71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1153 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3564  cytochrome C family protein  84.13 
 
 		 955 aa  1645    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3543  cytochrome C family protein  89.98 
 
 		 957 aa  1735    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3470  cytochrome C family protein  99.16 
 
 		 958 aa  1920    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1153  cytochrome C family protein  100 
 
 		 958 aa  1936    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1152  cytochrome C family protein  43.97 
 
 		 1009 aa  456  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3057  cytochrome C family protein  37.92 
 
 		 1017 aa  411  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1198  cytochrome C family protein  37.23 
 
 		 1143 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3052  cytochrome C family protein  36.59 
 
 		 1143 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1193  cytochrome C family protein  36.38 
 
 		 1018 aa  405  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3563  cytochrome C family protein  35.04 
 
 		 1276 aa  389  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0497  cytochrome C family protein  37.57 
 
 		 1053 aa  338  2.9999999999999997e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3428  cytochrome C family protein  33.48 
 
 		 1017 aa  329  2.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.624718  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2883  cytochrome c family protein  34.33 
 
 		 902 aa  324  4e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2884  cytochrome c family protein  35.79 
 
 		 1038 aa  317  7e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2912  cytochrome c family protein  33.04 
 
 		 1046 aa  310  5.9999999999999995e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.802585  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0558  cytochrome c family protein  34.44 
 
 		 1036 aa  288  4e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3544  cytochrome C family protein  41.71 
 
 		 1106 aa  284  6.000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3427  cytochrome C family protein  29.95 
 
 		 1457 aa  282  2e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.476422  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2888  hypothetical protein  42.31 
 
 		 1294 aa  271  5.9999999999999995e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3426  cytochrome C family protein  38.7 
 
 		 901 aa  254  8.000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.360069  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2882  cytochrome c family protein  36.54 
 
 		 688 aa  238  3e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3542  cytochrome C family protein  30.58 
 
 		 1453 aa  237  8e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1154  cytochrome C family protein  29.46 
 
 		 1454 aa  232  3e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0075  cytochrome C family protein  37.05 
 
 		 2222 aa  229  1e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2035  cytochrome C family protein  27.92 
 
 		 1596 aa  223  9e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0702  cytochrome c family protein  28.88 
 
 		 1916 aa  211  4e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2470  high-molecular-weight cytochrome c  33.74 
 
 		 1521 aa  212  4e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3724  cytochrome C family protein  27.66 
 
 		 1691 aa  200  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0573  cytochrome C family protein  28.92 
 
 		 1672 aa  194  4e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2869  cytochrome C family protein  32.9 
 
 		 1196 aa  187  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00106509  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2899  high-molecular-weight cytochrome c  31.52 
 
 		 979 aa  186  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0575  cytochrome c family protein  32.36 
 
 		 1127 aa  184  5.0000000000000004e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0076  cytochrome C family protein  31.78 
 
 		 1438 aa  180  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0498  cytochrome C family protein  27.79 
 
 		 1281 aa  169  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.618718  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0499  cytochrome C family protein  29.64 
 
 		 1379 aa  168  4e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00294186  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0580  high-molecular-weight cytochrome c  28.95 
 
 		 869 aa  147  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0398  cytochrome C family protein  28.93 
 
 		 672 aa  112  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1834  cytochrome C family protein  29.64 
 
 		 1611 aa  109  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0120  cytochrome C family protein  30.43 
 
 		 2026 aa  105  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.345457  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0077  cytochrome C family protein  26.77 
 
 		 2499 aa  93.6  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0571  cytochrome c family protein  24.35 
 
 		 1848 aa  77.8  0.0000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2898  high-molecular-weight cytochrome c  27.82 
 
 		 2803 aa  67.8  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2903  cytochrome C family protein  25.49 
 
 		 455 aa  63.5  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.864697  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2815  cytochrome c like protein  24.73 
 
 		 457 aa  62.4  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3417  cytochrome C family protein  29.47 
 
 		 939 aa  60.1  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000650224  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3541  hypothetical protein  27.74 
 
 		 1538 aa  58.9  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0472  cytochrome c family protein  23.77 
 
 		 664 aa  57.8  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.482092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1826  cytochrome C family protein  25.99 
 
 		 1645 aa  57  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2997  cytochrome C family protein  24.78 
 
 		 455 aa  57.4  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.742851  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0500  cytochrome C family protein  27.64 
 
 		 1496 aa  55.1  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00446809  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1155  hypothetical protein  29.96 
 
 		 1537 aa  53.1  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2998  cytochrome C family protein  25.58 
 
 		 655 aa  52.4  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2904  cytochrome C family protein  26.23 
 
 		 655 aa  50.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3540  hypothetical protein  26.46 
 
 		 1289 aa  50.1  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2763  cytochrome C family protein  26.46 
 
 		 336 aa  50.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.888791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1829  hypothetical protein  25.83 
 
 		 570 aa  50.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1541  cytochrome c family protein  25.19 
 
 		 656 aa  48.9  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0115719 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2210  cytochrome c family protein  23.74 
 
 		 711 aa  49.3  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2816  cytochrome c like protein  24.34 
 
 		 655 aa  48.5  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16928  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1823  cytochrome C family protein  24.08 
 
 		 1525 aa  48.5  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1156  hypothetical protein  31.03 
 
 		 176 aa  47.4  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2762  cytochrome C family protein  24.1 
 
 		 454 aa  47  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1125  cytochrome C family protein  24.69 
 
 		 426 aa  47  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.4798  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1542  cytochrome C family protein  26.99 
 
 		 655 aa  46.6  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0724057 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0471  hypothetical protein  23.51 
 
 		 790 aa  47  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0674457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1857  fibronectin type III domain-containing protein  25.12 
 
 		 733 aa  46.2  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0581  high-molecular-weight cytochrome c  29.05 
 
 		 2912 aa  45.8  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3518  cytochrome C family protein  22.79 
 
 		 331 aa  45.4  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000517887 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1157  hypothetical protein  30.43 
 
 		 642 aa  44.7  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0615  cytochrome c family protein  23.33 
 
 		 362 aa  44.7  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131648  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0598  PKD  24.64 
 
 		 806 aa  44.7  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00146483  normal  0.752324 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>