86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1152 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_1193  cytochrome C family protein  45.95 
 
 
1018 aa  792    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3057  cytochrome C family protein  45.47 
 
 
1017 aa  780    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1152  cytochrome C family protein  100 
 
 
1009 aa  2056    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3428  cytochrome C family protein  38.38 
 
 
1017 aa  531  1e-149  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.624718  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2884  cytochrome c family protein  38.46 
 
 
1038 aa  522  1e-146  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0497  cytochrome C family protein  35.47 
 
 
1053 aa  496  1e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0558  cytochrome c family protein  34.9 
 
 
1036 aa  479  1e-133  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3564  cytochrome C family protein  43.91 
 
 
955 aa  473  1e-132  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2912  cytochrome c family protein  33.96 
 
 
1046 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.802585  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3543  cytochrome C family protein  41.89 
 
 
957 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3470  cytochrome C family protein  43.97 
 
 
958 aa  444  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1153  cytochrome C family protein  43.97 
 
 
958 aa  444  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3052  cytochrome C family protein  47.31 
 
 
1143 aa  396  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1198  cytochrome C family protein  46.92 
 
 
1143 aa  397  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3565  hypothetical protein  48.01 
 
 
1110 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3544  cytochrome C family protein  49.53 
 
 
1106 aa  338  3.9999999999999995e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2888  hypothetical protein  49.15 
 
 
1294 aa  334  4e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1834  cytochrome C family protein  33.03 
 
 
1611 aa  332  1e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2883  cytochrome c family protein  35.78 
 
 
902 aa  331  5.0000000000000004e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3427  cytochrome C family protein  28.7 
 
 
1457 aa  198  5.000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.476422  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0498  cytochrome C family protein  26.92 
 
 
1281 aa  122  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.618718  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0075  cytochrome C family protein  27.8 
 
 
2222 aa  99.4  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3563  cytochrome C family protein  26.67 
 
 
1276 aa  96.7  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0398  cytochrome C family protein  47.15 
 
 
672 aa  88.6  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3417  cytochrome C family protein  34.43 
 
 
939 aa  85.9  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000650224  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0120  cytochrome C family protein  29.15 
 
 
2026 aa  82  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.345457  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0076  cytochrome C family protein  27.96 
 
 
1438 aa  79.3  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0077  cytochrome C family protein  25.78 
 
 
2499 aa  79.3  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3426  cytochrome C family protein  27.51 
 
 
901 aa  76.3  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.360069  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3540  hypothetical protein  40.18 
 
 
1289 aa  73.6  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1154  cytochrome C family protein  30.21 
 
 
1454 aa  70.5  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0575  cytochrome c family protein  30.13 
 
 
1127 aa  70.5  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0571  cytochrome c family protein  26.81 
 
 
1848 aa  68.9  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3174  cytochrome C family protein  25.94 
 
 
1329 aa  68.9  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.246364  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2899  high-molecular-weight cytochrome c  30.45 
 
 
979 aa  68.2  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3268  cytochrome C family protein  25.94 
 
 
1329 aa  67.8  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2882  cytochrome c family protein  27.35 
 
 
688 aa  67  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1823  cytochrome C family protein  28.18 
 
 
1525 aa  65.5  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3542  cytochrome C family protein  29.23 
 
 
1453 aa  65.1  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2035  cytochrome C family protein  26.24 
 
 
1596 aa  62.8  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2869  cytochrome C family protein  26.15 
 
 
1196 aa  61.2  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00106509  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0581  high-molecular-weight cytochrome c  26.04 
 
 
2912 aa  60.5  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3049  cytochrome C family protein  26.69 
 
 
2081 aa  59.7  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0702  cytochrome c family protein  26.48 
 
 
1916 aa  59.3  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1124  cytochrome C family protein  22.01 
 
 
658 aa  58.2  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932844  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0573  cytochrome C family protein  24.68 
 
 
1672 aa  58.2  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0580  high-molecular-weight cytochrome c  24.35 
 
 
869 aa  57  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2904  cytochrome C family protein  22.91 
 
 
655 aa  56.6  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2998  cytochrome C family protein  22.91 
 
 
655 aa  56.2  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0499  cytochrome C family protein  23.86 
 
 
1379 aa  55.5  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00294186  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2495  cytochrome c family protein  24.18 
 
 
646 aa  55.1  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3077  multihaem cytochrome  25.95 
 
 
1330 aa  54.7  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2470  high-molecular-weight cytochrome c  24.35 
 
 
1521 aa  54.7  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1157  hypothetical protein  41.9 
 
 
642 aa  53.5  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3724  cytochrome C family protein  27.72 
 
 
1691 aa  53.1  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3261  cytochrome C family protein  23.77 
 
 
656 aa  52.8  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2898  high-molecular-weight cytochrome c  25.69 
 
 
2803 aa  53.1  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1125  cytochrome C family protein  24.46 
 
 
426 aa  52.8  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.4798  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1826  cytochrome C family protein  24.6 
 
 
1645 aa  52  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1995  cytochrome C family protein  22.82 
 
 
658 aa  51.6  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.279857  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0598  PKD  22.11 
 
 
806 aa  50.8  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00146483  normal  0.752324 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1837  cytochrome C family protein  25.53 
 
 
429 aa  50.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2816  cytochrome c like protein  25.81 
 
 
655 aa  49.3  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16928  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2987  TPR domain-containing protein  23.44 
 
 
778 aa  49.7  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.353968  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3108  cytochrome c family protein  26.55 
 
 
553 aa  48.1  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3166  cytochrome C family protein  23.73 
 
 
650 aa  48.1  0.0009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6276  cytochrome C family protein  24.43 
 
 
501 aa  47.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.943991 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2494  cytochrome c family protein  28 
 
 
434 aa  47.4  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0472  cytochrome c family protein  22.45 
 
 
664 aa  47.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.482092  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3260  cytochrome C family protein  23.74 
 
 
436 aa  46.6  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3068  cytochrome c family protein  24.4 
 
 
650 aa  47  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3165  cytochrome C family protein  23.74 
 
 
436 aa  46.6  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1440  hypothetical protein  21.39 
 
 
413 aa  46.2  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00370181  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1829  hypothetical protein  25.22 
 
 
570 aa  46.2  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1996  cytochrome C family protein  22.97 
 
 
427 aa  46.6  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0405741  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1836  cytochrome C family protein  23.97 
 
 
658 aa  45.8  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0112  hypothetical protein  24.35 
 
 
302 aa  45.8  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0873537  normal  0.846145 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3158  cytochrome C family protein  24.68 
 
 
597 aa  45.8  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1542  cytochrome C family protein  24.07 
 
 
655 aa  45.4  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0724057 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2250  cytochrome c class III  22.22 
 
 
538 aa  45.4  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000197158  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0500  cytochrome C family protein  25.53 
 
 
1496 aa  45.4  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00446809  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1315  hypothetical protein  23.71 
 
 
335 aa  45.1  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000524828  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0015  hypothetical protein  22.37 
 
 
664 aa  44.7  0.008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2724  cytochrome c family protein  25.37 
 
 
704 aa  44.7  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0616  cytochrome c family protein  24.46 
 
 
330 aa  44.7  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.105534  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2997  cytochrome C family protein  25.72 
 
 
455 aa  44.7  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.742851  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>