28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1875 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1875  polymorphic membrane protein  100 
 
 		 507 aa  1042    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1790  polymorphic membrane protein  38.17 
 
 		 799 aa  248  1e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  32.57 
 
 		 852 aa  204  3e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  35.36 
 
 		 2192 aa  190  5e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1787  polymorphic outer membrane protein  31.74 
 
 		 1332 aa  179  1e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1788  polymorphic membrane protein  31.28 
 
 		 1092 aa  169  8e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  29.42 
 
 		 1296 aa  154  4e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0327  conserved repeat domain protein  28.49 
 
 		 743 aa  146  7.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1035  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1010 aa  125  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0619  Polymorphic membrane protein  28.36 
 
 		 1216 aa  117  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.418961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3798  filamentous hemagglutinin outer membrane protein  33.77 
 
 		 1526 aa  110  6e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0575475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2319  hypothetical protein  37.07 
 
 		 1106 aa  110  6e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.300784  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0005  polymorphic outer membrane protein  28.25 
 
 		 775 aa  106  9e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000710623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3801  Ig family protein  26.97 
 
 		 1170 aa  103  9e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000269985  normal  0.432666 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1921  hypothetical protein  32.34 
 
 		 350 aa  102  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.884061  normal  0.370126 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0821  hypothetical protein  28.93 
 
 		 1055 aa  97.8  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.661621  normal  0.324111 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1920  hypothetical protein  32.05 
 
 		 417 aa  95.5  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.409778 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0726  hypothetical protein  26.88 
 
 		 1263 aa  92  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.434756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0723  hypothetical protein  30.75 
 
 		 1318 aa  91.3  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.661776 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2515  hypothetical protein  29 
 
 		 441 aa  87  8e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3450  hypothetical protein  39.82 
 
 		 5453 aa  73.6  0.000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.119049 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1704  polymorphic outer membrane protein  27.38 
 
 		 1755 aa  68.9  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.041755  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3282  hypothetical protein  37.89 
 
 		 149 aa  56.6  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.290972  hitchhiker  0.000227158 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2043  parallel beta-helix repeat-containing protein  26.69 
 
 		 2031 aa  55.8  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2803  polymorphic outer membrane protein  32.17 
 
 		 527 aa  50.8  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.850053  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0662  parallel beta-helix repeat-containing protein  40.3 
 
 		 500 aa  49.3  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000522571  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2876  parallel beta-helix repeat-containing protein  55.56 
 
 		 512 aa  47.4  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.794955 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1379  hypothetical protein  43.84 
 
 		 443 aa  45.1  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>