34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2336 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2336  hypothetical protein  100 
 
 
238 aa  496  1e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2466  hypothetical protein  63.03 
 
 
237 aa  308  2.9999999999999997e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.437406 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1087  hypothetical protein  41.26 
 
 
258 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0193  hypothetical protein  40.77 
 
 
258 aa  194  7e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00342  putative exported protein of unknown function with cytochrome Cfamily domain  39.31 
 
 
263 aa  184  9e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0201  hypothetical protein  40.07 
 
 
258 aa  180  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6896  hypothetical protein  40.52 
 
 
265 aa  177  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6650  hypothetical protein  40.62 
 
 
266 aa  177  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.237631  normal  0.336128 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2339  hypothetical protein  35.93 
 
 
272 aa  168  7e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0091  cytochrome C family protein  36.15 
 
 
256 aa  151  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.22622 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0212  hypothetical protein  48.89 
 
 
159 aa  92.8  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.354041 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2189  cytochrome c family protein  27.76 
 
 
600 aa  79  0.00000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0993  hypothetical protein  26.61 
 
 
291 aa  77.4  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000916347  decreased coverage  0.0000889659 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0992  hypothetical protein  25.51 
 
 
294 aa  74.3  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1146  hypothetical protein  26.32 
 
 
426 aa  74.3  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00972968  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1440  hypothetical protein  26.41 
 
 
413 aa  72.8  0.000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00370181  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1297  hypothetical protein  24.65 
 
 
279 aa  68.6  0.00000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.581727  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1541  cytochrome c family protein  25.63 
 
 
656 aa  67.4  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0115719 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0451  hypothetical protein  26.34 
 
 
621 aa  67  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.235672 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0499  hypothetical protein  28.77 
 
 
245 aa  66.6  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.687971  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1136  hypothetical protein  26.96 
 
 
288 aa  66.2  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5161  hypothetical protein  29.33 
 
 
794 aa  56.2  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0472  cytochrome c family protein  25.11 
 
 
664 aa  55.5  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.482092  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2757  hypothetical protein  30.64 
 
 
621 aa  52.8  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2851  hypothetical protein  30.64 
 
 
618 aa  52.4  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.581823  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2666  hypothetical protein  30.64 
 
 
620 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1542  cytochrome C family protein  28.12 
 
 
655 aa  45.8  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0724057 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2645  hypothetical protein  25.56 
 
 
867 aa  45.8  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.519217  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3163  cytochrome C family protein  26.52 
 
 
442 aa  43.5  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1625  hypothetical protein  28.24 
 
 
386 aa  42.7  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.451604 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3261  cytochrome C family protein  28.4 
 
 
656 aa  42  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3166  cytochrome C family protein  28.4 
 
 
650 aa  42  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3165  cytochrome C family protein  26.24 
 
 
436 aa  42  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3260  cytochrome C family protein  26.24 
 
 
436 aa  42  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>