49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3714 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3714  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  100 
 
 		 506 aa  1044    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5393  glycoside hydrolase family 26  36.64 
 
 		 342 aa  196  9e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000752871  normal  0.295957 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0752  glycoside hydrolase family 26  31.82 
 
 		 577 aa  147  3e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000240761  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0277  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  30.37 
 
 		 469 aa  148  3e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2811  glycoside hydrolase family protein  32.47 
 
 		 591 aa  144  4e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0031  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  28.29 
 
 		 701 aa  127  4.0000000000000003e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0166776 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2276  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  29.9 
 
 		 532 aa  126  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000457486  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3691  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  29.47 
 
 		 506 aa  122  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000437019  normal  0.102823 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6532  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  27.67 
 
 		 584 aa  122  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0016  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  29.63 
 
 		 558 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.929015  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07413  endomannanase (Eurofung)  30.18 
 
 		 355 aa  114  3e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0353  beta-mannanase  27.3 
 
 		 815 aa  114  3e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.3888  normal  0.500644 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1071  glycoside hydrolase family protein  28.93 
 
 		 728 aa  113  8.000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.535323  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03336  conserved hypothetical protein  28.44 
 
 		 315 aa  113  9e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.139072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0324  cellulose-binding family II protein  31.39 
 
 		 694 aa  107  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0032  glycoside hydrolase family protein  25.73 
 
 		 590 aa  100  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00146021  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1626  glycoside hydrolase family protein  36.36 
 
 		 506 aa  100  8e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000010667  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4957  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  26.44 
 
 		 409 aa  99.8  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283853  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0467  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  30.18 
 
 		 380 aa  98.2  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2272  glycoside hydrolase family 26  31.6 
 
 		 711 aa  97.1  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.738347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0629  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  25.81 
 
 		 417 aa  95.9  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.286201  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3032  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  25.82 
 
 		 385 aa  92.4  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3531  glycoside hydrolase family 26  30.55 
 
 		 313 aa  92  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4953  glycoside hydrolase family protein  27.54 
 
 		 376 aa  85.1  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0519766  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2043  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  24.83 
 
 		 364 aa  82.8  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89512  normal  0.955908 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2729  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  24.76 
 
 		 383 aa  80.1  0.00000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.737243  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2128  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  22.01 
 
 		 857 aa  79.7  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00114643  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1551  glycoside hydrolase family 26  23.35 
 
 		 583 aa  76.3  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000398696  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2491  glycoside hydrolase family protein  26.34 
 
 		 458 aa  63.9  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0980  glycoside hydrolase family 26  31.61 
 
 		 409 aa  61.6  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268802 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1162  putative endoglucanase  27.22 
 
 		 520 aa  58.9  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3259  glycoside hydrolase family protein  31.43 
 
 		 330 aa  58.2  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3193  glycoside hydrolase family 26  24.34 
 
 		 519 aa  56.2  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000819014 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4471  beta-mannanase-like protein  38.71 
 
 		 407 aa  55.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0091653 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03326  conserved hypothetical protein  26.85 
 
 		 341 aa  54.3  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3168  cellulose-binding family II  29.71 
 
 		 490 aa  53.5  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0614934 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2956  beta-mannanase-like protein  29.58 
 
 		 415 aa  53.1  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1096  hypothetical protein  33.33 
 
 		 533 aa  53.5  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4187  Beta-mannanase-like protein  26.67 
 
 		 334 aa  52.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1311  Beta-mannanase  32.5 
 
 		 348 aa  53.5  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0780804 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0871  Beta-mannanase-like protein  29.03 
 
 		 442 aa  50.4  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3203  hypothetical protein  24.26 
 
 		 367 aa  50.1  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1756  hypothetical protein  30.33 
 
 		 358 aa  48.9  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0425875 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0392  endoglucanase family protein  29.29 
 
 		 285 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.564061 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0404  endoglucanase family protein  29.29 
 
 		 300 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0413  endoglucanase family protein  29.29 
 
 		 285 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  23.58 
 
 		 900 aa  47.4  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1517  endoglucanase  31.91 
 
 		 375 aa  44.3  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.966231 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2514  hypothetical protein  26.06 
 
 		 183 aa  43.5  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>