32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0450 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0450  cytochrome c family protein  100 
 
 		 312 aa  628  1e-179  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2850  cytochrome c family protein  34.88 
 
 		 309 aa  123  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.448853  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2665  cytochrome c family protein  34.88 
 
 		 299 aa  122  9e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0517248  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2756  cytochrome c family protein  34.88 
 
 		 309 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0471  hypothetical protein  35.32 
 
 		 790 aa  119  9e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0674457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2645  hypothetical protein  36.65 
 
 		 867 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.519217  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2189  cytochrome c family protein  35.55 
 
 		 600 aa  113  5e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1541  cytochrome c family protein  30.38 
 
 		 656 aa  99  9e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0115719 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5161  hypothetical protein  30.87 
 
 		 794 aa  92  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0472  cytochrome c family protein  28.83 
 
 		 664 aa  92  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.482092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2666  hypothetical protein  28.12 
 
 		 620 aa  79.7  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2851  hypothetical protein  27.89 
 
 		 618 aa  79.3  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.581823  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1146  hypothetical protein  23.78 
 
 		 426 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00972968  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0451  hypothetical protein  26.54 
 
 		 621 aa  74.7  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.235672 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2757  hypothetical protein  26.19 
 
 		 621 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1440  hypothetical protein  26.67 
 
 		 413 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00370181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1542  cytochrome C family protein  27.3 
 
 		 655 aa  67.4  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0724057 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0992  hypothetical protein  25.38 
 
 		 294 aa  67  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1297  hypothetical protein  26.85 
 
 		 279 aa  63.2  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.581727  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0993  hypothetical protein  24.14 
 
 		 291 aa  50.8  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000916347  decreased coverage  0.0000889659 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0454  hypothetical protein  30.26 
 
 		 182 aa  50.1  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.534035 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0499  hypothetical protein  26.19 
 
 		 245 aa  49.3  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.687971  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2664  hypothetical protein  40.91 
 
 		 262 aa  49.3  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0452808  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2644  hypothetical protein  31.72 
 
 		 264 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1136  hypothetical protein  26.33 
 
 		 288 aa  47  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1315  hypothetical protein  22.58 
 
 		 335 aa  45.4  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000524828  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1789  multiheme cytochrome  22.69 
 
 		 280 aa  44.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0570598 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0747  multiheme cytochrome  24.65 
 
 		 487 aa  43.9  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.568299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3166  cytochrome C family protein  24.83 
 
 		 650 aa  43.5  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0845  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like protein  24.02 
 
 		 757 aa  43.1  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.763615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2427  multihaem cytochrome  23.11 
 
 		 280 aa  43.1  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000206964  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2839  cytochrome c family protein  25.1 
 
 		 289 aa  42.7  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000361793  decreased coverage  9.49573e-22 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>