28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_p0193 on replicon NC_009475
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009475  BBta_p0193  hypothetical protein  100 
 
 		 258 aa  539  9.999999999999999e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1087  hypothetical protein  57.75 
 
 		 258 aa  328  4e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0091  cytochrome C family protein  55.25 
 
 		 256 aa  299  3e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.22622 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0201  hypothetical protein  42.21 
 
 		 258 aa  219  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2339  hypothetical protein  40.66 
 
 		 272 aa  209  3e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6896  hypothetical protein  44.03 
 
 		 265 aa  205  6e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00342  putative exported protein of unknown function with cytochrome Cfamily domain  41.95 
 
 		 263 aa  196  3e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2336  hypothetical protein  40.77 
 
 		 238 aa  194  8.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6650  hypothetical protein  42.62 
 
 		 266 aa  187  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.237631  normal  0.336128 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2466  hypothetical protein  44.24 
 
 		 237 aa  182  7e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.437406 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0212  hypothetical protein  62.11 
 
 		 159 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.354041 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0451  hypothetical protein  26.72 
 
 		 621 aa  70.5  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.235672 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1146  hypothetical protein  26.79 
 
 		 426 aa  69.3  0.00000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00972968  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1541  cytochrome c family protein  25.11 
 
 		 656 aa  63.5  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0115719 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0992  hypothetical protein  26.27 
 
 		 294 aa  63.5  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2189  cytochrome c family protein  27.05 
 
 		 600 aa  62  0.000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1440  hypothetical protein  25.19 
 
 		 413 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00370181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0993  hypothetical protein  26.67 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000916347  decreased coverage  0.0000889659 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1297  hypothetical protein  26.24 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.581727  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2645  hypothetical protein  28.76 
 
 		 867 aa  56.2  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.519217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1136  hypothetical protein  24.73 
 
 		 288 aa  55.8  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0499  hypothetical protein  25.79 
 
 		 245 aa  52.4  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.687971  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2851  hypothetical protein  30.15 
 
 		 618 aa  52  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.581823  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0345  hypothetical protein  27.9 
 
 		 644 aa  52  0.000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2757  hypothetical protein  29.59 
 
 		 621 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2666  hypothetical protein  29.65 
 
 		 620 aa  50.4  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5161  hypothetical protein  24.76 
 
 		 794 aa  50.1  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1836  cytochrome C family protein  25.42 
 
 		 658 aa  42.7  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>