39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6532 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6532  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  100 
 
 		 584 aa  1178    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0016  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  47.7 
 
 		 558 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.929015  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0277  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  47.28 
 
 		 469 aa  377  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2276  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  39.57 
 
 		 532 aa  295  1e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000457486  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0353  beta-mannanase  36.23 
 
 		 815 aa  277  4e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.3888  normal  0.500644 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1071  glycoside hydrolase family protein  34.94 
 
 		 728 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.535323  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2811  glycoside hydrolase family protein  36.01 
 
 		 591 aa  241  2e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0752  glycoside hydrolase family 26  35.52 
 
 		 577 aa  240  6.999999999999999e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000240761  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1551  glycoside hydrolase family 26  34.36 
 
 		 583 aa  215  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000398696  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07413  endomannanase (Eurofung)  39.83 
 
 		 355 aa  215  1.9999999999999998e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0032  glycoside hydrolase family protein  32.04 
 
 		 590 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00146021  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03336  conserved hypothetical protein  38.19 
 
 		 315 aa  195  2e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.139072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3691  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  34.68 
 
 		 506 aa  187  7e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000437019  normal  0.102823 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2128  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  31.21 
 
 		 857 aa  180  4.999999999999999e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00114643  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0031  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  33.97 
 
 		 701 aa  178  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0166776 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0629  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  33.64 
 
 		 417 aa  167  4e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.286201  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03326  conserved hypothetical protein  32.92 
 
 		 341 aa  136  9.999999999999999e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3714  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  27.67 
 
 		 506 aa  122  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1626  glycoside hydrolase family protein  35.08 
 
 		 506 aa  114  7.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000010667  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5393  glycoside hydrolase family 26  26.71 
 
 		 342 aa  100  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000752871  normal  0.295957 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0324  cellulose-binding family II protein  31.79 
 
 		 694 aa  99.4  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2043  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  26.42 
 
 		 364 aa  99  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89512  normal  0.955908 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2729  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  29.48 
 
 		 383 aa  98.6  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.737243  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3032  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  26.84 
 
 		 385 aa  97.4  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4957  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  27.27 
 
 		 409 aa  97.1  9e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283853  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0467  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  28.08 
 
 		 380 aa  88.2  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4953  glycoside hydrolase family protein  27.78 
 
 		 376 aa  86.7  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0519766  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2491  glycoside hydrolase family protein  29.32 
 
 		 458 aa  78.6  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2272  glycoside hydrolase family 26  29.13 
 
 		 711 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.738347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3531  glycoside hydrolase family 26  29.13 
 
 		 313 aa  70.1  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4674  glycoside hydrolase family 5  33.62 
 
 		 443 aa  64.7  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1642  type 3a cellulose-binding domain protein  35 
 
 		 658 aa  60.1  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.117524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3801  Ig family protein  32.41 
 
 		 1170 aa  55.1  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000269985  normal  0.432666 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3193  glycoside hydrolase family 26  27.03 
 
 		 519 aa  49.3  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000819014 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4187  Beta-mannanase-like protein  26.15 
 
 		 334 aa  48.5  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3203  hypothetical protein  29.61 
 
 		 367 aa  47.8  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3259  glycoside hydrolase family protein  27.4 
 
 		 330 aa  47.4  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1096  hypothetical protein  26.32 
 
 		 533 aa  47  0.0009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4471  beta-mannanase-like protein  30.93 
 
 		 407 aa  44.3  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0091653 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>