47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5161 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5161  hypothetical protein  100 
 
 		 794 aa  1634    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2645  hypothetical protein  32.2 
 
 		 867 aa  291  3e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.519217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0471  hypothetical protein  30.7 
 
 		 790 aa  258  2e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0674457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1541  cytochrome c family protein  33.01 
 
 		 656 aa  258  4e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0115719 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2189  cytochrome c family protein  34.16 
 
 		 600 aa  253  8.000000000000001e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0451  hypothetical protein  31.65 
 
 		 621 aa  223  9.999999999999999e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.235672 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0472  cytochrome c family protein  30.17 
 
 		 664 aa  204  4e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.482092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2757  hypothetical protein  31.2 
 
 		 621 aa  201  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2851  hypothetical protein  31.1 
 
 		 618 aa  200  7e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.581823  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2666  hypothetical protein  31.69 
 
 		 620 aa  194  5e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1146  hypothetical protein  25.76 
 
 		 426 aa  95.9  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00972968  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0450  cytochrome c family protein  30.87 
 
 		 312 aa  92.4  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2665  cytochrome c family protein  35.53 
 
 		 299 aa  87.8  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0517248  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2850  cytochrome c family protein  34.21 
 
 		 309 aa  84  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.448853  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2756  cytochrome c family protein  34.21 
 
 		 309 aa  83.2  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1440  hypothetical protein  24.46 
 
 		 413 aa  80.1  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00370181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1542  cytochrome C family protein  24.24 
 
 		 655 aa  67.8  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0724057 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0992  hypothetical protein  26.13 
 
 		 294 aa  67.4  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2887  cytochrome c family protein  22.78 
 
 		 884 aa  66.2  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0141387  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6650  hypothetical protein  27.85 
 
 		 266 aa  65.1  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.237631  normal  0.336128 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2336  hypothetical protein  28.81 
 
 		 238 aa  62  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6896  hypothetical protein  27.54 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0201  hypothetical protein  26.83 
 
 		 258 aa  55.5  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00342  putative exported protein of unknown function with cytochrome Cfamily domain  25.6 
 
 		 263 aa  54.3  0.000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0600  PKD  25 
 
 		 712 aa  54.3  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000134554  normal  0.252595 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1297  hypothetical protein  24.91 
 
 		 279 aa  54.3  0.000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.581727  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1836  cytochrome C family protein  23.85 
 
 		 658 aa  53.5  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0193  hypothetical protein  25.1 
 
 		 258 aa  53.1  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0747  multiheme cytochrome  25 
 
 		 487 aa  52.4  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.568299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2466  hypothetical protein  36.19 
 
 		 237 aa  52  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.437406 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0091  cytochrome C family protein  26.39 
 
 		 256 aa  51.2  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.22622 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1136  hypothetical protein  24.83 
 
 		 288 aa  50.8  0.00009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0993  hypothetical protein  23.47 
 
 		 291 aa  50.1  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000916347  decreased coverage  0.0000889659 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0112  hypothetical protein  23.82 
 
 		 302 aa  48.5  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0873537  normal  0.846145 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2301  cytochrome c family protein  22.97 
 
 		 709 aa  48.1  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2339  hypothetical protein  23.98 
 
 		 272 aa  47.8  0.0008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0499  hypothetical protein  23.71 
 
 		 245 aa  47  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.687971  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2210  cytochrome c family protein  21.3 
 
 		 711 aa  47.4  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0598  PKD  21.91 
 
 		 806 aa  47  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00146483  normal  0.752324 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6281  hypothetical protein  24.24 
 
 		 610 aa  46.6  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3859  cytochrome C family protein  24.92 
 
 		 287 aa  46.6  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00158078  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3135  hypothetical protein  23.62 
 
 		 717 aa  45.8  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1315  hypothetical protein  25.41 
 
 		 335 aa  45.4  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000524828  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2888  hypothetical protein  22.19 
 
 		 1294 aa  45.1  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3261  cytochrome C family protein  25.42 
 
 		 656 aa  44.3  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2755  hypothetical protein  23.62 
 
 		 262 aa  44.3  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.554867  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0125  hypothetical protein  24.08 
 
 		 618 aa  44.3  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000548778  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>