheme cytochrome c MtrF  25.88 
 
 		 639 aa  158  4e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0474266  normal  0.168927 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2763  decaheme cytochrome c MtrF  25.68 
 
 		 639 aa  154  5e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0120659  hitchhiker  0.0000444921 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1211  decaheme cytochrome c MtrF  25.2 
 
 		 639 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1528  decaheme cytochrome c MtrF  25.69 
 
 		 646 aa  142  3e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2578  decaheme cytochrome c  24.8 
 
 		 650 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00427395  decreased coverage  0.00803379 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2676  decaheme cytochrome c  24.8 
 
 		 650 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000503474  normal  0.0214929 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1589  decaheme cytochrome c  25.5 
 
 		 650 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000235795  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1578  decaheme cytochrome c  25.36 
 
 		 650 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000205402  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1612  decaheme cytochrome c  25.36 
 
 		 650 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0130523  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2765  decaheme cytochrome c  24.97 
 
 		 650 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00105295  hitchhiker  0.000000731399 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2521  decaheme cytochrome c MtrF  24.8 
 
 		 639 aa  126  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2216  hypothetical protein  29.06 
 
 		 898 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.352223  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2694  decaheme cytochrome c MtrF  24.82 
 
 		 640 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1658  hypothetical protein  28.33 
 
 		 898 aa  115  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.131846  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1731  multiheme cytochrome  28.57 
 
 		 898 aa  115  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1208  decaheme cytochrome c  23.69 
 
 		 656 aa  110  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.474569  normal  0.550051 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3125  decaheme cytochrome c  23.46 
 
 		 667 aa  107  5e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00001045  hitchhiker  0.00000606277 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6275  decaheme c-type cytochrome, OmcA/MtrC family  34.34 
 
 		 741 aa  106  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.772817 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4083  hypothetical protein  29.03 
 
 		 826 aa  105  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0344261  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3200  hypothetical protein  31.32 
 
 		 820 aa  104  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1478  decaheme cytochrome c  23.55 
 
 		 663 aa  104  5e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000254716  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1778  decaheme cytochrome c  23.42 
 
 		 671 aa  104  7e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2510  decaheme cytochrome c  23 
 
 		 655 aa  98.2  5e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0178218  hitchhiker  0.000666167 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2292  hypothetical protein  25.53 
 
 		 782 aa  97.8  6e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1345  multiheme cytochrome  26.27 
 
 		 742 aa  96.3  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2637  decaheme cytochrome c  23.51 
 
 		 653 aa  95.9  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2603  hypothetical protein  26.1 
 
 		 742 aa  92.8  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430741  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1244  hypothetical protein  26.1 
 
 		 742 aa  88.6  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0505071  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1257  hypothetical protein  23.28 
 
 		 762 aa  88.2  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0910  hypothetical protein  24.92 
 
 		 731 aa  86.3  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.688824 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2299  hypothetical protein  27.39 
 
 		 809 aa  85.9  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2698  decaheme cytochrome c  23.78 
 
 		 671 aa  85.1  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0681671  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3286  hypothetical protein  22.59 
 
 		 714 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.909593  hitchhiker  0.000000468411 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0998  decaheme cytochrome c  23.24 
 
 		 766 aa  80.5  0.00000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2525  decaheme cytochrome c  25.87 
 
 		 656 aa  76.6  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000837992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0913  decaheme cytochrome c  24.23 
 
 		 770 aa  74.7  0.000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.546873  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1525  decaheme cytochrome c  23.75 
 
 		 660 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.100516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2228  decaheme cytochrome c  23.13 
 
 		 755 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.236086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0918  decaheme cytochrome c  22.76 
 
 		 764 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.613412  normal  0.552776 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3466  hypothetical protein  23.7 
 
 		 785 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.724503 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4048  hypothetical protein  22.9 
 
 		 764 aa  68.6  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1409  hypothetical protein  22.69 
 
 		 696 aa  67  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4079  hypothetical protein  26.09 
 
 		 885 aa  65.9  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.299167  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1421  hypothetical protein  22.76 
 
 		 657 aa  64.3  0.000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.515821 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1356  hypothetical protein  22.69 
 
 		 696 aa  64.3  0.000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0734371 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1713  hypothetical protein  25.22 
 
 		 945 aa  63.9  0.000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.436521  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4080  hypothetical protein  25.06 
 
 		 936 aa  60.1  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000183317  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2507  hypothetical protein  29.12 
 
 		 700 aa  60.1  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116766  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0963  hypothetical protein  21.8 
 
 		 816 aa  60.1  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.830117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003776  decaheme cytochrome c MtrF  21.35 
 
 		 754 aa  60.1  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3371  hypothetical protein  22.85 
 
 		 895 aa  60.1  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.94917  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0875  hypothetical protein  24.72 
 
 		 893 aa  58.9  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0421546 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2379  hypothetical protein  30 
 
 		 1111 aa  57  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.49944  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2862  hypothetical protein  27.32 
 
 		 698 aa  54.3  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2843  hypothetical protein  26.78 
 
 		 701 aa  53.1  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2991  hypothetical protein  26.78 
 
 		 701 aa  52.8  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1515  hypothetical protein  26.78 
 
 		 701 aa  52.8  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2990  hypothetical protein  26.37 
 
 		 680 aa  50.8  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2580  hypothetical protein  22.83 
 
 		 677 aa  50.1  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4517  hypothetical protein  28.72 
 
 		 642 aa  50.1  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.247929 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1473  decaheme cytochrome c  22.71 
 
 		 761 aa  48.9  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000262006  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1478  decaheme cytochrome c  22.71 
 
 		 761 aa  48.9  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.174618  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1659  decaheme cytochrome c  23.63 
 
 		 758 aa  47.8  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0450  hypothetical protein  27.56 
 
 		 687 aa  47  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2613  decaheme cytochrome c  24.77 
 
 		 762 aa  45.8  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000355284  hitchhiker  0.00000740819 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>