59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3541 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1155  hypothetical protein  85.56 
 
 		 1537 aa  2600    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3541  hypothetical protein  100 
 
 		 1538 aa  3068    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0576  hypothetical protein  57.81 
 
 		 1284 aa  206  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1320  hypothetical protein  43.68 
 
 		 777 aa  121  9e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000232638  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0500  cytochrome C family protein  46.91 
 
 		 1496 aa  118  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00446809  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3561  Fibronectin type III domain protein  41.09 
 
 		 2178 aa  112  7.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0762  hypothetical protein  38.81 
 
 		 1439 aa  110  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00323253  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0120  cytochrome C family protein  30.75 
 
 		 2026 aa  105  7e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.345457  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3562  filamentous hemeagglutinin outer membrane protein  46.56 
 
 		 577 aa  100  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0292  fibronectin type III domain-containing protein  38.98 
 
 		 916 aa  94  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.525273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0581  high-molecular-weight cytochrome c  25.2 
 
 		 2912 aa  93.2  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  54.55 
 
 		 2192 aa  92.4  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0076  cytochrome C family protein  32.6 
 
 		 1438 aa  90.1  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2898  high-molecular-weight cytochrome c  24.15 
 
 		 2803 aa  85.9  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2157  fibronectin, type III domain-containing protein  34.07 
 
 		 1141 aa  80.5  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.445714  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0077  cytochrome C family protein  28.45 
 
 		 2499 aa  77  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1242  hypothetical protein  37.96 
 
 		 549 aa  77  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.74975e-30 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3268  cytochrome C family protein  30.66 
 
 		 1329 aa  76.3  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3077  multihaem cytochrome  30.66 
 
 		 1330 aa  75.5  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3174  cytochrome C family protein  29.93 
 
 		 1329 aa  73.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.246364  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3417  cytochrome C family protein  26.91 
 
 		 939 aa  73.6  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000650224  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2328  fibronectin, type III domain-containing protein  34.15 
 
 		 675 aa  71.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000140812  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3049  cytochrome C family protein  31.25 
 
 		 2081 aa  70.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1799  Fibronectin type III domain protein  31.09 
 
 		 1096 aa  69.3  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0498  cytochrome C family protein  27.73 
 
 		 1281 aa  68.6  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.618718  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2339  APHP domain protein  29.17 
 
 		 2002 aa  67  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2997  cytochrome C family protein  27.98 
 
 		 455 aa  64.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.742851  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1823  cytochrome C family protein  31.58 
 
 		 1525 aa  63.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2903  cytochrome C family protein  27.68 
 
 		 455 aa  60.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.864697  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2445  fibronectin, type III domain-containing protein  29.33 
 
 		 499 aa  60.5  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.628775  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1154  cytochrome C family protein  34.04 
 
 		 1454 aa  59.7  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2763  cytochrome C family protein  29.08 
 
 		 336 aa  59.3  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.888791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2815  cytochrome c like protein  32.52 
 
 		 457 aa  59.3  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3565  hypothetical protein  24.26 
 
 		 1110 aa  58.5  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3544  cytochrome C family protein  23.96 
 
 		 1106 aa  58.2  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1826  cytochrome C family protein  32.58 
 
 		 1645 aa  58.2  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1153  cytochrome C family protein  26.22 
 
 		 958 aa  57.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2816  cytochrome c like protein  32.33 
 
 		 655 aa  57.4  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16928  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3542  cytochrome C family protein  28.35 
 
 		 1453 aa  57  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3470  cytochrome C family protein  26.22 
 
 		 958 aa  57  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2888  hypothetical protein  24.34 
 
 		 1294 aa  55.5  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2998  cytochrome C family protein  31.03 
 
 		 655 aa  54.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2904  cytochrome C family protein  31.03 
 
 		 655 aa  54.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3543  cytochrome C family protein  31.3 
 
 		 957 aa  53.5  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0558  cytochrome c family protein  29.66 
 
 		 1036 aa  53.1  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2912  cytochrome c family protein  28 
 
 		 1046 aa  53.1  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.802585  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1453  hypothetical protein  37.76 
 
 		 331 aa  52.8  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0075  cytochrome C family protein  27.49 
 
 		 2222 aa  51.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1798  Fibronectin type III domain protein  45.56 
 
 		 827 aa  51.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1834  cytochrome C family protein  29.9 
 
 		 1611 aa  49.3  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2883  cytochrome c family protein  28.12 
 
 		 902 aa  48.9  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2884  cytochrome c family protein  26.91 
 
 		 1038 aa  48.5  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4113  hypothetical protein  39.13 
 
 		 3562 aa  48.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0537133 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2451  Fibronectin type III domain protein  28.96 
 
 		 1219 aa  47.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0702  cytochrome c family protein  25.83 
 
 		 1916 aa  47  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3100  Peptidase M23  35.59 
 
 		 954 aa  46.6  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2762  cytochrome C family protein  30.17 
 
 		 454 aa  46.2  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2750  YD repeat protein  31.97 
 
 		 2447 aa  45.4  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4253  fibronectin type III domain-containing protein  27.11 
 
 		 680 aa  45.1  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>