15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3140.2 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3140.2  hypothetical protein  100 
 
 		 310 aa  640    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2507  hypothetical protein  84.19 
 
 		 700 aa  534  1e-151  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116766  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1356  hypothetical protein  77.81 
 
 		 696 aa  513  1e-144  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0734371 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1409  hypothetical protein  77.24 
 
 		 696 aa  511  1e-144  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2843  hypothetical protein  76.92 
 
 		 701 aa  498  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2862  hypothetical protein  76.92 
 
 		 698 aa  498  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2991  hypothetical protein  79.53 
 
 		 701 aa  497  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1515  hypothetical protein  76.6 
 
 		 701 aa  495  1e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2990  hypothetical protein  54.61 
 
 		 680 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2580  hypothetical protein  51.19 
 
 		 677 aa  297  1e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1421  hypothetical protein  49.68 
 
 		 657 aa  296  4e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.515821 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4517  hypothetical protein  42.12 
 
 		 642 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.247929 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3263  hypothetical protein  41.08 
 
 		 655 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0450  hypothetical protein  37.62 
 
 		 687 aa  181  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0447  hypothetical protein  34.65 
 
 		 612 aa  170  3e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.476837 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>