102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1527 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1779  decaheme cytochrome c  64.32 
 
 		 735 aa  929    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2509  decaheme cytochrome c  67.24 
 
 		 731 aa  984    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000184393  hitchhiker  0.000632353 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2577  decaheme cytochrome c  67.24 
 
 		 731 aa  973    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00883016  decreased coverage  0.00925289 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2636  decaheme cytochrome c  63.67 
 
 		 724 aa  944    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2675  decaheme cytochrome c  70.94 
 
 		 724 aa  1033    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000733685  normal  0.0455406 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1209  decaheme cytochrome c  66.48 
 
 		 729 aa  1009    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00658895  normal  0.327868 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1210  decaheme cytochrome c  62.05 
 
 		 727 aa  945    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.260087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1590  decaheme cytochrome c  68.05 
 
 		 730 aa  1003    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000452412  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2522  decaheme cytochrome c  69.72 
 
 		 720 aa  1089    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2524  decaheme cytochrome c  69.62 
 
 		 725 aa  1054    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000418395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1579  decaheme cytochrome c  67.76 
 
 		 730 aa  1003    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00874065  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1526  decaheme cytochrome c  61.96 
 
 		 738 aa  930    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.324001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1527  decaheme cytochrome c  100 
 
 		 722 aa  1506    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2695  decaheme cytochrome c  73.47 
 
 		 719 aa  1125    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.734788  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2697  decaheme cytochrome c  53.35 
 
 		 745 aa  787    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0633196  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1613  decaheme cytochrome c  68.05 
 
 		 730 aa  1005    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000196014  normal  0.166254 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3124  decaheme cytochrome c  57.18 
 
 		 741 aa  836    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00184772  hitchhiker  0.000042193 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3588  decaheme cytochrome c  37.52 
 
 		 745 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4254  decaheme cytochrome c  37.79 
 
 		 729 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.353597  unclonable  0.0000000280036 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3573  decaheme cytochrome c  35.2 
 
 		 716 aa  395  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2696  hypothetical protein  37.7 
 
 		 822 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2764  hypothetical protein  33.51 
 
 		 843 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.185672  hitchhiker  0.000000808171 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1479  hypothetical protein  32.72 
 
 		 833 aa  158  3e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0424195  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3098  hypothetical protein  23.54 
 
 		 789 aa  157  4e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1187  hypothetical protein  23.86 
 
 		 778 aa  158  4e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1268  hypothetical protein  23.57 
 
 		 789 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.487663  hitchhiker  0.00130496 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3108  hypothetical protein  23.32 
 
 		 788 aa  156  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3251  hypothetical protein  22.98 
 
 		 788 aa  153  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2523  hypothetical protein  26.08 
 
 		 757 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2676  decaheme cytochrome c  24.74 
 
 		 650 aa  139  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000503474  normal  0.0214929 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1580  decaheme cytochrome c MtrF  24.03 
 
 		 639 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0766819  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2578  decaheme cytochrome c  24.22 
 
 		 650 aa  137  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00427395  decreased coverage  0.00803379 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1614  decaheme cytochrome c MtrF  23.89 
 
 		 639 aa  137  9e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0474266  normal  0.168927 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1591  decaheme cytochrome c MtrF  23.93 
 
 		 639 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000158979  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2674  decaheme cytochrome c MtrF  24.13 
 
 		 639 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0899912  normal  0.105553 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1780  decaheme cytochrome c MtrF  23.74 
 
 		 639 aa  135  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2763  decaheme cytochrome c MtrF  23.33 
 
 		 639 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0120659  hitchhiker  0.0000444921 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1612  decaheme cytochrome c  23.92 
 
 		 650 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0130523  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2765  decaheme cytochrome c  23.92 
 
 		 650 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00105295  hitchhiker  0.000000731399 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2508  decaheme cytochrome c MtrF  23.61 
 
 		 639 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00292179  decreased coverage  0.000509076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2576  decaheme cytochrome c MtrF  23.82 
 
 		 639 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.134423  decreased coverage  0.00876105 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1211  decaheme cytochrome c MtrF  24.53 
 
 		 639 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1578  decaheme cytochrome c  23.79 
 
 		 650 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000205402  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1589  decaheme cytochrome c  23.79 
 
 		 650 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000235795  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1208  decaheme cytochrome c  25.56 
 
 		 656 aa  125  4e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.474569  normal  0.550051 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2637  decaheme cytochrome c  23.84 
 
 		 653 aa  117  5e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1528  decaheme cytochrome c MtrF  22.77 
 
 		 646 aa  108  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2216  hypothetical protein  28.68 
 
 		 898 aa  107  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.352223  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1658  hypothetical protein  28.37 
 
 		 898 aa  106  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.131846  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1731  multiheme cytochrome  28.37 
 
 		 898 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0910  hypothetical protein  23.44 
 
 		 731 aa  104  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.688824 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2521  decaheme cytochrome c MtrF  23.36 
 
 		 639 aa  104  5e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3125  decaheme cytochrome c  22.95 
 
 		 667 aa  104  6e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00001045  hitchhiker  0.00000606277 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4083  hypothetical protein  26.99 
 
 		 826 aa  103  8e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0344261  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6275  decaheme c-type cytochrome, OmcA/MtrC family  25.93 
 
 		 741 aa  102  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.772817 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2694  decaheme cytochrome c MtrF  22.56 
 
 		 640 aa  100  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1478  decaheme cytochrome c  23.15 
 
 		 663 aa  96.3  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000254716  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1525  decaheme cytochrome c  22.67 
 
 		 660 aa  94  8e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.100516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1257  hypothetical protein  23.11 
 
 		 762 aa  93.2  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1778  decaheme cytochrome c  21.85 
 
 		 671 aa  90.9  8e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2292  hypothetical protein  28.53 
 
 		 782 aa  89  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2510  decaheme cytochrome c  22.15 
 
 		 655 aa  87.8  6e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0178218  hitchhiker  0.000666167 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3200  hypothetical protein  26.35 
 
 		 820 aa  84.7  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2299  hypothetical protein  26.53 
 
 		 809 aa  84.3  0.000000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0998  decaheme cytochrome c  23.96 
 
 		 766 aa  84  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2698  decaheme cytochrome c  22.59 
 
 		 671 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0681671  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2525  decaheme cytochrome c  20.95 
 
 		 656 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000837992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3286  hypothetical protein  21.11 
 
 		 714 aa  78.2  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.909593  hitchhiker  0.000000468411 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1345  multiheme cytochrome  23.34 
 
 		 742 aa  75.1  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1380  decaheme cytochrome c  22.5 
 
 		 765 aa  72  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1244  hypothetical protein  22.84 
 
 		 742 aa  71.2  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0505071  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2603  hypothetical protein  23.37 
 
 		 742 aa  70.1  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430741  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0918  decaheme cytochrome c  21.67 
 
 		 764 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.613412  normal  0.552776 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003776  decaheme cytochrome c MtrF  21.43 
 
 		 754 aa  69.3  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2379  hypothetical protein  25.27 
 
 		 1111 aa  67.8  0.0000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.49944  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4079  hypothetical protein  23.77 
 
 		 885 aa  67.4  0.0000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.299167  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1659  decaheme cytochrome c  23.65 
 
 		 758 aa  67  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0913  decaheme cytochrome c  23.8 
 
 		 770 aa  64.7  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.546873  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3466  hypothetical protein  23.35 
 
 		 785 aa  64.7  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.724503 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0875  hypothetical protein  25.73 
 
 		 893 aa  63.9  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0421546 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2613  decaheme cytochrome c  22.76 
 
 		 762 aa  62.8  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000355284  hitchhiker  0.00000740819 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2680  decaheme cytochrome c  22.93 
 
 		 762 aa  63.2  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.463028  unclonable  0.0000643351 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1473  decaheme cytochrome c  22.05 
 
 		 761 aa  62.4  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000262006  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1421  hypothetical protein  22.77 
 
 		 657 aa  61.6  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.515821 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3371  hypothetical protein  25.38 
 
 		 895 aa  61.2  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.94917  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1478  decaheme cytochrome c  21.88 
 
 		 761 aa  59.3  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.174618  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2874  decaheme cytochrome c  21.88 
 
 		 764 aa  59.3  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0594793  hitchhiker  0.00000891097 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4517  hypothetical protein  28 
 
 		 642 aa  59.3  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.247929 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1509  decaheme cytochrome c  21.71 
 
 		 764 aa  58.5  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.130709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4048  hypothetical protein  21.35 
 
 		 764 aa  57.8  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3263  hypothetical protein  27.81 
 
 		 655 aa  57.4  0.0000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0963  hypothetical protein  30.11 
 
 		 816 aa  56.2  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.830117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4080  hypothetical protein  23.35 
 
 		 936 aa  53.9  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000183317  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1713  hypothetical protein  22.63 
 
 		 945 aa  53.1  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.436521  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2228  decaheme cytochrome c  21.8 
 
 		 755 aa  52.8  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.236086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2990  hypothetical protein  25.95 
 
 		 680 aa  52.8  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2580  hypothetical protein  23.06 
 
 		 677 aa  50.4  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0447  hypothetical protein  22.06 
 
 		 612 aa  50.4  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.476837 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2507  hypothetical protein  26.34 
 
 		 700 aa  49.3  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116766  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1356  hypothetical protein  36.26 
 
 		 696 aa  45.4  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0734371 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>