85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6281 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6281  hypothetical protein  100 
 
 		 610 aa  1167    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1146  hypothetical protein  24.76 
 
 		 426 aa  73.6  0.000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00972968  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3068  cytochrome c family protein  25.28 
 
 		 650 aa  73.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1124  cytochrome C family protein  24.4 
 
 		 658 aa  70.5  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932844  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2495  cytochrome c family protein  23.03 
 
 		 646 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1836  cytochrome C family protein  26.9 
 
 		 658 aa  68.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0472  cytochrome c family protein  25.7 
 
 		 664 aa  68.9  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.482092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0112  hypothetical protein  35.29 
 
 		 302 aa  68.2  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0873537  normal  0.846145 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1541  cytochrome c family protein  24.13 
 
 		 656 aa  66.6  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0115719 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0115  hypothetical protein  31.94 
 
 		 309 aa  66.6  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1995  cytochrome C family protein  22.47 
 
 		 658 aa  65.1  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.279857  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0108  hypothetical protein  33.57 
 
 		 309 aa  63.9  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0126  hypothetical protein  31.41 
 
 		 309 aa  63.2  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0471  hypothetical protein  24.6 
 
 		 790 aa  62.8  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0674457  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2189  cytochrome c family protein  25.06 
 
 		 600 aa  62.4  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0352  cytochrome c family protein  30.77 
 
 		 317 aa  61.6  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.101331 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3130  cytochrome C family protein  31.41 
 
 		 317 aa  60.8  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.849943  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2149  cytochrome c family protein  30.97 
 
 		 304 aa  60.5  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0950345  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3067  cytochrome c family protein  27.14 
 
 		 436 aa  60.1  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3166  cytochrome C family protein  26.76 
 
 		 650 aa  59.7  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0845  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like protein  26.17 
 
 		 757 aa  59.3  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.763615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3261  cytochrome C family protein  26.76 
 
 		 656 aa  58.9  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1125  cytochrome C family protein  22.88 
 
 		 426 aa  57.4  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.4798  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2699  cytochrome C family protein  27.67 
 
 		 328 aa  57.4  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.840713  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3260  cytochrome C family protein  25.19 
 
 		 436 aa  57.4  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3165  cytochrome C family protein  25.19 
 
 		 436 aa  57.4  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2820  cytochrome C family protein  24.56 
 
 		 312 aa  57.4  0.0000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2526  cytochrome C family protein  28.29 
 
 		 329 aa  57  0.0000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0227  cytochrome c family protein  26.59 
 
 		 316 aa  57  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1477  cytochrome C family protein  30.3 
 
 		 334 aa  56.6  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000779097  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5161  hypothetical protein  23.04 
 
 		 794 aa  55.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2839  cytochrome c family protein  27.13 
 
 		 289 aa  55.5  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000361793  decreased coverage  9.49573e-22 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1996  cytochrome C family protein  23.37 
 
 		 427 aa  55.1  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0405741  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3675  cytochrome C family protein  24.53 
 
 		 315 aa  53.1  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1440  hypothetical protein  25.67 
 
 		 413 aa  52.8  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00370181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3126  cytochrome C family protein  24.54 
 
 		 333 aa  52.4  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00631921  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0600  PKD  25 
 
 		 712 aa  51.6  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000134554  normal  0.252595 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0361  decaheme cytochrome c MtrA  35.85 
 
 		 286 aa  50.8  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162857  hitchhiker  0.000223849 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0913  hypothetical protein  28.15 
 
 		 490 aa  50.4  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.689727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2759  cytochrome C family protein  24.93 
 
 		 449 aa  50.4  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0670  cytochrome c family protein  29.67 
 
 		 284 aa  49.3  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000144987  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2291  cytochrome C family protein  30.71 
 
 		 335 aa  49.3  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3859  cytochrome C family protein  35.85 
 
 		 287 aa  48.5  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00158078  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2427  multihaem cytochrome  29.03 
 
 		 280 aa  48.9  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000206964  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1789  multiheme cytochrome  28.37 
 
 		 280 aa  48.9  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0570598 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1207  decaheme cytochrome c MtrA  31.43 
 
 		 326 aa  48.5  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0298799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2713  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like  24.71 
 
 		 658 aa  47.8  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.151641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2583  cytochrome C family protein  24.79 
 
 		 259 aa  47.8  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1524  cytochrome c family protein  31.03 
 
 		 333 aa  47.8  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.462693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2899  cytochrome c family protein  25.64 
 
 		 374 aa  47.4  0.0009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167025  normal  0.604733 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2766  cytochrome C family protein  31.82 
 
 		 333 aa  47  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0218266  hitchhiker  0.000000422231 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0568  cytochrome c class III  25.36 
 
 		 514 aa  46.6  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1611  cytochrome C family protein  31.82 
 
 		 333 aa  47  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.173927  normal  0.248798 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1588  cytochrome C family protein  31.82 
 
 		 333 aa  47  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00373932  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1577  cytochrome C family protein  31.82 
 
 		 333 aa  47  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000354628  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1837  cytochrome C family protein  23.95 
 
 		 429 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2381  cytochrome C family protein  26.37 
 
 		 315 aa  47  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.300688  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0397  cytochrome C family protein  23.9 
 
 		 299 aa  46.2  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.265526 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2203  cytochrome c family protein  27.27 
 
 		 363 aa  45.8  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1228  cytochrome c family protein  28.22 
 
 		 337 aa  46.2  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0933631  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1777  decaheme cytochrome c MtrA  31.43 
 
 		 333 aa  45.8  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2295  hypothetical protein  25.56 
 
 		 500 aa  46.2  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0584  hypothetical protein  25.19 
 
 		 285 aa  45.8  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0108517  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2677  cytochrome C family protein  31.43 
 
 		 329 aa  45.8  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.376662  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2887  cytochrome c family protein  26.62 
 
 		 884 aa  45.8  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0141387  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2645  hypothetical protein  25.45 
 
 		 867 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.519217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1744  cytochrome c family protein  26.88 
 
 		 337 aa  45.4  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740978 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3828  multiheme cytochrome  28.31 
 
 		 307 aa  45.8  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.326628 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2579  cytochrome C family protein  31.43 
 
 		 329 aa  45.1  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.069167  normal  0.0206665 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2511  cytochrome C family protein  31.43 
 
 		 329 aa  45.1  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.115309  hitchhiker  0.00672893 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1402  cytochrome c family protein  24.39 
 
 		 316 aa  44.7  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2250  cytochrome c class III  24.08 
 
 		 538 aa  45.1  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000197158  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2692  cytochrome C family protein  25.54 
 
 		 319 aa  45.1  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2638  cytochrome C family protein  26.18 
 
 		 329 aa  44.7  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.838087  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1427  decaheme cytochrome c  26.47 
 
 		 318 aa  44.7  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0451  hypothetical protein  23.82 
 
 		 621 aa  44.3  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.235672 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0125  hypothetical protein  26.48 
 
 		 618 aa  44.7  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1305  cytochrome c family protein  24.42 
 
 		 310 aa  44.3  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000952698 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0274  cytochrome c family protein  26.42 
 
 		 619 aa  44.3  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00552346  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0992  hypothetical protein  22.78 
 
 		 294 aa  43.9  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3390  hypothetical protein  21.91 
 
 		 179 aa  43.9  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3564  cytochrome C family protein  23.08 
 
 		 955 aa  43.9  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0993  hypothetical protein  27.56 
 
 		 291 aa  43.9  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000916347  decreased coverage  0.0000889659 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0268  cytochrome C family protein  28.57 
 
 		 314 aa  43.9  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3135  hypothetical protein  22.61 
 
 		 717 aa  43.5  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>