16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3140.3 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3140.3  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  257  5.0000000000000005e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2507  hypothetical protein  64.75 
 
 		 700 aa  164  5e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116766  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1409  hypothetical protein  81.93 
 
 		 696 aa  157  5e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1356  hypothetical protein  80.72 
 
 		 696 aa  156  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0734371 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2843  hypothetical protein  83.13 
 
 		 701 aa  155  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2862  hypothetical protein  83.13 
 
 		 698 aa  155  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1515  hypothetical protein  83.13 
 
 		 701 aa  155  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2991  hypothetical protein  83.13 
 
 		 701 aa  155  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1421  hypothetical protein  58.67 
 
 		 657 aa  102  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.515821 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2990  hypothetical protein  55.7 
 
 		 680 aa  99  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4517  hypothetical protein  55.41 
 
 		 642 aa  99.4  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.247929 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2580  hypothetical protein  59.15 
 
 		 677 aa  96.7  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3263  hypothetical protein  52.11 
 
 		 655 aa  94.4  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0447  hypothetical protein  53.03 
 
 		 612 aa  91.3  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.476837 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0450  hypothetical protein  35.19 
 
 		 687 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2694  decaheme cytochrome c MtrF  37.5 
 
 		 640 aa  43.9  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>