100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3801 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3801  Ig family protein  100 
 
 		 1170 aa  2314    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000269985  normal  0.432666 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0619  Polymorphic membrane protein  49.35 
 
 		 1216 aa  573  1e-161  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.418961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0005  polymorphic outer membrane protein  47.44 
 
 		 775 aa  554  1e-156  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000710623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0006  hypothetical protein  51.11 
 
 		 184 aa  186  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000000384761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1790  polymorphic membrane protein  32.33 
 
 		 799 aa  185  4.0000000000000006e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0327  conserved repeat domain protein  34.49 
 
 		 743 aa  184  6e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  34.09 
 
 		 2192 aa  142  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1788  polymorphic membrane protein  33.85 
 
 		 1092 aa  142  4.999999999999999e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1787  polymorphic outer membrane protein  30.2 
 
 		 1332 aa  136  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  27.97 
 
 		 852 aa  130  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1875  polymorphic membrane protein  28.3 
 
 		 507 aa  124  9e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3488  hypothetical protein  31.49 
 
 		 669 aa  87.4  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  28.11 
 
 		 1296 aa  85.1  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0723  hypothetical protein  30.26 
 
 		 1318 aa  82.4  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.661776 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0115  putative hemagglutinin-related protein  33.02 
 
 		 1672 aa  80.9  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0821  hypothetical protein  26.08 
 
 		 1055 aa  80.5  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.661621  normal  0.324111 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3798  filamentous hemagglutinin outer membrane protein  28.69 
 
 		 1526 aa  79  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0575475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  28.47 
 
 		 2713 aa  78.6  0.0000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03554  hemagglutinin-like protein  33.01 
 
 		 1222 aa  77.4  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1642  type 3a cellulose-binding domain protein  40.22 
 
 		 658 aa  77  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.117524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  32.48 
 
 		 991 aa  76.3  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1035  hypothetical protein  31.38 
 
 		 1010 aa  75.1  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3640  outer membrane autotransporter barrel domain protein  36.33 
 
 		 1673 aa  74.7  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2184  immunoglobulin I-set domain-containing protein  30.23 
 
 		 1507 aa  73.9  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2319  hypothetical protein  31.9 
 
 		 1106 aa  72.8  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.300784  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5804  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  43.05 
 
 		 1394 aa  73.2  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.512223  normal  0.443028 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2515  hypothetical protein  29.61 
 
 		 441 aa  71.2  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  36.05 
 
 		 1295 aa  68.6  0.0000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4722  Immunoglobulin V-set domain protein  44.35 
 
 		 994 aa  67.4  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.933088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  29.69 
 
 		 2270 aa  67  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  25.56 
 
 		 3563 aa  66.6  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2043  parallel beta-helix repeat-containing protein  30.11 
 
 		 2031 aa  66.6  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  28.99 
 
 		 3793 aa  65.5  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1921  hypothetical protein  29.27 
 
 		 350 aa  65.5  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.884061  normal  0.370126 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1112  LamG domain-containing protein  41.51 
 
 		 471 aa  65.1  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  35.48 
 
 		 1079 aa  64.3  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5260  hypothetical protein  42.86 
 
 		 1879 aa  63.5  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  36.08 
 
 		 14944 aa  63.2  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0726  hypothetical protein  25.76 
 
 		 1263 aa  61.6  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.434756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1816  Ig family protein  30.63 
 
 		 1626 aa  62  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3316  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.16 
 
 		 692 aa  60.8  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0854  immunoglobulin I-set domain-containing protein  27.72 
 
 		 1607 aa  60.5  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0938  hypothetical protein  27.85 
 
 		 1969 aa  59.3  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1157  rhamnogalacturonan lyase  29.3 
 
 		 1266 aa  56.2  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219501  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2922  hypothetical protein  24.91 
 
 		 1329 aa  56.2  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0297077  normal  0.114251 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1704  polymorphic outer membrane protein  27.13 
 
 		 1755 aa  55.8  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.041755  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  25.73 
 
 		 799 aa  55.5  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  26.6 
 
 		 1657 aa  55.1  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1920  hypothetical protein  29.41 
 
 		 417 aa  54.7  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.409778 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6532  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  32.41 
 
 		 584 aa  54.7  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2314  polymorphic outer membrane protein  33.73 
 
 		 541 aa  54.7  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0981  hypothetical protein  27.07 
 
 		 483 aa  53.9  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0979  hypothetical protein  30.52 
 
 		 6497 aa  53.1  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2831  Ig family protein  46.03 
 
 		 443 aa  53.1  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.901047  normal  0.161271 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4498  Ig family protein  32.65 
 
 		 1232 aa  52.8  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3247  sugar-binding domain protein  32.41 
 
 		 2375 aa  52.8  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0185  Ig family protein  32.99 
 
 		 813 aa  52.8  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0682  putative Ig  44.83 
 
 		 1123 aa  52.8  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.929764  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0188  Ig family protein  42.86 
 
 		 891 aa  52.4  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  28.07 
 
 		 1288 aa  52.4  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3091  Ig family protein  38.46 
 
 		 618 aa  52  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  40.51 
 
 		 1129 aa  51.6  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1240  bifunctional xylanase/esterase; CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein and carbohydrate esterase family 4 protein  26.81 
 
 		 1748 aa  51.6  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267391  normal  0.341436 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1128  hypothetical protein  35.29 
 
 		 3911 aa  51.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  33.94 
 
 		 1362 aa  50.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4934  hypothetical protein  30 
 
 		 774 aa  50.8  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2924  hypothetical protein  23.91 
 
 		 1064 aa  50.4  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000594804  normal  0.19757 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3450  hypothetical protein  25.51 
 
 		 5453 aa  49.7  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.119049 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4920  hypothetical protein  34.23 
 
 		 468 aa  50.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0390615  normal  0.0715167 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1618  immunoglobulin I-set domain-containing protein  40.21 
 
 		 540 aa  49.3  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.490097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1018  thermopsin  25.93 
 
 		 952 aa  49.3  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0978818 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1908  fibronectin, type III  35.53 
 
 		 968 aa  49.3  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0431753 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0638  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45.61 
 
 		 878 aa  48.9  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.167196  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2379  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 11 protein  29.7 
 
 		 1160 aa  48.9  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000600941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  29.69 
 
 		 3324 aa  48.5  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3282  hypothetical protein  32.65 
 
 		 149 aa  47.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.290972  hitchhiker  0.000227158 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5656  Ricin B lectin  31.58 
 
 		 824 aa  47.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0407757  normal  0.559684 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  25.36 
 
 		 1620 aa  47.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  39.78 
 
 		 1750 aa  47  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3714  PKD domain containing protein  26.15 
 
 		 1771 aa  46.6  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333758  normal  0.0659323 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.86 
 
 		 933 aa  46.6  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2661  hypothetical protein  26.84 
 
 		 792 aa  46.6  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247406  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1552  Ig family protein  30.64 
 
 		 1544 aa  46.6  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1362  hypothetical protein  32.19 
 
 		 1023 aa  46.6  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.35 
 
 		 1383 aa  46.2  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2737  Ricin B lectin  30.9 
 
 		 1148 aa  46.2  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285354  normal  0.294912 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2726  polymorphic outer membrane protein  31.75 
 
 		 593 aa  46.2  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0479266  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2405  hypothetical protein  26.29 
 
 		 601 aa  45.8  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000140285  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3329  polymorphic outer membrane protein  26.69 
 
 		 558 aa  45.8  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000300518 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4308  Fibronectin type III domain protein  28.3 
 
 		 1377 aa  45.8  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0936224  hitchhiker  0.00620072 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0292  parallel beta-helix repeat-containing protein  43.55 
 
 		 463 aa  45.8  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  23.8 
 
 		 1287 aa  45.4  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3687  coagulation factor 5/8 type domain protein  36.36 
 
 		 674 aa  45.4  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0980417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4115  hypothetical protein  32.81 
 
 		 2278 aa  45.4  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143212  hitchhiker  0.000960597 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5780  hypothetical protein  27.97 
 
 		 502 aa  45.1  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5691  PKD domain containing protein  27.89 
 
 		 662 aa  45.1  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2313  hypothetical protein  36.27 
 
 		 834 aa  44.7  0.009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000127543  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0743  hypothetical protein  42.62 
 
 		 446 aa  45.1  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0128528  decreased coverage  0.00133596 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  31.19 
 
 		 1130 aa  44.7  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3647  hypothetical protein  33.33 
 
 		 464 aa  44.7  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279677  hitchhiker  0.00645734 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>