37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1136 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1136  hypothetical protein  100 
 
 		 288 aa  595  1e-169  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0499  hypothetical protein  51.04 
 
 		 245 aa  300  2e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.687971  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1297  hypothetical protein  45.28 
 
 		 279 aa  237  1e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.581727  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0992  hypothetical protein  40.42 
 
 		 294 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0993  hypothetical protein  40.75 
 
 		 291 aa  225  6e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000916347  decreased coverage  0.0000889659 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1146  hypothetical protein  36.73 
 
 		 426 aa  192  6e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00972968  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1440  hypothetical protein  34.3 
 
 		 413 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00370181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1541  cytochrome c family protein  29.54 
 
 		 656 aa  79  0.00000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0115719 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0471  hypothetical protein  27.21 
 
 		 790 aa  68.2  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0674457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2336  hypothetical protein  26.96 
 
 		 238 aa  66.2  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6650  hypothetical protein  25.69 
 
 		 266 aa  65.1  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.237631  normal  0.336128 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00342  putative exported protein of unknown function with cytochrome Cfamily domain  30.77 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2189  cytochrome c family protein  26.23 
 
 		 600 aa  62.8  0.000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6896  hypothetical protein  25.48 
 
 		 265 aa  62  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2466  hypothetical protein  27.78 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.437406 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2339  hypothetical protein  25.61 
 
 		 272 aa  59.3  0.00000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0193  hypothetical protein  24.73 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0091  cytochrome C family protein  25.67 
 
 		 256 aa  53.1  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.22622 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1837  cytochrome C family protein  28.25 
 
 		 429 aa  53.1  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1087  hypothetical protein  29.1 
 
 		 258 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0472  cytochrome c family protein  26.15 
 
 		 664 aa  50.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.482092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0201  hypothetical protein  24.89 
 
 		 258 aa  49.7  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1542  cytochrome C family protein  22.82 
 
 		 655 aa  49.7  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0724057 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0451  hypothetical protein  22.94 
 
 		 621 aa  49.3  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.235672 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2645  hypothetical protein  25.16 
 
 		 867 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.519217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2757  hypothetical protein  26.46 
 
 		 621 aa  46.2  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0450  cytochrome c family protein  26.33 
 
 		 312 aa  46.2  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3067  cytochrome c family protein  25.74 
 
 		 436 aa  46.2  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1996  cytochrome C family protein  28.57 
 
 		 427 aa  44.3  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0405741  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2427  multihaem cytochrome  24.75 
 
 		 280 aa  44.3  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000206964  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2851  hypothetical protein  25.34 
 
 		 618 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.581823  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5161  hypothetical protein  23.85 
 
 		 794 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2666  hypothetical protein  25.33 
 
 		 620 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1836  cytochrome C family protein  27.63 
 
 		 658 aa  42.7  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1125  cytochrome C family protein  29.22 
 
 		 426 aa  42.7  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.4798  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3840  cytochrome C family protein  26.27 
 
 		 331 aa  42.4  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000859924  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0600  PKD  26.17 
 
 		 712 aa  42.4  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000134554  normal  0.252595 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>