185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0754 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  100 
 
 		 2192 aa  4237    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  69.54 
 
 		 2042 aa  778    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  62.83 
 
 		 2503 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  68.09 
 
 		 2476 aa  491  1e-137  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  58.75 
 
 		 2522 aa  485  1e-135  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  67.56 
 
 		 3699 aa  487  1e-135  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  66.89 
 
 		 3699 aa  483  1e-134  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  66.67 
 
 		 3544 aa  478  1e-133  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0223  fibronectin, type III  58.09 
 
 		 1911 aa  298  6e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  39.19 
 
 		 852 aa  258  7e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0767  hypothetical protein  37.4 
 
 		 1804 aa  244  2e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  52.09 
 
 		 3089 aa  231  1e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1371  hypothetical protein  33.44 
 
 		 1588 aa  228  7e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5260  hypothetical protein  51.96 
 
 		 1879 aa  227  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2912  hypothetical protein  34.64 
 
 		 1585 aa  225  7e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000198492 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1035  hypothetical protein  44.03 
 
 		 1010 aa  221  2e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0292  fibronectin type III domain-containing protein  46.18 
 
 		 916 aa  203  3e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.525273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1790  polymorphic membrane protein  38.12 
 
 		 799 aa  201  1.0000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4251  Ig family protein  46.46 
 
 		 2802 aa  197  2e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676511 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1320  hypothetical protein  43.35 
 
 		 777 aa  197  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000232638  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1875  polymorphic membrane protein  34.9 
 
 		 507 aa  187  2.0000000000000003e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  49.78 
 
 		 3227 aa  187  3e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1161  hypothetical protein  36.49 
 
 		 1902 aa  180  3e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125794  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1335  endoglucanase-like protein  46.51 
 
 		 2042 aa  180  4e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0110821 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0070  APHP domain-containing protein  40.67 
 
 		 1951 aa  170  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1242  hypothetical protein  38.95 
 
 		 549 aa  167  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.74975e-30 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0327  conserved repeat domain protein  34.22 
 
 		 743 aa  165  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3989  hypothetical protein  37.98 
 
 		 2528 aa  162  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1787  polymorphic outer membrane protein  34.23 
 
 		 1332 aa  158  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2515  hypothetical protein  42.16 
 
 		 441 aa  135  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  30.09 
 
 		 1296 aa  134  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0723  hypothetical protein  33.74 
 
 		 1318 aa  131  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.661776 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0619  Polymorphic membrane protein  32.68 
 
 		 1216 aa  131  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.418961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3801  Ig family protein  32.72 
 
 		 1170 aa  124  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000269985  normal  0.432666 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0005  polymorphic outer membrane protein  31.76 
 
 		 775 aa  118  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000710623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  36.89 
 
 		 3477 aa  106  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1920  hypothetical protein  34.21 
 
 		 417 aa  106  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.409778 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2841  polymorphic outer membrane protein  31.29 
 
 		 759 aa  105  7e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2319  hypothetical protein  36.61 
 
 		 1106 aa  105  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.300784  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0821  hypothetical protein  33.58 
 
 		 1055 aa  104  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.661621  normal  0.324111 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1073  fibronectin type III domain-containing protein  30.26 
 
 		 9585 aa  103  3e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0675  Pyrrolo-quinoline quinone  36.7 
 
 		 3066 aa  103  5e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895028 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2914  NHL repeat-containing protein  30.69 
 
 		 898 aa  101  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0718376  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1704  polymorphic outer membrane protein  37.22 
 
 		 1755 aa  101  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.041755  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2434  cell wall/surface repeat protein  45.14 
 
 		 2207 aa  100  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0726  hypothetical protein  35.51 
 
 		 1263 aa  99  8e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.434756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0427  Fibronectin type III domain protein  29.75 
 
 		 2039 aa  99.4  8e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21610  fibronectin type III domain-containing protein  34.37 
 
 		 2084 aa  99  9e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1640  polymorphic outer membrane protein  31.58 
 
 		 767 aa  97.8  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1155  hypothetical protein  50.83 
 
 		 1537 aa  96.7  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1921  hypothetical protein  31.48 
 
 		 350 aa  95.9  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.884061  normal  0.370126 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2393  polymorphic outer membrane protein  30.72 
 
 		 659 aa  95.9  8e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4990  Ig domain-containing protein  34.9 
 
 		 1532 aa  94.4  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3430  hypothetical protein  28.65 
 
 		 913 aa  93.2  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.836468  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2043  parallel beta-helix repeat-containing protein  32.9 
 
 		 2031 aa  92.8  7e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05620  fibronectin type III domain-containing protein  35.59 
 
 		 2052 aa  92.8  7e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.691963  normal  0.30022 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3541  hypothetical protein  54.55 
 
 		 1538 aa  92.4  9e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0496  Immunoglobulin I-set domain protein  35.71 
 
 		 1550 aa  92  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179971  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1788  polymorphic membrane protein  38.34 
 
 		 1092 aa  91.3  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0459  Fibronectin type III domain protein  33.12 
 
 		 2043 aa  89.7  5e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01455  cell wall associated biofilm protein  43.1 
 
 		 3089 aa  89.4  7e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2246  hypothetical protein  33.56 
 
 		 591 aa  89  9e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.105015  normal  0.0180285 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0496  NHL repeat-containing protein  29.18 
 
 		 937 aa  88.2  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3561  Fibronectin type III domain protein  42.86 
 
 		 2178 aa  88.2  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1937  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  44.26 
 
 		 2884 aa  87.8  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0033  hypothetical protein  32.41 
 
 		 591 aa  86.7  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1952  hypothetical protein  40.72 
 
 		 1538 aa  86.3  0.000000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0131034  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0500  cytochrome C family protein  38.42 
 
 		 1496 aa  84.3  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00446809  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3086  polymorphic outer membrane protein  29.3 
 
 		 665 aa  84.3  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3562  filamentous hemeagglutinin outer membrane protein  50.52 
 
 		 577 aa  84  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1759  Fibronectin type III domain protein  30.72 
 
 		 2067 aa  84  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.77836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1287  fibronectin, type III domain-containing protein  30.61 
 
 		 2011 aa  83.2  0.00000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.111865  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  47.37 
 
 		 1848 aa  82.8  0.00000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2885  NHL repeat-containing protein  26.74 
 
 		 888 aa  82.8  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0556  NHL repeat-containing protein  29.36 
 
 		 899 aa  81.6  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1583  cytochrome c, class I  52.53 
 
 		 475 aa  82  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000740916  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2198  Fibronectin type III domain protein  30.26 
 
 		 2047 aa  81.3  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0185742 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  28.57 
 
 		 1628 aa  81.6  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0762  hypothetical protein  45.83 
 
 		 1439 aa  80.9  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00323253  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2157  fibronectin, type III domain-containing protein  46.94 
 
 		 1141 aa  77.8  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.445714  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1330  Fibronectin type III domain protein  27.38 
 
 		 2056 aa  76.6  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000696723 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2339  APHP domain protein  45.98 
 
 		 2002 aa  75.1  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2452  Fibronectin type III domain protein  30.45 
 
 		 696 aa  74.3  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1286  fibronectin, type III domain-containing protein  37.82 
 
 		 2051 aa  73.9  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1331  Fibronectin type III domain protein  28.36 
 
 		 2040 aa  73.9  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211706 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2405  hypothetical protein  29.9 
 
 		 601 aa  73.2  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000140285  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3634  polymorphic outer membrane protein  34.95 
 
 		 655 aa  72.4  0.00000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1836  NHL repeat-containing protein  31.37 
 
 		 906 aa  71.6  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3282  hypothetical protein  41.18 
 
 		 149 aa  70.1  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.290972  hitchhiker  0.000227158 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3174  dystroglycan-type cadherin domain-containing protein  34.43 
 
 		 2715 aa  70.1  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2726  polymorphic outer membrane protein  28.76 
 
 		 593 aa  69.7  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0479266  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2874  polymorphic outer membrane protein  33.68 
 
 		 412 aa  69.7  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.234984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2314  polymorphic outer membrane protein  31.25 
 
 		 541 aa  69.3  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1243  heme peroxidase  44.72 
 
 		 1625 aa  68.6  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.941188  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2156  polymorphic outer membrane protein  37.5 
 
 		 526 aa  68.6  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.927153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2988  polymorphic outer membrane protein  33.06 
 
 		 575 aa  67  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0583035  hitchhiker  0.000382857 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1799  Fibronectin type III domain protein  39.83 
 
 		 1096 aa  66.6  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2283  polymorphic outer membrane protein  32.06 
 
 		 575 aa  66.6  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4818  Fibronectin type III domain protein  31.5 
 
 		 2069 aa  65.9  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2348  hypothetical protein  60.32 
 
 		 545 aa  65.9  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>